EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000013663 (Gene tree)
Gene ID: 102462910
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 43681 bases
Position: chrJH208533.1:9411393-9455073
Accession: 102462910
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000015494	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.1e-27	1	2
ENSPSIP00000015494	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.1e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000015567	PAPOLG-201	2244	XM_006122176	ENSPSIP00000015494	747 (aa)	XP_006122238	K7G5D3

Gene Model

Click here to download ENSPSIG00000013663's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPSIG00000013663's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	59.164	ENSPSIG00000014157	PAPOLA	87	58.575

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSG00000115421	PAPOLG	100	92.308	Homo_sapiens
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.421	ENSAPOG00000004798	papolg	98	67.120	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.954	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	78.954	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.107	ENSACIG00000010546	papolg	98	65.508	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.151	ENSAOCG00000010254	papolg	88	68.691	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.286	ENSAPEG00000006944	papolg	88	68.826	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.826	ENSATEG00000009007	papolg	96	68.939	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	74.766	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	100	74.766	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	81	64.812	ENSACAG00000015048	-	100	64.812	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.869	ENSANAG00000024627	PAPOLG	99	78.869	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.608	ENSACLG00000015592	papolg	95	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.404	ENSAMXG00000004611	papolg	98	69.404	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.947	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	78.947	Bos_taurus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.111	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	79.111	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	69.065	Canis_familiaris
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.476	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	78.476	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.812	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	78.812	Capra_hircus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	79.245	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	51	86.352	ENSCAPG00000014901	-	100	86.352	Cavia_aperea
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	78.976	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.841	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	78.841	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	90	88.393	ENSCATG00000044395	PAPOLG	99	88.393	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.155	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	98	79.155	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.700	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	98	79.700	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	89	77.661	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	77.661	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	60.332	ENSCING00000024664	-	99	60.332	Ciona_intestinalis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	65	64.536	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.536	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.564	ENSCANG00000038120	PAPOLG	98	79.564	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	78.776	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	78.776	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	78.776	ENSCGRG00000005552	-	99	78.776	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	85	80.935	ENSCSEG00000000771	papolg	98	67.794	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	84	80.935	ENSCVAG00000016602	papolg	88	83.838	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	70.187	ENSDARG00000012141	papolg	98	70.187	Danio_rerio
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	77.089	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	99	77.089	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	56	91.943	ENSDORG00000016228	Papolg	98	91.943	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	63.599	ENSETEG00000011815	PAPOLG	98	63.649	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	67	63.636	ENSEBUG00000005042	-	86	63.636	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	57	68.750	ENSEBUG00000004020	papolg	87	68.750	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	79.380	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSECAG00000009859	PAPOLG	99	79.200	Equus_caballus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	70.014	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	98	70.014	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.767	ENSELUG00000014497	papolg	98	69.942	Esox_lucius
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	79.245	Felis_catus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	67.292	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	67.292	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.841	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	78.841	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	67	59.325	ENSFHEG00000019080	papolg	90	58.480	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	84	80.935	ENSGMOG00000018772	papolg	90	80.935	Gadus_morhua
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	74.462	ENSGALG00000007853	PAPOLG	99	74.462	Gallus_gallus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.428	ENSGACG00000002718	papolg	98	68.514	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.111	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	99	79.111	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.608	ENSHBUG00000004882	papolg	96	66.667	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.250	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	79.250	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.408	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	79.408	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.980	ENSHCOG00000006782	papolg	87	67.746	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.489	ENSIPUG00000021642	papolg	99	70.755	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.919	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	79.919	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	56	91.232	ENSJJAG00000015601	Papolg	98	91.232	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	67.385	ENSKMAG00000016439	papolg	95	65.625	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	93	81.006	ENSLBEG00000023218	papolg	96	66.364	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.283	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	69.283	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	71.333	ENSLOCG00000016130	papolg	98	71.333	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.209	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	90.141	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	79.245	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	79.245	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	71.719	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	98	71.719	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	99	79.245	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.054	ENSMAMG00000010667	papolg	98	66.310	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.608	ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.578	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	73.324	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	73.324	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	78.367	ENSMAUG00000009088	Papolg	98	78.367	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.650	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	79.650	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.197	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	78.197	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.280	ENSMMOG00000008020	papolg	98	68.280	Mola_mola
