EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPREG00000020796 (Gene tree)
Gene ID: 103469967
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12390 bases
Position: chrLG1:26460753-26473142
Accession: 103469967
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000030733	CRM1_C	PF08767.11	6.4e-131	1	1
ENSPREP00000030733	Xpo1	PF08389.12	9.5e-42	1	1
ENSPREP00000030733	IBN_N	PF03810.19	7.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000031082	-	3209	XM_008418059	ENSPREP00000030733	1066 (aa)	XP_008416281	UPI0004A496FC

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pret03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.624	ENSPREG00000010135	-	100	92.624

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSG00000082898	XPO1	100	91.036	Homo_sapiens
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	96.043	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	96.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.810	ENSAPOG00000004984	-	100	92.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.698	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	91.698	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	97.968	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.968	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	93.723	ENSACIG00000010818	-	100	93.723	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.124	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	98.124	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSAOCG00000010121	-	100	92.717	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000020796	xpo1a	91	98.344	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	98.344	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSAPEG00000007038	-	100	92.717	Amphiprion_percula
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSATEG00000008816	-	100	92.717	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	97.749	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	97.749	Anabas_testudineus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.063	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	92.063	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.063	ENSACAG00000002501	XPO1	100	92.063	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSANAG00000020802	XPO1	100	91.036	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	98.289	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.289	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.624	ENSACLG00000015192	-	100	92.624	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	93.432	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.432	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.091	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	93.091	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	91.783	Bos_taurus
ENSPREG00000020796	xpo1a	98	52.166	WBGene00002078	xpo-1	98	52.166	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.036	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	91.783	Canis_familiaris
ENSPREG00000020796	xpo1a	93	92.285	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	92.285	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	91.783	Capra_hircus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	91.783	Carlito_syrichta
ENSPREG00000020796	xpo1a	53	88.298	ENSCAPG00000006454	-	100	88.298	Cavia_aperea
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.383	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	90.383	Cavia_porcellus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	73.840	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.026	Cebus_capucinus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	89.292	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.915	Cercocebus_atys
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.597	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.597	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.036	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000020796	xpo1a	83	92.996	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.996	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.063	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	92.063	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000020796	xpo1a	99	80.264	ENSCING00000024562	-	99	80.264	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000020796	xpo1a	99	78.745	ENSCSAVG00000005965	-	99	78.745	Ciona_savignyi
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	87.208	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	92.766	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.766	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.530	ENSCVAG00000016788	-	100	92.530	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.499	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	98.499	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.277	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	93.277	Danio_rerio
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.371	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.201	Danio_rerio
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.877	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	91.877	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000020796	xpo1a	91	88.914	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.914	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000020796	xpo1a	99	69.332	FBgn0020497	emb	99	69.332	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000020796	xpo1a	94	90.959	ENSETEG00000018045	XPO1	94	90.959	Echinops_telfairi
ENSPREG00000020796	xpo1a	90	78.216	ENSEBUG00000012580	-	100	86.469	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSEASG00005007223	XPO1	100	91.783	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	Equus_caballus
ENSPREG00000020796	xpo1a	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPREG00000020796	xpo1a	87	90.471	ENSELUG00000014306	-	99	90.471	Esox_lucius
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	95.117	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.117	Esox_lucius
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	91.783	Felis_catus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.877	ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.877	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.196	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	90.196	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.593	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	98.593	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	87.021	ENSGMOG00000019063	-	100	87.021	Gadus_morhua
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	94.559	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.559	Gadus_morhua
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.063	ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.063	Gallus_gallus
ENSPREG00000020796	xpo1a	91	93.203	ENSGAFG00000003355	-	98	93.203	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	99.786	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.786	Gambusia_affinis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	97.373	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.373	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSGACG00000002743	-	100	92.717	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.970	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.970	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	91.036	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.124	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	98.124	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSHBUG00000020037	-	100	92.717	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.503	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	91.503	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.503	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	91.503	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	92.447	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.447	Hippocampus_comes
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.838	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.838	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.184	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	93.184	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.597	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.597	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.597	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	91.597	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.437	ENSKMAG00000016218	-	100	92.437	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.968	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	98.968	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	95.421	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.421	Labrus_bergylta
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSLBEG00000005740	-	100	92.717	Labrus_bergylta
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	71.521	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.521	Latimeria_chalumnae
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	93.091	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	93.091	Lepisosteus_oculatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.690	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	91.690	Loxodonta_africana
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	91.036	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	91.036	Macaca_mulatta
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	91.036	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	89.302	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	89.302	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	97.655	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	97.655	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.717	ENSMAMG00000010568	-	100	92.717	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	92.624	ENSMZEG00005018158	-	98	93.203	Maylandia_zebra
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	98.124	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	98.124	Maylandia_zebra
ENSPREG00000020796	xpo1a	68	92.149	ENSMGAG00000001496	-	100	92.149	Meleagris_gallopavo
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.943	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	90.943	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSMICG00000027770	XPO1	100	91.783	Microcebus_murinus
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.036	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	91.036	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000020796	xpo1a	88	98.396	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.396	Mola_mola
ENSPREG00000020796	xpo1a	87	93.703	ENSMMOG00000008001	-	99	93.703	Mola_mola
ENSPREG00000020796	xpo1a	100	90.943	ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.943	Monodelphis_domestica
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ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.783	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	91.783	Mustela_putorius_furo
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