EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000011816 (Gene tree)
Gene ID: 102456557
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5192 bases
Position: chrJH210894.1:168351-173542
Accession: 102456557
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000013210	SYF2	PF08231.12	3.5e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000013273	SYF2-201	936	XM_006130467	ENSPSIP00000013210	257 (aa)	XP_006130529	K7FYV0

Gene Model

Click here to download ENSPSIG00000011816's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPSIG00000011816's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.266	ENSG00000117614	SYF2	96	86.266	Homo_sapiens
ENSPSIG00000011816	SYF2	86	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	97	80.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	85.408	ENSAMEG00000010115	-	96	85.408	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000011816	SYF2	76	88.205	ENSAMEG00000010134	-	100	88.205	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000011816	SYF2	95	76.400	ENSACIG00000023688	syf2	100	76.400	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	79.817	ENSAOCG00000010912	syf2	67	79.817	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.277	ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.277	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.277	ENSAPEG00000018858	syf2	89	81.277	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	83.871	ENSATEG00000007745	syf2	97	80.000	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000011816	SYF2	78	91.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	91.000	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000011816	SYF2	65	77.844	ENSACAG00000026777	-	94	77.070	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000011816	SYF2	79	90.196	ENSACAG00000013653	-	100	90.196	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.266	ENSANAG00000032473	SYF2	96	86.266	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000011816	SYF2	86	81.532	ENSACLG00000019916	syf2	97	79.149	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	80.435	ENSAMXG00000004051	syf2	95	80.435	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	83.682	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	83.682	Bos_taurus
ENSPSIG00000011816	SYF2	81	51.185	WBGene00019402	syf-2	99	47.639	Caenorhabditis_elegans
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.266	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	86.266	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	ENSCAFG00000012895	-	96	85.169	Canis_familiaris
ENSPSIG00000011816	SYF2	88	79.204	ENSCAFG00000030331	-	96	79.204	Canis_familiaris
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	ENSCAFG00020021091	-	96	85.169	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000011816	SYF2	70	79.670	ENSCAFG00020021094	-	83	86.538	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	84.454	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	84.454	Capra_hircus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.681	ENSTSYG00000005114	SYF2	96	84.681	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.384	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.384	Cavia_aperea
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.463	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	86.463	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.695	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	86.695	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.979	ENSCATG00000026917	SYF2	96	84.979	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.383	ENSCLAG00000008474	SYF2	96	86.383	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	ENSCSAG00000000948	SYF2	94	86.404	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000011816	SYF2	70	67.039	ENSCHOG00000005273	-	99	67.039	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000011816	SYF2	88	96.889	ENSCPBG00000025073	SYF2	98	89.883	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000011816	SYF2	82	55.607	ENSCING00000003017	-	89	55.140	Ciona_intestinalis
ENSPSIG00000011816	SYF2	82	53.271	ENSCSAVG00000006627	-	98	53.271	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	76.190	ENSCANG00000037322	SYF2	95	75.536	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	82.988	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	81.301	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000011816	SYF2	76	87.245	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	86.935	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000011816	SYF2	86	81.900	ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.992	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.435	ENSDARG00000004706	syf2	99	81.435	Danio_rerio
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.383	ENSDNOG00000047605	SYF2	96	86.383	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.638	ENSDORG00000001274	Syf2	95	86.638	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	58.636	FBgn0033556	CG12343	97	58.636	Drosophila_melanogaster
ENSPSIG00000011816	SYF2	86	72.727	ENSETEG00000015729	SYF2	99	71.366	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000011816	SYF2	77	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000011816	SYF2	92	86.017	ENSEASG00005004224	-	96	86.017	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	75.519	ENSEASG00005004232	-	99	75.519	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000011816	SYF2	97	82.800	ENSECAG00000012023	-	99	82.143	Equus_caballus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	85.062	ENSECAG00000010440	-	99	85.062	Equus_caballus
