EuRBPDB

Description

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000011213 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11076 bases
Position: chrKE721722.1:499-11574
Accession: 102970513
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000010484	IBN_N	PF03810.19	4.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000014446	TNPO2-201	2256	XM_015536276	ENSPTIP00000010484	751 (aa)	XP_015391762	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000011213	TNPO2	99	79.145	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	79.145

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSG00000105576	TNPO2	96	99.048	Homo_sapiens
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSAPOG00000009339	TNPO2	85	86.207	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	91	84.181	ENSAPOG00000013185	-	93	84.181	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	91.489	ENSAMEG00000012123	TNPO2	84	91.489	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.772	ENSACIG00000007518	tnpo2	96	86.772	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSACIG00000009586	-	98	86.207	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSAOCG00000010152	-	85	86.207	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	87.973	ENSAOCG00000010374	tnpo2	93	87.973	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSAPEG00000013268	-	85	86.207	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	87.838	ENSAPEG00000008429	tnpo2	85	87.838	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.074	ENSATEG00000019171	-	85	86.074	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.340	ENSATEG00000024761	TNPO2	85	85.942	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	89.243	ENSACAG00000003576	TNPO2	85	89.243	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSANAG00000036645	TNPO2	85	93.484	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.605	ENSACLG00000001853	tnpo2	85	86.605	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	81.976	ENSACLG00000020672	-	84	82.109	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.007	ENSAMXG00000010246	tnpo2	88	85.975	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.218	ENSBTAG00000011811	TNPO2	96	93.139	Bos_taurus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSCJAG00000005096	TNPO2	84	93.617	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSCAFG00000017226	TNPO2	72	93.484	Canis_familiaris
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSCAFG00020005115	TNPO2	85	93.484	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	92.236	ENSCHIG00000011718	TNPO2	84	92.236	Capra_hircus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSTSYG00000003828	TNPO2	85	93.351	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000011213	TNPO2	91	91.139	ENSCAPG00000015700	TNPO2	82	91.139	Cavia_aperea
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.085	ENSCPOG00000007033	TNPO2	85	93.085	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSCCAG00000024574	TNPO2	85	93.484	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSCATG00000042599	TNPO2	84	93.617	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.218	ENSCLAG00000013442	TNPO2	85	93.085	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSCSAG00000006597	TNPO2	85	93.484	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	89.774	ENSCPBG00000023892	TNPO2	85	89.641	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000011213	TNPO2	96	92.503	ENSCANG00000027834	TNPO2	84	93.342	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	84	93.617	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	85	93.484	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	83.422	ENSCSEG00000012923	tnpo2	85	83.289	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	99	85.007	ENSCSEG00000011477	-	97	85.279	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSCVAG00000001908	TNPO2	85	86.207	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	84.901	ENSCVAG00000002750	tnpo2	85	84.901	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	83.024	ENSDARG00000038239	tnpo2	85	83.289	Danio_rerio
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	82.580	ENSDNOG00000043264	TNPO2	81	82.580	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSDORG00000014993	Tnpo2	87	93.351	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000011213	TNPO2	99	69.131	FBgn0024921	Tnpo	85	69.525	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000011213	TNPO2	87	83.538	ENSETEG00000014785	TNPO2	75	83.538	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.218	ENSEASG00005004160	TNPO2	85	93.218	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSECAG00000013673	TNPO2	85	93.351	Equus_caballus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.379	ENSELUG00000008680	tnpo2	85	85.379	Esox_lucius
ENSPTIG00000011213	TNPO2	89	88.235	ENSELUG00000016542	-	96	77.147	Esox_lucius
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSFCAG00000000467	TNPO2	84	93.484	Felis_catus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSFDAG00000021543	TNPO2	85	93.218	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.033	ENSFHEG00000016501	tnpo2	85	85.033	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSFHEG00000009734	TNPO2	86	86.207	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	77.926	ENSGMOG00000009021	tnpo2	84	77.926	Gadus_morhua
ENSPTIG00000011213	TNPO2	89	90.110	ENSGMOG00000014237	-	84	90.110	Gadus_morhua
