EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000002913 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: OVOL1
Alias: -
Full Name: ovo like transcriptional repressor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11316 bases
Position: chrJH210532.1:841142-852457
Accession: 8525
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000003015	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-14	1	3
ENSPSIP00000003015	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-14	2	3
ENSPSIP00000003015	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-14	3	3
ENSPSIP00000003015	zf-met	PF12874.7	1.7e-05	1	2
ENSPSIP00000003015	zf-met	PF12874.7	1.7e-05	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000003027	OVOL1-201	1544	-	ENSPSIP00000003015	264 (aa)	-	K7F4Q5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000002913	OVOL1	56	37.037	ENSPSIG00000015465	-	72	37.037
ENSPSIG00000002913	OVOL1	51	37.815	ENSPSIG00000000333	-	68	37.815
ENSPSIG00000002913	OVOL1	58	39.560	ENSPSIG00000016380	-	69	39.560
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	37.864	ENSPSIG00000004303	ZNF319	68	37.864
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	40.206	ENSPSIG00000015459	-	63	40.206
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	37.391	ENSPSIG00000009893	-	58	37.391
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	42.697	ENSPSIG00000008588	-	99	42.697
ENSPSIG00000002913	OVOL1	61	35.514	ENSPSIG00000010405	-	94	35.514
ENSPSIG00000002913	OVOL1	52	39.450	ENSPSIG00000001026	-	85	39.450
ENSPSIG00000002913	OVOL1	66	40.698	ENSPSIG00000000760	-	66	40.698
ENSPSIG00000002913	OVOL1	59	41.892	ENSPSIG00000003152	-	67	41.892
ENSPSIG00000002913	OVOL1	52	42.373	ENSPSIG00000002569	-	69	42.373
ENSPSIG00000002913	OVOL1	58	40.244	ENSPSIG00000009650	-	61	40.244
ENSPSIG00000002913	OVOL1	52	39.560	ENSPSIG00000013021	-	74	39.560
ENSPSIG00000002913	OVOL1	54	34.513	ENSPSIG00000000522	-	69	34.513
ENSPSIG00000002913	OVOL1	52	35.593	ENSPSIG00000012650	-	69	35.294
ENSPSIG00000002913	OVOL1	75	40.909	ENSPSIG00000016033	-	53	40.909
ENSPSIG00000002913	OVOL1	59	36.697	ENSPSIG00000004502	-	57	36.697
ENSPSIG00000002913	OVOL1	58	39.496	ENSPSIG00000005128	-	99	39.496
ENSPSIG00000002913	OVOL1	57	35.398	ENSPSIG00000006790	-	78	35.398
ENSPSIG00000002913	OVOL1	69	41.525	ENSPSIG00000004647	-	50	41.525
ENSPSIG00000002913	OVOL1	53	44.118	ENSPSIG00000005603	-	56	44.118
ENSPSIG00000002913	OVOL1	78	36.905	ENSPSIG00000006603	ZBTB16	55	36.905
ENSPSIG00000002913	OVOL1	62	36.364	ENSPSIG00000010248	-	67	36.364
ENSPSIG00000002913	OVOL1	72	58.333	ENSPSIG00000006768	OVOL2	87	55.450
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	42.647	ENSPSIG00000012865	-	67	42.647
ENSPSIG00000002913	OVOL1	68	38.298	ENSPSIG00000009270	-	62	38.298
ENSPSIG00000002913	OVOL1	55	36.111	ENSPSIG00000009603	-	95	34.615
ENSPSIG00000002913	OVOL1	64	37.288	ENSPSIG00000004614	-	83	37.288
ENSPSIG00000002913	OVOL1	75	39.091	ENSPSIG00000016247	-	59	39.091
ENSPSIG00000002913	OVOL1	54	34.615	ENSPSIG00000005672	-	60	34.615

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.748	ENSG00000172818	OVOL1	95	70.769	Homo_sapiens
ENSPSIG00000002913	OVOL1	73	67.961	ENSCLAG00000016426	OVOL1	69	67.961	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	81.818	ENSCPBG00000023411	OVOL1	96	81.818	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000002913	OVOL1	73	74.272	ENSDNOG00000024062	OVOL1	84	74.272	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	65.108	ENSDORG00000028510	Ovol1	96	65.108	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000002913	OVOL1	57	79.470	ENSEEUG00000010161	OVOL1	94	79.470	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	81.061	ENSGAGG00000008199	OVOL1	96	81.061	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	65.108	ENSJJAG00000024400	Ovol1	96	65.108	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.260	MGP_CAROLIEiJ_G0022558	Ovol1	96	64.260	Mus_caroli
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.260	ENSMUSG00000024922	Ovol1	96	64.260	Mus_musculus
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	63.177	MGP_PahariEiJ_G0014055	Ovol1	96	63.177	Mus_pahari
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.260	MGP_SPRETEiJ_G0023472	Ovol1	96	64.260	Mus_spretus
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.388	ENSOGAG00000016496	OVOL1	96	64.388	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.982	ENSRNOG00000020669	Ovol1	96	64.982	Rattus_norvegicus