ENSPSIG00000011816	SYF2	67	74.566	ENSEEUG00000015084	SYF2	95	74.566	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	80.932	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.932	Esox_lucius
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.441	ENSFCAG00000010324	-	82	86.441	Felis_catus
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	85.774	ENSFCAG00000043095	-	96	85.774	Felis_catus
ENSPSIG00000011816	SYF2	79	87.745	ENSFALG00000000460	SYF2	98	80.408	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.402	ENSFDAG00000008310	SYF2	99	83.402	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	67.411	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.791	ENSGMOG00000019138	syf2	96	82.791	Gadus_morhua
ENSPSIG00000011816	SYF2	88	90.667	ENSGALG00000013639	SYF2	94	87.712	Gallus_gallus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.447	ENSGAFG00000019435	syf2	97	77.447	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.326	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.311	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	88	96.903	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	90.234	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	85.837	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	80.258	ENSHBUG00000020477	syf2	100	80.258	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	76.339	ENSHGLG00000004304	-	96	73.043	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.532	ENSHGLG00000014393	SYF2	96	85.532	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.532	ENSHGLG00100014722	SYF2	96	85.532	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.966	ENSHCOG00000012904	syf2	77	77.966	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	80.435	ENSIPUG00000019859	syf2	95	80.435	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	57	85.616	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	85.616	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.442	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.442	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	79.828	ENSKMAG00000013856	syf2	97	79.828	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	84.332	ENSLBEG00000014425	syf2	99	79.747	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	77.600	ENSLOCG00000002728	syf2	99	77.600	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.951	ENSLAFG00000023150	-	99	83.951	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000011816	SYF2	71	62.703	ENSLAFG00000030814	-	100	62.703	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.147	ENSMFAG00000041831	SYF2	96	85.408	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.979	ENSMMUG00000002968	SYF2	96	84.979	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.147	ENSMNEG00000030180	SYF2	96	85.408	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.979	ENSMLEG00000030248	SYF2	96	84.979	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.488	ENSMAMG00000010403	syf2	99	77.273	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	78.008	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.008	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000011816	SYF2	77	91.457	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	91.457	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	82.988	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	82.988	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000011816	SYF2	77	88.442	ENSMICG00000016191	SYF2	100	88.442	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.817	ENSMOCG00000022938	Syf2	99	83.817	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	77.872	ENSMMOG00000002396	syf2	98	77.872	Mola_mola
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	86.283	ENSMODG00000013951	-	99	86.283	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	79.915	ENSMALG00000010706	syf2	95	80.342	Monopterus_albus
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	94	86.404	Mus_caroli
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	ENSMUSG00000028821	Syf2	94	86.404	Mus_musculus
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	94	86.404	Mus_pahari
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	94	86.404	Mus_spretus
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	83.264	ENSMPUG00000015801	-	96	83.264	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	ENSMPUG00000015802	-	95	85.837	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.325	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	86.325	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.607	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	83.607	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000011816	SYF2	92	70.763	ENSNBRG00000010720	syf2	97	70.763	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	ENSNLEG00000035185	SYF2	96	85.837	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	84.232	ENSOPRG00000012870	SYF2	99	84.232	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.026	ENSODEG00000017664	-	96	86.026	Octodon_degus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	76.596	ENSODEG00000014338	-	99	76.596	Octodon_degus
