EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPREG00000023071 (Gene tree)
Gene ID: 103481372
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_reticulata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10737 bases
Position: chrLG19:8556783-8567519
Accession: 103481372
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPREP00000034062	eRF1_2	PF03464.15	1.8e-34	1	1
ENSPREP00000034062	eRF1_3	PF03465.15	1.5e-25	1	1
ENSPREP00000034062	eRF1_1	PF03463.15	1.1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPRET00000034442	-	4695	XM_008436774	ENSPREP00000034062	385 (aa)	XP_008434996	UPI0004A4C2F8

Gene Model

Click here to download ENSPREG00000023071's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pret03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPREG00000023071's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSG00000152684	PELO	100	81.558	Homo_sapiens
ENSPREG00000023071	pelo	64	92.713	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000023071	pelo	100	92.468	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000023071	pelo	64	92.713	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPREG00000023071	pelo	97	89.276	ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	Amphilophus_citrinellus
ENSPREG00000023071	pelo	100	92.727	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.727	Amphiprion_ocellaris
ENSPREG00000023071	pelo	100	92.727	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.727	Amphiprion_percula
ENSPREG00000023071	pelo	100	94.026	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	Anabas_testudineus
ENSPREG00000023071	pelo	77	73.154	ENSAPLG00000013265	PELO	100	73.154	Anas_platyrhynchos
ENSPREG00000023071	pelo	97	80.800	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.260	Anolis_carolinensis
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSPREG00000023071	pelo	97	92.493	ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.169	Astyanax_mexicanus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	Bos_taurus
ENSPREG00000023071	pelo	99	61.417	WBGene00011280	pelo-1	100	61.417	Caenorhabditis_elegans
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	Callithrix_jacchus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	Canis_lupus_dingo
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.299	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	Capra_hircus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.338	Carlito_syrichta
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	Cavia_porcellus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	Chinchilla_lanigera
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.338	Choloepus_hoffmanni
ENSPREG00000023071	pelo	97	81.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSPREG00000023071	pelo	97	64.879	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSPREG00000023071	pelo	100	67.013	ENSCSAVG00000006158	-	100	67.013	Ciona_savignyi
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPREG00000023071	pelo	97	82.306	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPREG00000023071	pelo	97	83.110	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.117	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSPREG00000023071	pelo	100	98.701	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.701	Cyprinodon_variegatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	88.571	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	Danio_rerio
ENSPREG00000023071	pelo	100	78.756	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.756	Dasypus_novemcinctus
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.636	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.636	Dipodomys_ordii
ENSPREG00000023071	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	96	68.074	Drosophila_melanogaster
ENSPREG00000023071	pelo	71	80.117	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	Eptatretus_burgeri
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSEASG00005013348	PELO	100	82.078	Equus_asinus_asinus
ENSPREG00000023071	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSFCAG00000032341	PELO	100	82.078	Felis_catus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	Ficedula_albicollis
ENSPREG00000023071	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSPREG00000023071	pelo	100	96.623	ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.623	Fundulus_heteroclitus
ENSPREG00000023071	pelo	98	88.594	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.312	Gadus_morhua
ENSPREG00000023071	pelo	100	98.442	ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.442	Gambusia_affinis
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.169	Gasterosteus_aculeatus
ENSPREG00000023071	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	Gopherus_agassizii
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	Haplochromis_burtoni
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.597	ENSHGLG00000005932	PELO	100	82.597	Heterocephalus_glaber_female
ENSPREG00000023071	pelo	100	80.519	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_male
ENSPREG00000023071	pelo	100	89.351	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.351	Hippocampus_comes
ENSPREG00000023071	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	80.260	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	80.260	Jaculus_jaculus
ENSPREG00000023071	pelo	100	94.286	ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.286	Kryptolebias_marmoratus
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.169	Labrus_bergylta
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSLAFG00000020551	PELO	100	82.338	Loxodonta_africana
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.818	Macaca_fascicularis
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.818	Macaca_mulatta
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.818	Macaca_nemestrina
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSPREG00000023071	pelo	97	95.174	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.545	Mastacembelus_armatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.169	Maylandia_zebra