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.563	ENSGAFG00000018993	tnpo2	85	85.563	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.074	ENSGAFG00000010401	TNPO2	85	86.074	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	89.907	ENSGAGG00000010150	TNPO2	85	89.774	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSHBUG00000018317	-	85	86.207	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.605	ENSHBUG00000014849	tnpo2	85	86.605	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.218	ENSHGLG00000016928	TNPO2	85	93.218	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	92.686	ENSHGLG00100009938	TNPO2	84	92.686	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSHCOG00000020440	-	85	86.207	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.279	ENSHCOG00000005914	tnpo2	85	85.013	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.340	ENSIPUG00000005768	tnpo2	85	86.340	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.942	ENSIPUG00000006884	TNPO2	84	85.942	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSSTOG00000006952	TNPO2	85	93.351	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	84	93.617	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	84.441	ENSKMAG00000021274	TNPO2	85	84.441	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.074	ENSKMAG00000018430	TNPO2	85	86.074	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.472	ENSLBEG00000005301	-	85	86.472	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.340	ENSLBEG00000026241	tnpo2	87	86.340	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	84.707	ENSLACG00000012322	TNPO2	84	84.707	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	87.533	ENSLOCG00000006178	tnpo2	84	87.533	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSLAFG00000003661	TNPO2	84	93.351	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSMFAG00000037531	TNPO2	84	93.617	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSMMUG00000005684	TNPO2	85	93.484	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSMNEG00000041024	TNPO2	85	93.484	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000011213	TNPO2	95	93.478	ENSMLEG00000018391	TNPO2	83	93.478	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	85.151	ENSMAMG00000023658	tnpo2	95	85.020	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSMAMG00000011862	-	85	86.207	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.605	ENSMZEG00005023965	tnpo2	85	86.605	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	83.333	ENSMZEG00005011298	TNPO2	84	83.733	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSMZEG00005007408	-	85	86.207	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSMICG00000016153	TNPO2	85	93.484	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	85	93.484	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSMMOG00000021390	TNPO2	96	86.207	Mola_mola
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	82.400	ENSMMOG00000005063	TNPO2	91	82.133	Mola_mola
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	91.114	ENSMODG00000006888	TNPO2	84	90.981	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	84.748	ENSMALG00000004721	tnpo2	85	85.146	Monopterus_albus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.074	ENSMALG00000006232	TNPO2	85	86.074	Monopterus_albus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	85	93.218	Mus_caroli
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	85	93.218	Mus_musculus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.218	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	85	93.085	Mus_pahari
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	85	93.218	Mus_spretus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.484	ENSMPUG00000004663	TNPO2	85	93.484	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000011213	TNPO2	95	93.207	ENSMLUG00000012669	TNPO2	86	93.207	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.617	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	85	93.484	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	83.129	ENSNBRG00000006242	TNPO2	84	83.129	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSNBRG00000023849	TNPO2	85	86.207	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	88.131	ENSNLEG00000012758	TNPO2	85	87.924	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	84.085	ENSMEUG00000016658	TNPO2	84	84.483	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	ENSODEG00000009670	TNPO2	85	93.218	Octodon_degus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.472	ENSONIG00000002147	tnpo2	85	86.472	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.340	ENSONIG00000017706	-	84	86.340	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	99	89.687	ENSOANG00000010051	TNPO2	85	89.641	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	86	94.208	ENSOCUG00000008251	TNPO2	75	94.208	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSORLG00000010363	tnpo2	85	86.207	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000011213	TNPO2	62	84.472	ENSORLG00000011763	TNPO2	96	84.886	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSORLG00020015785	tnpo2	85	86.207	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000011213	TNPO2	62	84.472	ENSORLG00020001020	TNPO2	96	84.679	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000011213	TNPO2	62	84.472	ENSORLG00015003941	TNPO2	96	84.886	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.170	ENSORLG00015005489	tnpo2	85	86.170	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.340	ENSOMEG00000013440	TNPO2	85	86.340	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	ENSOMEG00000014877	TNPO2	85	85.942	Oryzias_melastigma
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