EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000007351 (Gene tree)
Gene ID: 107180138
Gene Symbol: SRPRB
Alias: -
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31456 bases
Position: chrKE721857.1:7218689-7250144
Accession: 107180138
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000004997	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000008761	SRPRB-201	3723	XM_015539924	ENSPTIP00000004997	271 (aa)	XP_015395410	UPI000766282F

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000007351's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000007351's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.513	ENSG00000144867	SRPRB	99	95.597	Homo_sapiens
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.775	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	90.775	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	93.727	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	93.727	Bos_taurus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.775	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.775	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	95.203	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	95.203	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.620	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	92.620	Capra_hircus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.037	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	90.037	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	81.181	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	81.181	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.561	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	88.561	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	91.882	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.192	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	91.882	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	83.026	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	83.026	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	75.277	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	75.277	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	89.299	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	89.299	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000007351	SRPRB	94	90.625	ENSCGRG00000014367	Srprb	98	90.625	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	89.299	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	89.299	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	86	86.207	ENSDORG00000000764	Srprb	85	88.584	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	94.834	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	94.834	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	94.834	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	94.834	Equus_caballus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	99.262	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	99.262	Felis_catus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	87.823	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	87.823	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.251	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	92.251	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.930	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	88.930	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.930	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	88.930	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	84.871	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	91.882	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	91.882	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	91.882	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	91.882	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	89.668	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	89.668	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.513	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	91.513	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	83.764	ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.764	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.037	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	90.037	Mus_caroli
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	89.668	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	89.668	Mus_musculus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.406	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	90.406	Mus_pahari
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	89.668	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	89.668	Mus_spretus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	93.727	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	93.727	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.930	ENSNGAG00000024311	-	100	88.930	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.144	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.144	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	87.823	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	87.823	Octodon_degus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.989	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	92.989	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.406	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	90.406	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000007351	SRPRB	85	90.435	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	93.607	Ovis_aries
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.513	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	91.513	Pan_paniscus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	99.262	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	99.262	Panthera_pardus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.513	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	91.513	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.513	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	91.513	Papio_anubis
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	90.406	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	90.406	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.144	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	91.144	Pongo_abelii
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	81.919	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	81.919	Procavia_capensis
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	94.096	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	94.096	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	91.882	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000007351	SRPRB	74	88.557	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.557	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.251	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	92.251	Sorex_araneus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.989	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.989	Sus_scrofa
ENSPTIG00000007351	SRPRB	93	90.514	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	Tupaia_belangeri
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	85.978	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	85.978	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	95.203	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	95.203	Ursus_americanus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	94.834	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	94.834	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	94.465	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	94.465	Vulpes_vulpes