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	82.569	ENSONIG00000008213	syf2	97	79.149	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000011816	SYF2	79	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	88.034	ENSOCUG00000013050	SYF2	96	88.034	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.541	ENSORLG00000028820	syf2	98	78.541	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.059	ENSORLG00020018333	syf2	92	82.569	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.872	ENSORLG00015014665	syf2	97	77.872	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	80.169	ENSOMEG00000013911	syf2	99	80.169	Oryzias_melastigma
ENSPSIG00000011816	SYF2	92	85.593	ENSOGAG00000009962	SYF2	97	85.593	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	83.402	ENSOARG00000006348	-	96	83.402	Ovis_aries
ENSPSIG00000011816	SYF2	76	61.538	ENSOARG00000006269	-	100	61.538	Ovis_aries
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	85.837	Pan_paniscus
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	85.774	ENSPPRG00000001651	-	96	85.774	Panthera_pardus
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	88.158	ENSPPRG00000001638	-	93	88.158	Panthera_pardus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	89.815	ENSPTIG00000005711	-	88	82.927	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.695	ENSPTIG00000007036	-	96	85.356	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	85.837	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.147	ENSPANG00000008139	SYF2	96	85.408	Papio_anubis
ENSPSIG00000011816	SYF2	92	80.085	ENSPKIG00000008130	syf2	97	80.085	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	75.620	ENSPMGG00000008755	syf2	95	75.620	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.402	ENSPEMG00000008283	Syf2	99	83.402	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	91.518	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	90.000	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.970	ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.970	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	76.543	ENSPLAG00000006691	syf2	98	78.970	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	75.966	ENSPMEG00000011684	syf2	99	75.745	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	81.944	ENSPREG00000003009	syf2	96	78.112	Poecilia_reticulata
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	ENSPPYG00000001713	SYF2	96	85.837	Pongo_abelii
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	58.506	ENSPCOG00000027011	SYF2	99	58.091	Propithecus_coquereli
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	76.293	ENSPVAG00000005841	SYF2	95	76.293	Pteropus_vampyrus
ENSPSIG00000011816	SYF2	94	78.008	ENSPNYG00000004979	syf2	99	78.008	Pundamilia_nyererei
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.624	ENSPNAG00000015570	syf2	96	81.624	Pygocentrus_nattereri
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	ENSRNOG00000060597	Syf2	94	86.404	Rattus_norvegicus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	82.833	ENSRBIG00000042970	SYF2	96	82.833	Rhinopithecus_bieti
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.147	ENSRROG00000001347	SYF2	96	85.408	Rhinopithecus_roxellana
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	86.580	ENSSBOG00000020184	SYF2	95	86.580	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	90.179	ENSSHAG00000015630	-	90	90.179	Sarcophilus_harrisii
ENSPSIG00000011816	SYF2	80	89.806	ENSSHAG00000007152	-	100	89.806	Sarcophilus_harrisii
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	81.034	ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.034	Scleropages_formosus
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	78.448	ENSSMAG00000009867	syf2	97	78.448	Scophthalmus_maximus
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	99	78.481	Seriola_dumerili
ENSPSIG00000011816	SYF2	85	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	99	78.481	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	67.672	ENSSARG00000012889	SYF2	95	67.672	Sorex_araneus
ENSPSIG00000011816	SYF2	96	84.615	ENSSPUG00000005251	SYF2	98	84.615	Sphenodon_punctatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.481	ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.481	Stegastes_partitus
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	85.345	ENSSSCG00000037481	SYF2	94	85.714	Sus_scrofa
ENSPSIG00000011816	SYF2	58	60.265	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	60.694	Taeniopygia_guttata
ENSPSIG00000011816	SYF2	92	77.966	ENSTRUG00000001499	syf2	93	77.966	Takifugu_rubripes
ENSPSIG00000011816	SYF2	87	78.924	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	Tetraodon_nigroviridis
ENSPSIG00000011816	SYF2	89	65.939	ENSTBEG00000017370	SYF2	93	65.502	Tupaia_belangeri
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	ENSTTRG00000003550	SYF2	95	86.580	Tursiops_truncatus
ENSPSIG00000011816	SYF2	90	84.979	ENSUAMG00000002897	SYF2	95	84.979	Ursus_americanus
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.426	ENSUMAG00000013108	SYF2	95	85.408	Ursus_maritimus
ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.255	ENSVPAG00000005705	SYF2	96	84.255	Vicugna_pacos
ENSPSIG00000011816	SYF2	80	87.805	ENSVVUG00000027181	-	95	84.322	Vulpes_vulpes
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	ENSVVUG00000027175	-	96	85.169	Vulpes_vulpes
ENSPSIG00000011816	SYF2	93	79.592	ENSXETG00000022797	syf2	98	79.592	Xenopus_tropicalis
ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.791	ENSXMAG00000022698	syf2	99	77.178	Xiphophorus_maculatus