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.733	ENSMODG00000002160	PAPOLG	100	79.733	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	67.819	ENSMALG00000007012	papolg	95	68.868	Monopterus_albus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.869	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	98	91.686	Mus_caroli
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.600	ENSMUSG00000020273	Papolg	98	91.686	Mus_musculus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.437	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	78.437	Mus_pahari
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.331	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	91.686	Mus_spretus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	89	78.976	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	77.971	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	77.971	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.571	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	78.571	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	59.603	ENSNBRG00000011943	papolg	99	59.921	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	56	91.232	ENSNLEG00000009507	-	98	91.232	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	79	74.101	ENSMEUG00000013605	-	85	74.101	Notamacropus_eugenii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.435	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	79.435	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	57	87.559	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	87.559	Octodon_degus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	61.745	ENSONIG00000002985	papolg	98	61.860	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.200	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	79.200	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.919	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	79.919	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.980	ENSORLG00000001577	papolg	94	67.244	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.578	ENSORLG00020002482	papolg	94	67.377	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.711	ENSORLG00015008836	papolg	94	66.977	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	66.980	ENSOMEG00000001406	papolg	95	66.980	Oryzias_melastigma
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	58	71.233	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	71.233	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.812	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	78.812	Ovis_aries
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	99	79.380	Pan_paniscus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	78.976	Panthera_pardus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.841	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	78.841	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	99	79.380	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	75.815	ENSPANG00000014543	PAPOLG	98	75.815	Papio_anubis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	69.076	ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.076	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	90	70.623	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	70.623	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.184	ENSPEMG00000008960	-	99	79.184	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	50.775	ENSPMAG00000002961	papolg	98	50.970	Petromyzon_marinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	65	63.525	ENSPMAG00000004864	-	96	63.525	Petromyzon_marinus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	80.295	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	80.295	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	66.227	ENSPFOG00000012909	papolg	99	66.316	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	84	81.495	ENSPLAG00000018445	papolg	88	66.979	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	81.495	ENSPMEG00000003961	papolg	88	66.711	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	81.495	ENSPREG00000010358	papolg	88	66.577	Poecilia_reticulata
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.380	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	79.380	Pongo_abelii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	70.421	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	70.421	Procavia_capensis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	71.024	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	99	71.429	Propithecus_coquereli
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	85	85.397	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	85.397	Pteropus_vampyrus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	67.341	ENSPNYG00000006729	papolg	98	67.341	Pundamilia_nyererei
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	71.102	ENSPNAG00000015521	papolg	99	71.102	Pygocentrus_nattereri
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	77.346	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	77.346	Rattus_norvegicus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	74.251	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	98	74.251	Rhinopithecus_bieti
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.564	ENSRROG00000035954	PAPOLG	98	79.564	Rhinopithecus_roxellana
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.111	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	79.111	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	94	80.395	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	80.395	Sarcophilus_harrisii
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	62.585	ENSSFOG00015011874	papolg	98	62.585	Scleropages_formosus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.970	ENSSFOG00015002383	papolg	98	68.970	Scleropages_formosus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	83	81.203	ENSSMAG00000015598	papolg	96	65.051	Scophthalmus_maximus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.371	ENSSDUG00000000912	papolg	98	66.712	Seriola_dumerili
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.449	ENSSLDG00000001217	papolg	96	68.449	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.139	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	99	79.139	Sphenodon_punctatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	67.593	ENSSPAG00000009004	papolg	98	66.848	Stegastes_partitus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.515	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	79.515	Sus_scrofa
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	72	77.079	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	77.079	Taeniopygia_guttata
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.392	ENSTRUG00000006410	papolg	98	68.392	Takifugu_rubripes
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	62.685	ENSTNIG00000017106	papolg	98	62.685	Tetraodon_nigroviridis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	72.715	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	72.715	Tupaia_belangeri
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	75.067	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	75.067	Tursiops_truncatus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.217	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	79.217	Ursus_americanus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.217	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	79.217	Ursus_maritimus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	75.741	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	75.741	Vicugna_pacos
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.245	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	79.245	Vulpes_vulpes
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	72.727	ENSXETG00000002208	papolg	99	72.727	Xenopus_tropicalis
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	66	83.806	ENSXCOG00000006611	papolg	73	83.806	Xiphophorus_couchianus
ENSPSIG00000013663	PAPOLG	66	81.414	ENSXMAG00000007383	papolg	99	81.414	Xiphophorus_maculatus