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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000007188 (Gene tree)
Gene ID: 102965683
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 846 bases
Position: chrKE721753.1:2198865-2199710
Accession: 102965683
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000004760	RNase_P_pop3	PF08228.11	6.6e-06	1	1
ENSPTIP00000004760	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	4.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000008516	RPP38-201	846	XM_015537173	ENSPTIP00000004760	281 (aa)	XP_015392659	UPI0007663761

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ptg03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	75.265	ENSG00000152464	RPP38	100	75.265	Homo_sapiens
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.294	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	84.342	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	84.342	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000007188	RPP38	92	40.141	ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.989	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.857	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	42.414	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	44.853	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.364	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000007188	RPP38	96	42.500	ENSATEG00000000731	rpp38	98	42.500	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000007188	RPP38	91	50.382	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	51.460	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.667	ENSACLG00000016958	rpp38	97	42.500	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.304	ENSACLG00000016962	rpp38	97	42.143	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000007188	RPP38	89	43.651	ENSAMXG00000025023	rpp38	98	43.682	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.404	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	74.113	Bos_taurus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	80.783	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	80.783	Canis_familiaris
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	80.783	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	80.783	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.404	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	74.113	Capra_hircus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.479	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	71.479	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	72.535	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.831	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	74.717	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	74.912	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	76.408	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	76.408	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.070	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	70.070	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.070	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	70.070	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	39.209	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	39.024	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000007188	RPP38	95	42.143	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.561	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	45.985	ENSDARG00000040350	rpp38	96	46.886	Danio_rerio
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.498	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	72.792	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	67.719	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	67.719	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.127	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.127	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000007188	RPP38	99	75.180	ENSEASG00005019783	RPP38	98	75.180	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	68.440	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	68.440	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000007188	RPP38	88	46.520	ENSELUG00000010160	rpp38	94	46.643	Esox_lucius
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	97.153	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	97.153	Felis_catus
ENSPTIG00000007188	RPP38	91	50.566	ENSFALG00000014804	RPP38	94	51.625	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	72.887	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	72.183	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000007188	RPP38	95	41.993	ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.333	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000007188	RPP38	92	50.951	ENSGALG00000008794	RPP38	92	51.648	Gallus_gallus
ENSPTIG00000007188	RPP38	58	48.503	ENSGACG00000009258	rpp38	97	47.853	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.304	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	42.500	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.479	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	70.775	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000007188	RPP38	88	42.105	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.729	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.050	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.050	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	72.183	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	72.183	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000007188	RPP38	88	40.234	ENSKMAG00000003986	rpp38	93	40.580	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000007188	RPP38	92	44.485	ENSLBEG00000006853	rpp38	95	44.000	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000007188	RPP38	95	50.175	ENSLACG00000006502	RPP38	100	50.502	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	50.545	ENSLOCG00000018347	rpp38	96	50.352	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	74.205	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	74.205	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	74.717	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	74.912	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000007188	RPP38	96	43.273	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	43.321	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.667	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	42.857	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.667	ENSMZEG00005003200	rpp38	97	42.500	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000007188	RPP38	92	51.331	ENSMGAG00000008217	RPP38	92	52.015	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	69.718	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	69.718	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	69.718	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	69.718	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000007188	RPP38	93	40.074	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	40.659	Mola_mola
ENSPTIG00000007188	RPP38	95	63.704	ENSMODG00000024091	RPP38	100	64.085	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000007188	RPP38	91	42.182	ENSMALG00000002356	rpp38	93	41.111	Monopterus_albus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.479	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	71.127	Mus_caroli
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.423	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	70.070	Mus_musculus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.775	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	70.775	Mus_pahari
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.070	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	69.718	Mus_spretus
ENSPTIG00000007188	RPP38	99	83.513	ENSMPUG00000018523	RPP38	99	83.513	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	76.426	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	76.868	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.526	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	70.175	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.155	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	42.545	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000007188	RPP38	95	42.701	ENSONIG00000020467	rpp38	97	43.321	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.671	ENSOCUG00000022768	-	100	70.671	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	69.965	ENSOCUG00000024367	-	100	69.965	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000007188	RPP38	90	42.705	ENSORLG00000009219	rpp38	96	43.253	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000007188	RPP38	89	41.912	ENSORLG00020011503	rpp38	90	40.426	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000007188	RPP38	89	41.544	ENSORLG00015017702	rpp38	93	41.356	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000007188	RPP38	89	43.462	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	43.206	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	75.972	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	74.823	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.759	ENSOARG00000004534	RPP38	100	74.468	Ovis_aries
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	75.265	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	75.265	Pan_paniscus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	98.932	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	98.932	Panthera_pardus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	74.912	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	74.912	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000007188	RPP38	93	46.241	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	46.097	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000007188	RPP38	97	55.036	ENSPSIG00000001527	RPP38	98	55.036	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.127	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	71.127	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	67.254	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	67.254	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000007188	RPP38	64	46.032	ENSPFOG00000016823	rpp38	89	46.032	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000007188	RPP38	89	41.111	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	42.066	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000007188	RPP38	87	37.066	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	38.433	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000007188	RPP38	96	40.206	ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.522	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	75.972	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	75.972	Pongo_abelii
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	76.515	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	76.596	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	41.667	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.857	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000007188	RPP38	88	44.094	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	44.128	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000007188	RPP38	98	69.065	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	69.065	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	66.901	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	66.901	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	44.161	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.750	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.754	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	43.571	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.182	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	42.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	57.651	ENSSARG00000012099	RPP38	100	57.295	Sorex_araneus
ENSPTIG00000007188	RPP38	99	56.491	ENSSPUG00000018363	-	99	56.491	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	97	53.069	ENSSPUG00000008560	-	98	53.069	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	56.794	ENSSPUG00000005237	-	100	56.794	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	43.369	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	43.617	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.579	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.579	Sus_scrofa
ENSPTIG00000007188	RPP38	91	51.527	ENSTGUG00000001366	RPP38	97	52.555	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000007188	RPP38	94	42.391	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	42.222	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	74.468	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	74.468	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	83.630	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	83.630	Ursus_americanus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	82.332	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	83.039	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000007188	RPP38	100	81.139	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	81.139	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000007188	RPP38	92	48.519	ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.387	Xenopus_tropicalis