EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000014457 (Gene tree)
Gene ID: 102460823
Gene Symbol: XPO1
Alias: -
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 66890 bases
Position: chrJH208533.1:9993777-10060666
Accession: 102460823
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000016306	CRM1_C	PF08767.11	1.5e-135	1	1
ENSPSIP00000016332	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-135	1	1
ENSPSIP00000016332	Xpo1	PF08389.12	9.5e-35	1	1
ENSPSIP00000016306	Xpo1	PF08389.12	2.3e-25	1	1
ENSPSIP00000016332	IBN_N	PF03810.19	2e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000016382	XPO1-201	6427	-	ENSPSIP00000016306	904 (aa)	-	K7G7P5
ENSPSIT00000016408	XPO1-202	4625	XM_006122168	ENSPSIP00000016332	1076 (aa)	XP_006122230	K7G7S1

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pss03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSG00000082898	XPO1	100	99.242	Homo_sapiens
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSAPOG00000004984	-	100	95.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	90.376	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.516	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.810	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.860	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSACIG00000010818	-	100	95.560	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.920	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.086	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSAOCG00000010121	-	100	95.450	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.920	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.709	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSAPEG00000007038	-	100	95.450	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSATEG00000008816	-	100	95.450	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.810	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	92.857	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	100.000	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.886	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.700	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.493	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.142	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.178	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSACLG00000015192	-	100	95.265	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	97.345	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.915	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	94.053	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.053	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.607	Bos_taurus
ENSPSIG00000014457	XPO1	99	53.326	WBGene00002078	xpo-1	99	51.287	Caenorhabditis_elegans
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.493	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.607	Canis_familiaris
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.503	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.607	Capra_hircus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.607	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000014457	XPO1	62	95.213	ENSCAPG00000006454	-	100	95.213	Cavia_aperea
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.119	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.122	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	78.506	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.690	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.252	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.447	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.329	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.493	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000014457	XPO1	83	98.198	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.198	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.889	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.793	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	82.652	ENSCING00000024562	-	100	80.370	Ciona_intestinalis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	80.568	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.387	Ciona_savignyi
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.473	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.404	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.562	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.307	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.562	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	97.307	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.018	ENSCSEG00000001693	XPO1	99	96.117	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.257	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.529	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSCVAG00000016788	-	100	95.357	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	94.248	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	93.712	Danio_rerio
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	97.677	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.193	Danio_rerio
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.889	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.700	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000014457	XPO1	92	94.883	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.883	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	71.050	FBgn0020497	emb	99	70.457	Drosophila_melanogaster
ENSPSIG00000014457	XPO1	94	97.634	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.634	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	80.663	ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	Eptatretus_burgeri
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.607	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.393	Equus_caballus
ENSPSIG00000014457	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	95.465	ENSELUG00000012707	xpo1a	99	95.577	Esox_lucius
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.260	ENSELUG00000014306	-	99	92.447	Esox_lucius
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.607	Felis_catus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.668	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.607	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.336	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	96.654	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000014457	XPO1	53	97.165	ENSFHEG00000018974	-	98	97.165	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.588	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.808	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000014457	XPO1	97	96.224	ENSGMOG00000019063	-	94	96.224	Gadus_morhua
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.916	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.015	Gadus_morhua
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	100.000	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.886	Gallus_gallus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSGAFG00000003355	-	98	95.394	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.699	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.755	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.571	ENSGACG00000002743	-	100	95.265	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.367	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.715	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.700	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.493	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.903	ENSHBUG00000020037	-	100	95.357	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.142	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.272	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.336	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.236	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.336	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.236	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	95.575	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.503	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	95.686	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.129	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	97.345	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.822	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.558	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.422	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.447	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.329	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.810	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.715	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.460	ENSKMAG00000016218	-	100	94.986	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSLBEG00000005740	-	100	95.450	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000014457	XPO1	99	92.325	ENSLBEG00000002104	xpo1a	97	92.325	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	76.860	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.860	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	97.566	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.193	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.336	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.236	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.493	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.493	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.451	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.493	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.366	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	95.745	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.920	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	90.994	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSMAMG00000010568	-	100	95.357	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.792	ENSMZEG00005018158	-	98	95.394	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	93.142	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.272	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000014457	XPO1	80	99.725	ENSMGAG00000001496	-	100	99.725	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.562	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	97.307	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.607	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.673	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.586	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.810	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	91.860	Mola_mola
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.571	ENSMMOG00000008001	-	99	96.656	Mola_mola
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.562	ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.493	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	96.460	ENSMALG00000007085	-	100	95.079	Monopterus_albus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	91.823	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	90.919	Monopterus_albus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.673	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.679	Mus_caroli
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.783	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	97.772	Mus_musculus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.673	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.679	Mus_pahari
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.783	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	97.772	Mus_spretus
ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	98.607	Mustela_putorius_furo
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