EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000004505 (Gene tree)
Gene ID: 102446392
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36894 bases
Position: chrJH204958.1:111265-148158
Accession: 102446392
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000004853	GTP_EFTU	PF00009.27	7.8e-45	1	1
ENSPSIP00000004853	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSPSIP00000004853	EFG_IV	PF03764.18	2.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000004880	EFTUD2-201	3160	XM_006110546	ENSPSIP00000004853	913 (aa)	XP_006110608	K7F9Z3

Gene Model

Click here to download ENSPSIG00000004505's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPSIG00000004505's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	83	37.624	ENSPSIG00000007790	EFL1	86	37.624
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	87	38.788	ENSPSIG00000011176	EEF2	94	45.161

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	ENSG00000108883	EFTUD2	100	96.622	Homo_sapiens
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSAPOG00000002433	eftud2	93	90.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	93	97.354	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	86.659	ENSACIG00000009096	eftud2	93	86.439	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	85.478	ENSAOCG00000023385	eftud2	92	85.478	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSAPEG00000003321	eftud2	93	90.077	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.628	ENSATEG00000000457	eftud2	93	90.408	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	93.488	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	93	93.488	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSACAG00000007637	EFTUD2	93	96.803	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSANAG00000025320	EFTUD2	93	97.133	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSACLG00000001296	eftud2	93	90.187	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.693	ENSAMXG00000000568	eftud2	93	89.474	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	93	97.133	Bos_taurus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	67.728	WBGene00001166	eftu-2	93	67.728	Caenorhabditis_elegans
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	93	97.133	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	93	97.354	Canis_familiaris
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	93	97.354	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	93	97.133	Capra_hircus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	93	96.692	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	93	96.692	Cavia_aperea
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	93	96.692	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	93	97.133	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCATG00000035809	EFTUD2	93	97.133	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	93	96.582	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	93	97.133	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	94	83.958	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	83.958	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	98.236	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	93	98.236	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	75.604	ENSCING00000009372	-	93	75.519	Ciona_intestinalis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	76.387	ENSCSAVG00000004985	-	95	78.598	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSCANG00000026557	EFTUD2	93	97.133	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSCGRG00001009904	Eftud2	93	96.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSCGRG00000003825	Eftud2	93	96.803	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.746	ENSCSEG00000016775	eftud2	93	89.526	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSCVAG00000012537	eftud2	93	90.077	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	88.864	ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.450	Danio_rerio
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	93	96.803	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.913	ENSDORG00000011566	Eftud2	93	96.913	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	72.967	FBgn0039566	CG4849	93	72.857	Drosophila_melanogaster
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	90	98.276	ENSETEG00000005678	EFTUD2	85	98.276	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	74	90.968	ENSEBUG00000004047	-	89	85.736	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSEASG00005010321	EFTUD2	93	97.354	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSECAG00000019363	EFTUD2	86	97.354	Equus_caballus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	81	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	84	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.195	ENSELUG00000017169	eftud2	93	89.526	Esox_lucius
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	93	97.244	Felis_catus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.464	ENSFALG00000007551	EFTUD2	93	97.464	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	93	97.133	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSFHEG00000013479	eftud2	93	89.967	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.305	ENSGMOG00000014277	eftud2	93	89.636	Gadus_morhua
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.574	ENSGALG00000000988	EFTUD2	93	97.798	Gallus_gallus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSGAFG00000002263	eftud2	93	90.187	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.857	ENSGACG00000009163	eftud2	93	89.416	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	93	97.133	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSHBUG00000023546	eftud2	95	90.077	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	93	96.803	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	93	96.803	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.195	ENSHCOG00000017689	eftud2	93	89.195	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.305	ENSIPUG00000023182	Eftud2	93	89.967	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.628	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	90.628	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	95	97.015	ENSJJAG00000018268	Eftud2	93	97.015	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.628	ENSKMAG00000021027	eftud2	93	90.187	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSLBEG00000005875	eftud2	97	89.857	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	92.944	ENSLACG00000012918	EFTUD2	93	93.502	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.628	ENSLOCG00000011460	eftud2	93	90.959	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	93	96.582	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	93	97.133	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	93	97.133	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	93	97.133	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	93	97.133	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSMAMG00000022190	eftud2	94	90.187	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSMZEG00005022885	eftud2	93	90.187	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.580	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	93	97.580	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSMAUG00000021178	Eftud2	93	96.803	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSMICG00000016592	EFTUD2	93	97.133	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.913	ENSMOCG00000009039	-	93	96.913	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	98	79.596	ENSMOCG00000017653	-	90	79.596	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	91.720	ENSMMOG00000020811	eftud2	92	91.720	Mola_mola
