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Description

Ensembl ID: ENSPSIG00000017487 (Gene tree)
Gene ID: 102464002
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Pelodiscus_sinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11138 bases
Position: chrJH209559.1:761914-773051
Accession: 102464002
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPSIP00000019707	PRP38	PF03371.15	5.7e-63	1	1

Transcripts

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pss03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	71	88.688	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	81.789	Amphiprion_percula
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	71	88.235	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	81.150	Anabas_testudineus
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	79	98.381	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	98.381	Anas_platyrhynchos
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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	80.831	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	80.831	Astyanax_mexicanus
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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	97.756	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	97.756	Callithrix_jacchus
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	97.756	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	97.756	Canis_familiaris
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	97.756	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	97.756	Canis_lupus_dingo
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	97.756	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	97.756	Capra_hircus
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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	98.077	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	98.077	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	84	80.989	ENSDORG00000025371	-	78	85.463	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	100	84.295	ENSDORG00000023857	-	100	84.295	Dipodomys_ordii
ENSPSIG00000017487	PRPF38A	63	75.127	FBgn0050342	Prp38	57	76.064	Drosophila_melanogaster
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ENSPSIG00000017487	PRPF38A	87	70.111	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	91.489	Hippocampus_comes
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