EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000014366 (Gene tree)
Gene ID: 102443406
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 200882 bases
Position: chrJH209116.1:5643808-5844689
Accession: 102443406
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000016284	IBN_N	PF03810.19	2.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000016360	TNPO1-201	7835	XM_006124293	ENSPSIP00000016284	896 (aa)	XP_006124355	K7G7M3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	83.907	ENSPSIG00000010215	TNPO2	99	83.907

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.382	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.382	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	96.552	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.552	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.540	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.540	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.494	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.494	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.494	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.494	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.933	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.933	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	98	93.799	ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	98.539	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.539	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	63.536	ENSANAG00000027118	-	99	63.315	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.548	ENSANAG00000022453	-	100	96.548	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	86.496	ENSANAG00000025351	-	100	86.496	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	91.910	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.910	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.161	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	96.882	Bos_taurus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	96.659	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	97.316	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.316	Canis_familiaris
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.719	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.719	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.771	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	96.771	Capra_hircus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.559	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.023	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.548	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.966	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	97.416	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.548	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.966	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	96.993	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	94	84.534	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	84.534	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.664	ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	99.664	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	96.993	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	96.882	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	97.427	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	97.427	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.042	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.034	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.596	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.596	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.490	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.817	Danio_rerio
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	91.275	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	91.275	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	93	97.349	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.346	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	58.126	FBgn0035693	CG8219	99	58.014	Drosophila_melanogaster
ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000014366	TNPO1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	97.416	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	96.882	Equus_caballus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	87.146	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.601	Esox_lucius
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	97.416	Felis_catus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.438	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.438	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	96.659	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.939	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	90.940	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.940	Gadus_morhua
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	98.103	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.315	Gallus_gallus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.049	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.603	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.603	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.438	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.438	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	81.187	ENSGGOG00000022535	-	98	81.187	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	97.416	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.596	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.596	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.325	ENSHGLG00000000970	-	100	96.325	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	96.729	ENSHGLG00100017090	-	99	96.729	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	75.814	ENSHGLG00100000963	-	99	75.349	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.531	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.531	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.157	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	90	91.245	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.245	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	89.767	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.767	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	96.521	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.521	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	97	96.998	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.998	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	96.993	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.882	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	96.993	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	96.993	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.045	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.258	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.258	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.092	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.490	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.490	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	96.983	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.983	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.686	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.686	Mola_mola
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	92.697	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	Monopterus_albus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.753	Mus_caroli
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.753	Mus_musculus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.771	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.753	Mus_pahari
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.659	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.753	Mus_spretus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	96.882	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	96.857	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.857	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	96.882	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.669	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.669	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	97.416	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000014366	TNPO1	91	90.593	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	90.593	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.325	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	96.325	Octodon_degus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	92.865	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.865	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	92	98.537	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.537	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	91.005	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.005	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.774	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.774	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.687	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.687	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.912	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.912	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.574	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.574	Oryzias_melastigma
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	96.993	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.882	Ovis_aries
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	96.993	Pan_paniscus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	97.416	Panthera_pardus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	97.416	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000014366	TNPO1	94	85.221	ENSPTRG00000047731	-	100	85.221	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	96.993	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	96.993	Papio_anubis
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	91.011	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.011	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	90.797	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	97.313	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.427	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	98.539	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.539	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.617	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.617	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.617	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.617	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.820	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.820	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.722	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.722	Poecilia_reticulata
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	96.882	Pongo_abelii
ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	96.993	Propithecus_coquereli
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