EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000007036 (Gene tree)
Gene ID: 102958931
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6479 bases
Position: chrKE721781.1:614567-621045
Accession: 102958931
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000004568	SYF2	PF08231.12	6.8e-55	1	1
ENSPTIP00000004553	SYF2	PF08231.12	1.6e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000008304	-	1070	XM_007083666	ENSPTIP00000004553	246 (aa)	XP_007083728	UPI00042BD941
ENSPTIT00000008319	-	615	-	ENSPTIP00000004568	204 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000007036's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000007036's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000007036	-	93	95.197	ENSPTIG00000005711	-	83	95.197

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	ENSG00000117614	SYF2	99	93.852	Homo_sapiens
ENSPTIG00000007036	-	89	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	97	82.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000007036	-	97	96.639	ENSAMEG00000010115	-	98	96.639	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000007036	-	79	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000007036	-	93	78.112	ENSACIG00000023688	syf2	93	78.112	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000007036	-	99	77.016	ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000007036	-	82	83.663	ENSAOCG00000010912	syf2	63	83.663	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000007036	-	99	77.016	ENSAPEG00000018858	syf2	96	77.016	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000007036	-	88	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	95	80.702	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000007036	-	81	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000007036	-	83	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000007036	-	78	76.250	ENSACAG00000026777	-	96	76.250	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000007036	-	99	93.033	ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.443	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000007036	-	89	80.822	ENSACLG00000019916	syf2	98	77.778	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000007036	-	92	81.057	ENSAMXG00000004051	syf2	94	81.057	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.902	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.515	Bos_taurus
ENSPTIG00000007036	-	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	98	48.035	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.443	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000007036	-	100	96.748	ENSCAFG00000012895	-	100	96.748	Canis_familiaris
ENSPTIG00000007036	-	98	83.058	ENSCAFG00000030331	-	99	83.058	Canis_familiaris
ENSPTIG00000007036	-	100	96.748	ENSCAFG00020021091	-	100	96.748	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000007036	-	97	85.787	ENSCAFG00020021094	-	95	85.787	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	93.089	Capra_hircus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.089	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000007036	-	80	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSPTIG00000007036	-	100	91.870	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	93.443	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	ENSCATG00000026917	SYF2	99	92.213	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.213	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000007036	-	74	76.923	ENSCHOG00000005273	-	100	76.923	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000007036	-	91	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	87.554	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000007036	-	86	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000007036	-	90	47.568	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000007036	-	99	79.918	ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.918	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.057	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000007036	-	80	95.918	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000007036	-	89	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.614	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000007036	-	89	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	92	81.735	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000007036	-	94	79.310	ENSDARG00000004706	syf2	97	79.310	Danio_rerio
ENSPTIG00000007036	-	100	93.902	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.902	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.057	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000007036	-	89	57.727	FBgn0033556	CG12343	97	57.727	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000007036	-	90	76.471	ENSETEG00000015729	SYF2	100	75.862	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000007036	-	80	61.421	ENSEBUG00000015402	syf2	95	61.421	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000007036	-	100	82.114	ENSEASG00005004232	-	100	82.114	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000007036	-	100	94.309	ENSEASG00005004224	-	100	94.309	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000007036	-	96	95.339	ENSECAG00000010440	-	98	95.339	Equus_caballus
ENSPTIG00000007036	-	100	94.309	ENSECAG00000012023	-	100	94.309	Equus_caballus
ENSPTIG00000007036	-	75	81.081	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000007036	-	89	85.321	ENSELUG00000003465	syf2	92	85.321	Esox_lucius
ENSPTIG00000007036	-	100	99.593	ENSFCAG00000043095	-	100	99.593	Felis_catus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSFCAG00000010324	-	85	93.089	Felis_catus
ENSPTIG00000007036	-	83	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	98	79.668	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.276	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000007036	-	91	66.964	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000007036	-	89	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.028	Gadus_morhua
ENSPTIG00000007036	-	92	87.225	ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	Gallus_gallus
ENSPTIG00000007036	-	93	78.070	ENSGAFG00000019435	syf2	95	78.070	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000007036	-	87	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000007036	-	91	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	86.864	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000007036	-	99	93.852	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	94.262	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000007036	-	93	78.112	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.112	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.276	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000007036	-	91	83.036	ENSHGLG00000004304	-	99	80.591	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000007036	-	100	92.276	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.276	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000007036	-	98	76.735	ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.735	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000007036	-	89	83.636	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.636	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000007036	-	59	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000007036	-	81	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000007036	-	95	78.632	ENSKMAG00000013856	syf2	97	78.632	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000007036	-	89	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.063	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000007036	-	89	86.697	ENSLACG00000012064	SYF2	92	86.697	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000007036	-	98	79.253	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.253	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000007036	-	74	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000007036	-	100	92.683	ENSLAFG00000023150	-	100	92.683	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000007036	-	99	92.623	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	92.623	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	92.623	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000007036	-	99	92.623	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	92.623	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	92.213	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000007036	-	88	82.488	ENSMAMG00000010403	syf2	99	75.918	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000007036	-	93	78.947	ENSMZEG00005006429	syf2	95	78.947	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000007036	-	81	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000007036	-	99	90.574	ENSMAUG00000018974	Syf2	99	90.574	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000007036	-	87	97.191	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.191	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000007036	-	100	91.870	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.870	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000007036	-	96	76.695	ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.695	Mola_mola
