EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000012018 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CPEB3
Alias: -
Full Name: cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 155413 bases
Position: chrKE721729.1:4871509-5026921
Accession: 102953092
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000011761	RRM_1	PF00076.22	1.3e-12	1	1
ENSPTIP00000011753	RRM_1	PF00076.22	1.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000015758	CPEB3-201	1986	XM_015536601	ENSPTIP00000011753	661 (aa)	XP_015392087	-
ENSPTIT00000015766	CPEB3-202	897	-	ENSPTIP00000011761	298 (aa)	-	UPI000C2D6CB9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	92.123	ENSPTIG00000015408	CPEB4	86	92.123
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	90.785	ENSPTIG00000015956	-	76	70.021

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSG00000107864	CPEB3	62	99.770	Homo_sapiens
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSAPOG00000003625	cpeb3	67	87.054	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSAMEG00000014204	CPEB3	69	95.585	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSACIG00000001933	cpeb3	67	85.746	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSAOCG00000015423	cpeb3	67	85.307	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSATEG00000010649	cpeb3	65	83.259	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	91.837	ENSAPLG00000014437	CPEB4	99	89.180	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSACAG00000006335	CPEB3	67	94.714	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSANAG00000037406	CPEB3	62	99.770	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSACLG00000018590	cpeb3	60	85.495	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSBTAG00000015450	CPEB3	93	97.000	Bos_taurus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCJAG00000008495	CPEB3	63	97.523	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSCAFG00000007423	CPEB3	62	92.584	Canis_familiaris
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSCAFG00020001981	CPEB3	88	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSCHIG00000017337	CPEB3	62	100.000	Capra_hircus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.635	ENSTSYG00000003928	CPEB3	61	99.764	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCCAG00000033267	CPEB3	62	99.770	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCATG00000038447	CPEB3	63	95.796	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCLAG00000011817	CPEB3	90	97.072	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCSAG00000006579	CPEB3	61	92.342	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	86.149	ENSCHOG00000000272	-	100	90.358	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCPBG00000023779	CPEB3	67	95.964	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCANG00000040306	CPEB3	63	95.796	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCGRG00001003846	Cpeb3	62	99.540	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSCGRG00000002839	Cpeb3	100	97.108	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSCSEG00000008423	cpeb3	73	76.496	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSCVAG00000005998	cpeb3	69	83.628	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	96.194	ENSDARG00000060103	cpeb3	72	77.582	Danio_rerio
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	89.298	ENSDNOG00000048639	CPEB3	63	94.064	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSDORG00000028940	Cpeb3	63	95.796	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.517	ENSETEG00000000111	CPEB3	63	92.414	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	91.468	ENSEBUG00000010745	cpeb3	58	73.187	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSEASG00005011095	CPEB3	63	97.748	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSECAG00000000077	CPEB3	63	97.748	Equus_caballus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSELUG00000019251	cpeb3	68	88.288	Esox_lucius
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSFCAG00000032380	CPEB3	63	96.026	Felis_catus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSFALG00000007952	CPEB3	57	89.868	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSFDAG00000016459	CPEB3	62	99.765	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSFHEG00000021371	cpeb3	66	83.371	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	72	94.884	ENSGMOG00000008307	cpeb3	63	85.942	Gadus_morhua
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSGALG00000006912	CPEB3	66	96.413	Gallus_gallus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	96	94.774	ENSGACG00000002944	cpeb3	66	85.523	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSGAGG00000008528	CPEB3	67	95.964	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSGGOG00000016441	CPEB3	63	97.523	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSHBUG00000004097	cpeb3	63	85.714	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSHGLG00000014022	CPEB3	62	99.310	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSHGLG00100005200	CPEB3	64	99.080	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.138	ENSHCOG00000005747	cpeb3	67	84.910	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.862	ENSIPUG00000018571	cpeb3	68	85.841	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSSTOG00000028061	CPEB3	64	99.770	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSJJAG00000009135	Cpeb3	100	97.349	