EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000007162 (Gene tree)
Gene ID: 102448842
Gene Symbol: AGO3
Alias: -
Full Name: argonaute 3%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46860 bases
Position: chrJH205085.1:286494-333353
Accession: 102448842
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000008050	PAZ	PF02170.22	8.7e-29	1	1
ENSPSIP00000008050	Piwi	PF02171.17	8.1e-114	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000008092	AGO3-201	2466	XM_006110734	ENSPSIP00000008050	822 (aa)	-	K7FJ40

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000007162	AGO3	98	78.713	ENSPSIG00000004064	AGO2	93	78.713
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	80.456	ENSPSIG00000013832	AGO4	96	80.456
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	84.133	ENSPSIG00000017482	AGO1	95	84.133

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSG00000126070	AGO3	96	99.027	Homo_sapiens
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.202	ENSAPOG00000024260	ago3a	96	97.202	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.331	ENSAPOG00000014494	-	96	94.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSAMEG00000000497	AGO3	96	99.148	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	96.159	ENSACIG00000019272	AGO3	95	96.159	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	98.013	ENSACIG00000005333	ago3a	95	98.013	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000007162	AGO3	56	90.486	ENSAOCG00000022538	-	90	90.486	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.202	ENSAOCG00000017642	ago3a	96	97.202	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000007162	AGO3	93	87.911	ENSAOCG00000017051	-	95	87.911	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	96.381	ENSAPEG00000004375	ago3a	96	96.381	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.089	ENSAPEG00000020249	-	96	94.089	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	96.381	ENSATEG00000008458	ago3a	96	96.381	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.089	ENSATEG00000005160	-	96	94.089	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.757	ENSAPLG00000009642	AGO3	96	99.757	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.513	ENSACAG00000003385	AGO3	96	99.513	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSANAG00000037735	AGO3	96	99.027	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.210	ENSACLG00000001965	-	96	94.210	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.202	ENSACLG00000000963	ago3a	96	97.202	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	95.762	ENSAMXG00000002198	ago3a	95	95.762	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	94.570	ENSAMXG00000009571	ago3b	95	94.570	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSBTAG00000018324	AGO3	96	99.148	Bos_taurus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCJAG00000031580	AGO3	96	99.027	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCAFG00000024682	AGO3	96	99.027	Canis_familiaris
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.662	ENSCAFG00020009051	AGO3	96	98.659	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSCHIG00000011536	AGO3	96	99.148	Capra_hircus
ENSPSIG00000007162	AGO3	88	99.030	ENSTSYG00000011897	AGO3	99	99.030	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000007162	AGO3	93	79.584	ENSCAPG00000011589	AGO3	95	79.948	Cavia_aperea
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	95.726	ENSCPOG00000030524	AGO3	96	95.726	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCCAG00000034189	AGO3	96	99.027	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCATG00000029748	AGO3	96	99.027	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSCLAG00000013184	AGO3	96	99.148	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCSAG00000001092	AGO3	96	99.027	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	86.772	ENSCHOG00000011621	AGO3	88	86.772	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.513	ENSCPBG00000018583	AGO3	96	99.513	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSCANG00000033258	AGO3	96	99.027	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.783	ENSCGRG00001024614	Ago3	96	98.783	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.783	ENSCGRG00000010670	Ago3	96	98.783	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	97.351	ENSCSEG00000001040	ago3a	95	97.351	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	89.935	ENSCSEG00000009788	-	95	89.935	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000007162	AGO3	54	87.033	ENSCVAG00000011229	-	98	87.033	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	96.837	ENSCVAG00000018224	ago3a	96	96.837	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	95.134	ENSDARG00000063079	ago3b	96	95.134	Danio_rerio
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	96.261	ENSDARG00000059888	ago3a	96	96.261	Danio_rerio
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	99.074	ENSDNOG00000008106	AGO3	99	99.074	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.783	ENSDORG00000009414	Ago3	96	98.783	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000007162	AGO3	89	98.592	ENSETEG00000007639	AGO3	89	98.592	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSEASG00005012089	AGO3	96	99.148	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSECAG00000023972	AGO3	96	99.148	Equus_caballus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	81.387	ENSEEUG00000007058	AGO3	96	81.387	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	93.810	ENSELUG00000001774	-	96	93.810	Esox_lucius
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	94.834	ENSELUG00000016755	ago3a	95	94.834	Esox_lucius