ENSPTIG00000007036	-	92	87.773	ENSMODG00000013951	-	100	87.773	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000007036	-	89	82.273	ENSMALG00000010706	syf2	91	82.727	Monopterus_albus
ENSPTIG00000007036	-	99	91.393	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	99	91.393	Mus_caroli
ENSPTIG00000007036	-	99	91.393	ENSMUSG00000028821	Syf2	99	91.393	Mus_musculus
ENSPTIG00000007036	-	99	91.393	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	99	91.393	Mus_pahari
ENSPTIG00000007036	-	99	91.393	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	99	91.393	Mus_spretus
ENSPTIG00000007036	-	100	92.683	ENSMPUG00000015801	-	100	92.683	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000007036	-	100	97.561	ENSMPUG00000015802	-	100	97.561	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000007036	-	95	95.708	ENSMLUG00000001885	SYF2	95	95.708	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000007036	-	100	90.650	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000007036	-	98	69.421	ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.106	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	93.852	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000007036	-	100	91.057	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.057	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000007036	-	100	81.301	ENSODEG00000014338	-	99	82.700	Octodon_degus
ENSPTIG00000007036	-	96	93.191	ENSODEG00000017664	-	98	93.191	Octodon_degus
ENSPTIG00000007036	-	89	80.822	ENSONIG00000008213	syf2	98	77.778	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000007036	-	82	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.902	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.309	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000007036	-	89	82.648	ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000007036	-	89	82.648	ENSORLG00020018333	syf2	92	82.648	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000007036	-	94	78.879	ENSORLG00015014665	syf2	96	78.879	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000007036	-	89	83.562	ENSOMEG00000013911	syf2	92	83.562	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000007036	-	79	66.154	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSPTIG00000007036	-	100	93.548	ENSOARG00000006348	-	100	93.548	Ovis_aries
ENSPTIG00000007036	-	99	93.852	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	94.262	Pan_paniscus
ENSPTIG00000007036	-	100	99.593	ENSPPRG00000001651	-	100	99.593	Panthera_pardus
ENSPTIG00000007036	-	96	95.781	ENSPPRG00000001638	-	96	95.781	Panthera_pardus
ENSPTIG00000007036	-	99	93.852	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.262	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000007036	-	99	92.623	ENSPANG00000008139	SYF2	99	92.623	Papio_anubis
ENSPTIG00000007036	-	95	79.828	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000007036	-	96	85.356	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.695	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000007036	-	96	76.371	ENSPMGG00000008755	syf2	92	76.371	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000007036	-	100	91.463	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.463	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000007036	-	91	92.000	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	86.800	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000007036	-	100	74.390	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.390	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000007036	-	96	77.119	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.119	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000007036	-	98	73.750	ENSPMEG00000011684	syf2	99	73.750	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000007036	-	88	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	99	75.833	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	93.443	Pongo_abelii
ENSPTIG00000007036	-	100	78.431	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.431	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000007036	-	100	82.114	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000007036	-	89	80.822	ENSPNYG00000004979	syf2	98	77.778	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000007036	-	96	80.591	ENSPNAG00000015570	syf2	97	80.591	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000007036	-	99	91.393	ENSRNOG00000060597	Syf2	99	91.393	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000007036	-	99	90.164	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.164	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000007036	-	99	92.623	ENSRROG00000001347	SYF2	99	92.623	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.213	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000007036	-	83	92.718	ENSSHAG00000007152	-	100	92.718	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000007036	-	92	90.749	ENSSHAG00000015630	-	100	85.542	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000007036	-	89	84.862	ENSSFOG00015023647	syf2	92	84.862	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000007036	-	91	80.000	ENSSMAG00000009867	syf2	97	80.000	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000007036	-	89	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	100	76.033	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000007036	-	89	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	97	78.970	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000007036	-	100	74.797	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.797	Sorex_araneus
ENSPTIG00000007036	-	95	85.043	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000007036	-	93	79.310	ENSSPAG00000009626	syf2	97	79.310	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.089	Sus_scrofa
ENSPTIG00000007036	-	57	74.359	ENSTGUG00000001126	SYF2	100	58.000	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000007036	-	95	77.253	ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.253	Takifugu_rubripes
ENSPTIG00000007036	-	89	79.817	ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000007036	-	100	70.732	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.325	Tupaia_belangeri
ENSPTIG00000007036	-	100	93.496	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000007036	-	100	96.341	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	96.341	Ursus_americanus
ENSPTIG00000007036	-	100	96.748	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	96.748	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.089	Vicugna_pacos
ENSPTIG00000007036	-	97	92.469	ENSVVUG00000027181	-	96	92.469	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000007036	-	100	96.748	ENSVVUG00000027175	-	100	96.748	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000007036	-	94	83.621	ENSXETG00000022797	syf2	92	84.716	Xenopus_tropicalis
ENSPTIG00000007036	-	87	81.860	ENSXMAG00000022698	syf2	95	78.509	Xiphophorus_maculatus