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSMODG00000011347	EFTUD2	93	97.354	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	89.936	ENSMALG00000014501	eftud2	92	89.936	Monopterus_albus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	93	96.582	Mus_caroli
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	ENSMUSG00000020929	Eftud2	93	96.582	Mus_musculus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	93	96.582	Mus_pahari
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	93	96.582	Mus_spretus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	87	97.244	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	93	97.354	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.023	ENSNGAG00000017834	Eftud2	93	97.023	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSNBRG00000020081	eftud2	93	90.077	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	95.259	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	95.259	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	97.354	Notamacropus_eugenii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	88.313	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	93	88.313	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	92	77.179	ENSODEG00000003385	-	92	77.179	Octodon_degus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.141	ENSODEG00000018041	-	93	96.141	Octodon_degus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSONIG00000000912	eftud2	93	90.187	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	93	97.133	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.636	ENSORLG00000003109	eftud2	93	89.636	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.526	ENSORLG00020009865	eftud2	93	89.526	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.526	ENSORLG00015002611	eftud2	93	91.325	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	94.708	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	93	94.708	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSOARG00000009078	EFTUD2	91	97.133	Ovis_aries
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	93	97.244	Pan_paniscus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	93	97.354	Panthera_pardus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	93	97.354	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	93	97.244	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSPANG00000021284	EFTUD2	93	97.133	Papio_anubis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	82.359	ENSPMGG00000007281	eftud2	97	81.698	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	ENSPEMG00000005129	Eftud2	93	96.803	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	93	97.354	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSPFOG00000008515	eftud2	93	90.187	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSPLAG00000010393	eftud2	93	90.187	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSPMEG00000005087	eftud2	93	90.187	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	95.590	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	93	95.590	Pongo_abelii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	96.582	Procavia_capensis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	93	97.133	Propithecus_coquereli
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	92.393	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	93	92.393	Pteropus_vampyrus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSPNYG00000012448	eftud2	93	90.187	Pundamilia_nyererei
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.967	ENSPNAG00000012490	eftud2	93	90.408	Pygocentrus_nattereri
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	ENSRNOG00000002818	Eftud2	93	96.692	Rattus_norvegicus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.023	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	93	97.023	Rhinopithecus_bieti
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.023	ENSRROG00000042925	EFTUD2	93	97.023	Rhinopithecus_roxellana
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	32.686	YKL173W	SNU114	93	32.344	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	93	97.133	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	96	97.365	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	93	97.365	Sarcophilus_harrisii
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.526	ENSSFOG00015023272	eftud2	93	89.636	Scleropages_formosus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.967	ENSSMAG00000010174	eftud2	93	89.746	Scophthalmus_maximus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	ENSSDUG00000022675	eftud2	93	90.077	Seriola_dumerili
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSSLDG00000001595	eftud2	93	90.187	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	87.982	ENSSARG00000008664	EFTUD2	93	87.982	Sorex_araneus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.362	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	93	96.362	Sphenodon_punctatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSSPAG00000016235	eftud2	92	90.187	Stegastes_partitus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	93	97.133	Sus_scrofa
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	90	96.723	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.723	Taeniopygia_guttata
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.746	ENSTRUG00000016422	eftud2	93	89.526	Takifugu_rubripes
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	84.742	ENSTNIG00000005346	eftud2	93	84.523	Tetraodon_nigroviridis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	93	100.000	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	100.000	Tupaia_belangeri
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	87.762	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	93	87.762	Tursiops_truncatus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.150	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	93	96.150	Ursus_americanus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	93	97.354	Ursus_maritimus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	89.682	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	81	89.682	Vicugna_pacos
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	93	97.354	Vulpes_vulpes
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	96	93.585	ENSXETG00000003394	eftud2	91	94.731	Xenopus_tropicalis
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	86	92.122	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	92.122	Xiphophorus_couchianus
ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	ENSXMAG00000008494	eftud2	93	90.187	Xiphophorus_maculatus