ENSPSIG00000007162	AGO3	72	99.492	ENSFCAG00000000747	-	94	99.492	Felis_catus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.635	ENSFALG00000000802	AGO3	96	99.635	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.633	ENSFDAG00000012874	AGO3	96	99.633	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	93.455	ENSFHEG00000016205	-	95	93.455	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000007162	AGO3	97	96.996	ENSGMOG00000013069	-	96	96.996	Gadus_morhua
ENSPSIG00000007162	AGO3	82	75.238	ENSGMOG00000019418	-	85	75.238	Gadus_morhua
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.635	ENSGALG00000043711	AGO3	96	100.000	Gallus_gallus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	93.212	ENSGAFG00000015911	-	95	93.212	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.080	ENSGAFG00000009808	ago3a	96	97.080	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	97.372	ENSGACG00000012453	ago3a	95	97.372	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	97	95.745	ENSGACG00000002455	AGO3	96	95.745	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.392	ENSGAGG00000012887	AGO3	96	99.392	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSGGOG00000036711	AGO3	96	99.027	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.210	ENSHBUG00000017794	-	96	94.210	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000007162	AGO3	93	95.596	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	95.596	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSHGLG00000012538	AGO3	96	99.148	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.140	ENSHGLG00100006043	AGO3	96	99.140	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000007162	AGO3	91	96.376	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	96.376	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	93.705	ENSHCOG00000011851	AGO3	95	93.705	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.813	ENSIPUG00000008548	ago3b	96	94.813	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	92.054	ENSIPUG00000023241	ago3a	95	92.054	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.161	ENSSTOG00000025904	AGO3	95	94.161	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSJJAG00000017436	Ago3	96	99.027	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	96.381	ENSKMAG00000019534	ago3a	96	96.381	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	93.571	ENSLBEG00000016073	-	96	93.571	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	98.013	ENSLBEG00000007592	ago3a	95	98.013	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSLAFG00000002744	AGO3	96	99.148	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSMFAG00000035610	AGO3	96	99.027	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSMMUG00000006252	AGO3	96	99.027	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSMNEG00000039518	AGO3	96	99.027	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.027	ENSMLEG00000027912	AGO3	96	99.027	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	93.848	ENSMAMG00000005697	-	96	93.848	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	91.619	ENSMAMG00000008440	ago3a	95	97.086	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.331	ENSMZEG00005026243	-	96	94.331	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.202	ENSMZEG00005007949	ago3a	96	97.202	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.757	ENSMGAG00000003773	AGO3	95	99.757	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000007162	AGO3	89	89.835	ENSMAUG00000010128	Ago3	92	89.973	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSMICG00000016158	AGO3	96	99.148	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	96.328	ENSMOCG00000020568	Ago3	95	96.328	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	93.510	ENSMMOG00000014065	-	95	93.510	Mola_mola
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	92.597	ENSMMOG00000018446	ago3a	95	92.597	Mola_mola
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.634	ENSMODG00000017869	AGO3	95	99.634	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	94.575	ENSMALG00000010895	ago3a	95	94.575	Monopterus_albus
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	93.218	ENSMALG00000014658	-	95	93.218	Monopterus_albus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.297	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	96	98.297	Mus_caroli
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.054	ENSMUSG00000028842	Ago3	96	98.054	Mus_musculus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.175	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	96	98.175	Mus_pahari
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.418	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	96	98.418	Mus_spretus
ENSPSIG00000007162	AGO3	72	99.322	ENSMLUG00000009668	AGO3	94	99.322	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	98.783	ENSNGAG00000012607	Ago3	96	99.139	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000007162	AGO3	85	95.869	ENSNBRG00000010936	ago3a	95	95.869	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	96.026	ENSNBRG00000015687	AGO3	95	96.026	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	94.982	ENSNLEG00000027092	AGO3	95	94.982	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000007162	AGO3	91	86.769	ENSMEUG00000009200	AGO3	91	86.769	Notamacropus_eugenii
ENSPSIG00000007162	AGO3	81	100.000	ENSOPRG00000012344	AGO3	77	100.000	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000007162	AGO3	99	99.633	ENSODEG00000005161	AGO3	96	99.633	Octodon_degus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	94.451	ENSONIG00000013760	AGO3	96	94.451	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	97.080	ENSONIG00000016349	ago3a	96	97.080	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000007162	AGO3	98	99.877	ENSOANG00000002078	AGO3	96	99.877	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPSIG00000007162	AGO3	100	99.148	ENSOCUG00000006255	AGO3	96	99.148	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000007162	AGO3	92	98.146	ENSORLG00000015016	ago3a	95	98.146	Oryzias_latipes
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