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	83.117	Mesocricetus_auratus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSMICG00000044040	PELO	100	82.078	Microcebus_murinus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.857	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	82.857	Microtus_ochrogaster
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.429	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.429	Mola_mola
ENSPREG00000023071	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	83.117	Mus_caroli
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	83.117	Mus_musculus
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.377	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	83.377	Mus_pahari
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	83.117	Mus_spretus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.299	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.299	Myotis_lucifugus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.857	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.857	Nannospalax_galili
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	Neolamprologus_brichardi
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.818	Nomascus_leucogenys
ENSPREG00000023071	pelo	100	80.000	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.000	Notamacropus_eugenii
ENSPREG00000023071	pelo	98	81.530	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.530	Ochotona_princeps
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.117	ENSODEG00000017579	PELO	100	83.117	Octodon_degus
ENSPREG00000023071	pelo	96	91.914	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.948	Oreochromis_niloticus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.429	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.429	Oryzias_latipes
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hni
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	ENSORLG00015014447	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes_hsok
ENSPREG00000023071	pelo	100	93.506	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.506	Oryzias_melastigma
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.818	Otolemur_garnettii
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.558	Ovis_aries
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.818	Pan_paniscus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSPPRG00000018800	PELO	100	82.078	Panthera_pardus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	Panthera_tigris_altaica
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	Pan_troglodytes
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.818	Papio_anubis
ENSPREG00000023071	pelo	100	88.831	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPREG00000023071	pelo	97	81.333	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	Pelodiscus_sinensis
ENSPREG00000023071	pelo	67	89.535	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.535	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.857	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.857	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.558	Phascolarctos_cinereus
ENSPREG00000023071	pelo	100	99.740	ENSPFOG00000007277	pelo	100	99.740	Poecilia_formosa
ENSPREG00000023071	pelo	100	100.000	ENSPLAG00000020787	pelo	100	100.000	Poecilia_latipinna
ENSPREG00000023071	pelo	100	99.740	ENSPMEG00000016964	pelo	100	99.740	Poecilia_mexicana
ENSPREG00000023071	pelo	97	81.769	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.818	Pongo_abelii
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSPCOG00000021178	PELO	100	82.078	Propithecus_coquereli
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	ENSPNYG00000017325	pelo	100	91.169	Pundamilia_nyererei
ENSPREG00000023071	pelo	97	92.761	ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.429	Pygocentrus_nattereri
ENSPREG00000023071	pelo	100	83.636	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	83.636	Rattus_norvegicus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_bieti
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_roxellana
ENSPREG00000023071	pelo	98	32.727	YNL001W	-	98	32.727	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.299	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.299	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPREG00000023071	pelo	63	77.459	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	Sarcophilus_harrisii
ENSPREG00000023071	pelo	98	89.390	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	Scleropages_formosus
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.688	Scophthalmus_maximus
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	Seriola_dumerili
ENSPREG00000023071	pelo	100	87.792	ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.792	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPREG00000023071	pelo	97	81.067	ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	Sphenodon_punctatus
ENSPREG00000023071	pelo	98	92.573	ENSSPAG00000008501	pelo	100	92.208	Stegastes_partitus
ENSPREG00000023071	pelo	100	80.260	ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	Sus_scrofa
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.597	ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.597	Taeniopygia_guttata
ENSPREG00000023071	pelo	100	90.390	ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.390	Takifugu_rubripes
ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.688	Tetraodon_nigroviridis
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	ENSTTRG00000001857	PELO	100	81.558	Tursiops_truncatus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSUAMG00000002535	PELO	100	82.338	Ursus_americanus
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	ENSUMAG00000005809	PELO	100	82.338	Ursus_maritimus
ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	ENSVPAG00000001113	PELO	100	81.818	Vicugna_pacos
ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	ENSVVUG00000025499	PELO	100	82.078	Vulpes_vulpes
ENSPREG00000023071	pelo	81	77.097	ENSXETG00000018368	pelo	100	75.460	Xenopus_tropicalis
ENSPREG00000023071	pelo	100	99.221	ENSXMAG00000018474	pelo	100	99.221	Xiphophorus_maculatus