EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000017482 (Gene tree)
Gene ID: 102448601
Gene Symbol: AGO1
Alias: -
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33375 bases
Position: chrJH205085.1:222576-255950
Accession: 102448601
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000019796	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSPSIP00000019796	Piwi	PF02171.17	2.4e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPSIT00000019889	AGO1-201	2542	XM_006110733	ENSPSIP00000019796	838 (aa)	-	K7GHN5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPSIG00000017482	AGO1	99	81.570	ENSPSIG00000004064	AGO2	97	81.473
ENSPSIG00000017482	AGO1	95	84.133	ENSPSIG00000007162	AGO3	99	84.133
ENSPSIG00000017482	AGO1	99	82.981	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	82.981

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSG00000092847	AGO1	100	98.980	Homo_sapiens
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSAPOG00000024299	ago1	98	95.962	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSAMEG00000000504	AGO1	98	99.050	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPSIG00000017482	AGO1	84	91.051	ENSACIG00000005298	ago1	98	91.051	Amphilophus_citrinellus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSAOCG00000017727	ago1	98	95.962	Amphiprion_ocellaris
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSAPEG00000004458	ago1	99	95.962	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSATEG00000008523	ago1	98	95.962	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	93.026	ENSAPLG00000010440	AGO1	97	93.026	Anas_platyrhynchos
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	99.107	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.107	Anolis_carolinensis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSANAG00000037711	AGO1	98	99.050	Aotus_nancymaae
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	ENSACLG00000000890	ago1	98	95.724	Astatotilapia_calliptera
ENSPSIG00000017482	AGO1	82	97.529	ENSAMXG00000001917	ago1	98	97.529	Astyanax_mexicanus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	ENSBTAG00000012253	AGO1	98	98.931	Bos_taurus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCJAG00000032023	AGO1	98	99.050	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCAFG00000003443	AGO1	98	99.050	Canis_familiaris
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.812	ENSCAFG00020009251	AGO1	98	99.044	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.575	ENSCHIG00000011848	-	98	98.111	Capra_hircus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSTSYG00000009767	-	99	99.050	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000017482	AGO1	99	78.954	ENSTSYG00000032426	-	99	78.954	Carlito_syrichta
ENSPSIG00000017482	AGO1	90	92.562	ENSCAPG00000010228	AGO1	98	91.684	Cavia_aperea
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCPOG00000011568	AGO1	98	99.050	Cavia_porcellus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCCAG00000011823	AGO1	98	99.050	Cebus_capucinus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCATG00000031521	AGO1	100	98.980	Cercocebus_atys
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	99.050	Chinchilla_lanigera
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCSAG00000001091	AGO1	98	99.050	Chlorocebus_sabaeus
ENSPSIG00000017482	AGO1	87	93.130	ENSCHOG00000011591	AGO1	85	93.130	Choloepus_hoffmanni
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.169	ENSCPBG00000018594	AGO1	98	99.169	Chrysemys_picta_bellii
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCANG00000039798	AGO1	98	99.050	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCGRG00001022708	Ago1	98	99.050	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	99.050	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	94.282	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.282	Cynoglossus_semilaevis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSCVAG00000018173	ago1	98	95.962	Cyprinodon_variegatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	96.081	ENSDARG00000092644	ago1	98	96.081	Danio_rerio
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	98.980	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	98.980	Dasypus_novemcinctus
ENSPSIG00000017482	AGO1	97	98.095	ENSDORG00000008494	Ago1	98	98.095	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000017482	AGO1	84	92.188	ENSETEG00000007626	AGO1	98	92.188	Echinops_telfairi
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSEASG00005012086	AGO1	98	99.050	Equus_asinus_asinus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSECAG00000024353	AGO1	98	99.050	Equus_caballus
ENSPSIG00000017482	AGO1	94	90.621	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	90.621	Erinaceus_europaeus
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	96.046	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.046	Esox_lucius
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSFCAG00000000746	AGO1	98	99.050	Felis_catus
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	91.349	ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.349	Ficedula_albicollis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSFDAG00000017210	AGO1	98	99.050	Fukomys_damarensis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	92.043	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.043	Fundulus_heteroclitus
ENSPSIG00000017482	AGO1	89	83.622	ENSGMOG00000019413	ago1	100	83.622	Gadus_morhua
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.169	ENSGALG00000002249	AGO1	98	99.169	Gallus_gallus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSGAFG00000009775	ago1	98	95.962	Gambusia_affinis
ENSPSIG00000017482	AGO1	89	96.149	ENSGACG00000012443	ago1	100	96.149	Gasterosteus_aculeatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	99.107	ENSGAGG00000012893	-	100	99.107	Gopherus_agassizii
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSGGOG00000003316	AGO1	98	99.050	Gorilla_gorilla
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	ENSHBUG00000010459	ago1	98	95.724	Haplochromis_burtoni
