EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000011084 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8350 bases
Position: chrKE721816.1:7025628-7033977
Accession: 605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000010268	APOBEC_N	PF08210.11	7.7e-51	1	1
ENSPTIP00000010268	APOBEC_C	PF05240.14	2.6e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000014218	APOBEC2-201	675	-	ENSPTIP00000010268	224 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	77	35.632	ENSPTIG00000020074	AICDA	86	33.526

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.857	ENSG00000124701	APOBEC2	94	92.417	Homo_sapiens
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.592	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	57.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	88.021	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	88.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	58.115	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	58.115	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	52.604	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	52.604	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.592	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	57.592	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	97	52.294	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	56.186	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.592	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	57.592	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	97	52.294	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	56.186	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	58.639	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	58.639	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	55.300	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.564	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	84	80.526	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	74.766	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	72.775	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	76.667	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.905	ENSANAG00000026993	APOBEC2	94	91.943	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	80	50.838	ENSACLG00000026736	-	97	51.667	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	52.727	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	57.592	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	53.030	ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.040	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	89	59.500	ENSAMXG00000015966	apobec2b	70	59.500	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	89.524	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	67	89.100	Bos_taurus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.417	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	94	92.417	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	94.762	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	94	94.313	Canis_familiaris
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	95.238	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	94	94.787	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.905	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	94	91.469	Capra_hircus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.905	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	93	91.469	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.469	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	91.038	Cavia_aperea
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.469	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	91.038	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.943	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	94	91.943	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	93	92.308	ENSCATG00000010691	APOBEC2	93	91.866	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.417	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	91.981	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.381	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	94	91.943	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	80	91.111	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	91.111	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	83	78.610	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	75.355	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.857	ENSCANG00000035072	APOBEC2	94	92.417	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	90.654	ENSCGRG00001014983	Apobec2	94	90.995	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	90.654	ENSCGRG00000007835	Apobec2	94	90.995	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	53.153	ENSCSEG00000020201	apobec2a	75	56.477	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	56.021	ENSCSEG00000000690	-	69	56.021	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	92	57.488	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	57.488	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	60.104	ENSDARG00000113992	apobec2b	70	60.104	Danio_rerio
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	59.585	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	57.895	Danio_rerio
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	60.930	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	94	59.722	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	95	91.080	ENSDORG00000006447	Apobec2	93	91.038	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.047	ENSETEG00000000624	APOBEC2	93	89.623	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	81	92.857	ENSEASG00005002937	APOBEC2	93	92.737	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	93.458	ENSECAG00000006576	APOBEC2	94	93.365	Equus_caballus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	86.667	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	94	86.256	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	56.771	ENSELUG00000003736	apobec2a	66	56.771	Esox_lucius
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	97	97.696	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	97	97.696	Felis_catus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	84	66.316	ENSFALG00000003910	APOBEC2	95	62.441	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.943	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	94	91.509	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	61.257	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	61.257	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	54.450	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	54.450	Gadus_morhua
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	77	60.694	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	58.889	Gadus_morhua
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	79.581	ENSGALG00000003226	APOBEC2	96	74.419	Gallus_gallus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	55.909	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	60.733	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	57.513	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	57.513	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	57.513	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	57.513	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	83	78.075	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.857	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	92	92.417	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	53.182	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	58.115	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	54.839	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	58.549	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.995	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	90.566	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.995	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	90.566	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	53.886	ENSHCOG00000020319	apobec2a	77	53.886	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	59.067	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	59.067	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	57.436	ENSIPUG00000017355	apobec2a	54	57.436	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	93	55.660	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	55.660	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.905	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	94	91.469	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.000	ENSJJAG00000009733	Apobec2	94	89.573	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	58.421	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	58.421	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	53.182	ENSLBEG00000009422	-	66	58.115	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	89	54.229	ENSLBEG00000025214	apobec2a	81	54.229	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	93	66.029	ENSLACG00000015985	APOBEC2	89	66.029	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	90	61.194	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	61.194	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	95	92.453	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	94	92.417	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.381	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	94	91.943	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.381	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	94	91.943	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.381	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	94	91.943	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.381	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	94	91.943	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	55.000	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	58.549	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	56.364	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	60.733	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.592	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	57.592	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	54.378	ENSMZEG00005005240	-	96	52.874	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	79.581	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	79.006	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	98	91.781	ENSMAUG00000011016	Apobec2	94	92.891	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	97	90.323	ENSMICG00000043339	APOBEC2	94	90.995	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.952	ENSMOCG00000001904	Apobec2	94	90.521	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	90	55.392	ENSMMOG00000008681	apobec2b	75	55.392	Mola_mola
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	95	84.579	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	85.646	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	55.670	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	55.670	Monopterus_albus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	58.115	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	57.949	Monopterus_albus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	89.048	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	94	88.626	Mus_caroli
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	89.048	ENSMUSG00000040694	Apobec2	94	88.626	Mus_musculus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	89.524	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	89.100	Mus_pahari
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.943	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	91	91.943	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	96	87.850	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	92	88.152	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	91.905	ENSNGAG00000013717	Apobec2	94	91.469	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	59.375	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	59.375	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.592	ENSNBRG00000018806	apobec2b	61	57.592	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	92.857	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	94	92.417	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	95	85.514	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	86.190	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.521	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	94	90.654	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.521	ENSODEG00000016183	APOBEC2	93	90.094	Octodon_degus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	58.115	ENSONIG00000012289	apobec2b	69	58.115	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	86	59.067	ENSONIG00000004644	-	75	59.067	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	76	84.118	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	80.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	94	90.995	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	93	90.995	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000011084	APOBEC2	85	57.068	ENSORLG00000022372	APOBEC2	69	57.068	Oryzias_latipes
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