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Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000004971 (Gene tree)
Gene ID: 102452301
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3852 bases
Position: chrJH224682.1:7423973-7427824
Accession: 102452301
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000005334	eRF1_2	PF03464.15	1.4e-36	1	1
ENSPSIP00000005334	eRF1_3	PF03465.15	6.5e-26	1	1
ENSPSIP00000005334	eRF1_1	PF03463.15	6.7e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000005365	PELO-201	2735	XM_006139525	ENSPSIP00000005334	385 (aa)	XP_006139587	K7FBC4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSG00000152684	PELO	98	93.085	Homo_sapiens
ENSPSIG00000004971	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000023700	-	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.267	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000004971	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000000616	pelo	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSAMEG00000007734	PELO	98	93.617	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000004971	PELO	97	75.335	ENSACIG00000014386	pelo	97	79.290	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.000	ENSAOCG00000023717	pelo	97	80.533	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.000	ENSAPEG00000011235	pelo	97	80.533	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSATEG00000019550	pelo	97	81.067	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000004971	PELO	77	86.913	ENSAPLG00000013265	PELO	97	86.851	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000004971	PELO	98	91.223	ENSACAG00000004352	PELO	98	91.223	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.506	ENSANAG00000014096	PELO	98	93.883	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	ENSACLG00000010305	pelo	97	79.733	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000004971	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.800	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.351	Bos_taurus
ENSPSIG00000004971	PELO	98	58.511	WBGene00011280	pelo-1	99	58.511	Caenorhabditis_elegans
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSCJAG00000035190	PELO	98	93.617	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSCAFG00020023234	PELO	98	93.617	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.085	Capra_hircus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSTSYG00000005203	PELO	98	93.085	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.506	ENSCPOG00000027406	PELO	98	93.883	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSCCAG00000035600	PELO	98	93.617	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSCATG00000011829	PELO	98	93.351	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.351	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.351	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.468	ENSCHOG00000000523	PELO	98	92.819	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000004971	PELO	100	98.701	ENSCPBG00000007544	PELO	100	98.701	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000004971	PELO	97	68.633	ENSCING00000001979	-	98	68.800	Ciona_intestinalis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	69.351	ENSCSAVG00000006158	-	98	69.600	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSCANG00000023382	PELO	98	93.351	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000004971	PELO	97	91.421	ENSCGRG00001024665	Pelo	98	91.489	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000004971	PELO	97	92.761	ENSCGRG00000004570	Pelo	98	92.819	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000004971	PELO	100	78.701	ENSCSEG00000008807	pelo	97	78.933	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.039	ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.600	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.299	ENSDARG00000055477	pelo	97	81.600	Danio_rerio
ENSPSIG00000004971	PELO	100	89.637	ENSDNOG00000036721	PELO	98	89.920	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.617	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000004971	PELO	96	67.297	FBgn0011207	pelo	95	66.933	Drosophila_melanogaster
ENSPSIG00000004971	PELO	71	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	95	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSEASG00005013348	PELO	98	93.085	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	ENSELUG00000023229	pelo	98	80.563	Esox_lucius
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSFCAG00000032341	PELO	98	93.085	Felis_catus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	96.364	ENSFALG00000004559	PELO	100	96.364	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000004971	PELO	74	94.014	ENSFDAG00000002076	PELO	88	94.014	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.267	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000004971	PELO	98	78.515	ENSGMOG00000005849	pelo	97	78.667	Gadus_morhua