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSHGLG00000011540	AGO1	98	99.050	Heterocephalus_glaber_female
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSHGLG00100005568	AGO1	98	99.050	Heterocephalus_glaber_male
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSHCOG00000005708	ago1	99	95.962	Hippocampus_comes
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.843	ENSIPUG00000023216	ago1	98	95.843	Ictalurus_punctatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSSTOG00000010857	AGO1	98	99.050	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSJJAG00000019449	Ago1	98	99.050	Jaculus_jaculus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSKMAG00000019464	ago1	98	95.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSLBEG00000007694	ago1	98	95.962	Labrus_bergylta
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	93.128	ENSLACG00000017009	AGO1	98	93.128	Latimeria_chalumnae
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	93.705	ENSLOCG00000000504	AGO1	98	93.705	Lepisosteus_oculatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.050	Loxodonta_africana
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMFAG00000002846	AGO1	98	99.050	Macaca_fascicularis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	94.418	ENSMMUG00000006251	AGO1	99	94.299	Macaca_mulatta
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.606	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	98.980	Macaca_nemestrina
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMLEG00000038388	AGO1	98	99.050	Mandrillus_leucophaeus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSMAMG00000008381	ago1	98	95.962	Mastacembelus_armatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	ENSMZEG00005007996	ago1	98	95.724	Maylandia_zebra
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	94.215	ENSMGAG00000003822	AGO1	98	94.215	Meleagris_gallopavo
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMAUG00000015189	Ago1	98	99.050	Mesocricetus_auratus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMICG00000016147	AGO1	98	99.050	Microcebus_murinus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	ENSMOCG00000000537	Ago1	98	98.931	Microtus_ochrogaster
ENSPSIG00000017482	AGO1	80	97.619	ENSMMOG00000018459	ago1	93	97.619	Mola_mola
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMODG00000023335	AGO1	98	99.050	Monodelphis_domestica
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.843	ENSMALG00000011057	ago1	99	95.843	Monopterus_albus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.198	Mus_caroli
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.198	Mus_musculus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.198	Mus_pahari
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.198	Mus_spretus
ENSPSIG00000017482	AGO1	85	99.028	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.028	Mustela_putorius_furo
ENSPSIG00000017482	AGO1	61	99.609	ENSMLUG00000009628	AGO1	98	99.609	Myotis_lucifugus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSNGAG00000017448	Ago1	98	99.050	Nannospalax_galili
ENSPSIG00000017482	AGO1	93	96.046	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.046	Neolamprologus_brichardi
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSNLEG00000011181	AGO1	98	99.050	Nomascus_leucogenys
ENSPSIG00000017482	AGO1	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSPSIG00000017482	AGO1	92	97.885	ENSOPRG00000012325	AGO1	91	97.885	Ochotona_princeps
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSODEG00000005321	AGO1	98	99.050	Octodon_degus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.724	ENSONIG00000016345	ago1	99	95.724	Oreochromis_niloticus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	90.258	ENSOANG00000002080	AGO1	98	91.243	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	ENSOCUG00000023116	AGO1	98	98.931	Oryctolagus_cuniculus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSORLG00000014965	ago1	98	95.962	Oryzias_latipes
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSORLG00020018253	ago1	98	95.962	Oryzias_latipes_hni
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSORLG00015003287	ago1	98	95.962	Oryzias_latipes_hsok
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSOMEG00000020528	ago1	98	95.962	Oryzias_melastigma
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSOGAG00000010279	AGO1	98	99.050	Otolemur_garnettii
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.931	ENSOARG00000019591	AGO1	98	98.931	Ovis_aries
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPPAG00000034838	AGO1	98	99.050	Pan_paniscus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPPRG00000006475	AGO1	98	99.050	Panthera_pardus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	98.812	ENSPTIG00000020991	AGO1	98	98.812	Panthera_tigris_altaica
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPTRG00000000528	AGO1	98	99.050	Pan_troglodytes
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPANG00000009060	AGO1	98	99.050	Papio_anubis
ENSPSIG00000017482	AGO1	82	96.377	ENSPMGG00000024099	ago1	98	96.377	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPEMG00000023313	Ago1	98	99.050	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPCIG00000000172	AGO1	98	99.050	Phascolarctos_cinereus
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSPFOG00000005867	ago1	98	95.962	Poecilia_formosa
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSPLAG00000002824	ago1	99	97.114	Poecilia_latipinna
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.114	Poecilia_mexicana
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	ENSPREG00000006534	ago1	98	95.962	Poecilia_reticulata
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPPYG00000001551	AGO1	98	99.050	Pongo_abelii
ENSPSIG00000017482	AGO1	57	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	64	100.000	Procavia_capensis
ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	98.980	Propithecus_coquereli
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