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSLBEG00000025961	cpeb3	67	86.830	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	98.966	ENSLACG00000011307	CPEB3	62	87.583	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	96.552	ENSLOCG00000007131	cpeb3	70	87.004	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSLAFG00000018716	CPEB3	89	90.708	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.635	ENSMFAG00000025613	CPEB3	64	99.770	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMMUG00000015050	CPEB3	63	95.796	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMNEG00000045465	CPEB3	63	95.796	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.635	ENSMLEG00000031794	CPEB3	72	99.070	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSMAMG00000012794	cpeb3	66	87.668	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSMZEG00005012068	cpeb3	67	85.495	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMGAG00000009148	CPEB3	65	89.868	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMAUG00000002789	Cpeb3	63	95.796	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.310	ENSMICG00000026866	CPEB3	62	97.297	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMOCG00000016486	Cpeb3	62	99.770	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000012018	CPEB3	90	95.131	ENSMMOG00000008209	cpeb3	56	83.135	Mola_mola
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMODG00000006673	CPEB3	60	90.487	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.517	ENSMALG00000009305	cpeb3	90	92.053	Monopterus_albus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	MGP_CAROLIEiJ_G0022910	Cpeb3	100	97.349	Mus_caroli
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSMUSG00000039652	Cpeb3	100	97.349	Mus_musculus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	MGP_PahariEiJ_G0014405	Cpeb3	100	97.349	Mus_pahari
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	MGP_SPRETEiJ_G0023829	Cpeb3	100	97.349	Mus_spretus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSMPUG00000017227	CPEB3	62	90.949	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSNGAG00000015621	Cpeb3	63	97.297	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSNBRG00000018343	cpeb3	60	82.340	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSNLEG00000012600	CPEB3	63	95.796	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	98.621	ENSMEUG00000009948	-	52	93.113	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSODEG00000004591	CPEB3	61	99.310	Octodon_degus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.310	ENSOANG00000015723	-	100	93.333	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSOCUG00000010454	CPEB3	63	95.796	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSORLG00000000726	cpeb3	68	80.942	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSORLG00020004475	cpeb3	67	81.757	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSORLG00015011683	cpeb3	68	84.753	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSOMEG00000018265	cpeb3	61	80.856	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	98.966	ENSOGAG00000002002	CPEB3	61	91.892	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSOARG00000016671	CPEB3	62	92.568	Ovis_aries
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.635	ENSPPAG00000031528	CPEB3	73	99.540	Pan_paniscus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	100.000	ENSPPRG00000015654	CPEB3	62	92.584	Panthera_pardus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSPTRG00000002753	CPEB3	62	99.770	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.635	ENSPANG00000021561	CPEB3	63	99.770	Papio_anubis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSPKIG00000015878	cpeb3	66	88.341	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	92.759	ENSPMGG00000022722	cpeb3	70	78.444	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSPEMG00000008448	Cpeb3	63	95.796	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.310	ENSPCIG00000017302	CPEB3	61	97.072	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSPFOG00000011231	cpeb3	69	80.531	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSPLAG00000002852	cpeb3	67	85.811	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.828	ENSPMEG00000021572	cpeb3	67	85.811	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	94.483	ENSPREG00000003085	cpeb3	67	85.811	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSPPYG00000002481	CPEB3	60	81.532	Pongo_abelii
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	89.865	ENSPCAG00000012417	CPEB3	62	94.023	Procavia_capensis
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.310	ENSPCOG00000023690	CPEB3	63	95.575	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000012018	CPEB3	99	97.297	ENSPVAG00000007664	CPEB3	52	99.449	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	ENSPNYG00000005300	cpeb3	67	85.714	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.862	ENSPNAG00000012111	cpeb3	67	85.495	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.310	ENSRNOG00000020689	Cpeb3	57	90.487	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSRBIG00000041079	CPEB3	63	95.796	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSRROG00000031558	CPEB3	63	97.523	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	99.655	ENSSBOG00000035843	CPEB3	100	91.667	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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