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.000	ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.800	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	97	81.868	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	98.182	ENSGAGG00000004018	PELO	100	98.182	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSGGOG00000012635	PELO	98	93.351	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	ENSHBUG00000005866	pelo	97	79.733	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSHGLG00000005932	PELO	98	93.085	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000004971	PELO	100	90.390	ENSHGLG00100017627	PELO	98	90.691	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000004971	PELO	100	77.403	ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.867	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.481	ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.733	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSSTOG00000027378	PELO	98	93.617	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	90.649	ENSJJAG00000015032	Pelo	98	90.957	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.519	ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.067	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000004971	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	98	81.067	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSLAFG00000020551	PELO	98	93.351	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSMFAG00000000651	PELO	98	93.351	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSMMUG00000039101	PELO	98	93.351	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSMNEG00000035538	PELO	98	93.351	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSMLEG00000039113	PELO	98	93.351	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000004971	PELO	97	81.769	ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.600	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	ENSMZEG00005014258	pelo	97	79.733	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.208	ENSMAUG00000009770	Pelo	98	92.553	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSMICG00000044040	PELO	98	93.617	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.468	ENSMOCG00000017554	Pelo	98	92.819	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000004971	PELO	100	78.701	ENSMMOG00000001324	pelo	97	79.733	Mola_mola
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	ENSMALG00000008194	pelo	97	80.533	Monopterus_albus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	93.351	Mus_caroli
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSMUSG00000042275	Pelo	98	93.351	Mus_musculus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	98	93.617	Mus_pahari
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	98	93.351	Mus_spretus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	90.649	ENSMLUG00000024132	PELO	98	90.957	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSNGAG00000019331	Pelo	98	93.085	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	ENSNBRG00000011799	pelo	97	79.733	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSNLEG00000035970	PELO	98	93.351	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.468	ENSMEUG00000005468	PELO	98	92.819	Notamacropus_eugenii
ENSPSIG00000004971	PELO	98	91.821	ENSOPRG00000018793	PELO	99	92.287	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000004971	PELO	100	94.026	ENSODEG00000017579	PELO	98	94.415	Octodon_degus
ENSPSIG00000004971	PELO	96	79.245	ENSONIG00000011511	pelo	97	79.467	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.351	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	97	81.333	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	97	82.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000004971	PELO	100	82.597	ENSOMEG00000021567	pelo	97	82.933	Oryzias_melastigma
ENSPSIG00000004971	PELO	100	94.026	ENSOGAG00000027940	PELO	98	94.415	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSOARG00000008324	PELO	97	93.351	Ovis_aries
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSPPAG00000038951	PELO	98	93.351	Pan_paniscus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSPPRG00000018800	PELO	98	93.085	Panthera_pardus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.085	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.351	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSPANG00000010902	PELO	98	93.351	Papio_anubis
ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.558	ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.400	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPSIG00000004971	PELO	67	75.969	ENSPMGG00000014561	pelo	95	75.969	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.208	ENSPEMG00000015584	Pelo	98	92.553	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSPCIG00000004880	PELO	98	93.351	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSPFOG00000007277	pelo	97	81.333	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSPLAG00000020787	pelo	97	81.333	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.333	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	ENSPREG00000023071	pelo	97	81.333	Poecilia_reticulata
ENSPSIG00000004971	PELO	97	93.029	ENSPPYG00000015451	PELO	94	93.085	Pongo_abelii
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	ENSPCOG00000021178	PELO	98	93.617	Propithecus_coquereli
ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	ENSPNYG00000017325	pelo	97	79.733	Pundamilia_nyererei
ENSPSIG00000004971	PELO	97	81.233	ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.067	Pygocentrus_nattereri
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	ENSRNOG00000061128	Pelo	98	93.085	Rattus_norvegicus
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSRBIG00000007299	PELO	98	93.351	Rhinopithecus_bieti
ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	ENSRROG00000035507	PELO	98	93.351	Rhinopithecus_roxellana
ENSPSIG00000004971	PELO	98	34.375	YNL001W	-	97	34.474	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.506	ENSSBOG00000036140	PELO	98	93.883	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPSIG00000004971	PELO	63	93.033	ENSSHAG00000010770	PELO	96	93.617	Sarcophilus_harrisii
ENSPSIG00000004971	PELO	98	82.228	ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.400	Scleropages_formosus
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