EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000012059 (Gene tree)
Gene ID: 102972177
Gene Symbol: RPUSD4
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase D4
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10454 bases
Position: chrKE721767.1:9091131-9101584
Accession: 102972177
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000011742	PseudoU_synth_2	PF00849.22	1.3e-33	1	1
ENSPTIP00000011754	PseudoU_synth_2	PF00849.22	2.9e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000015747	RPUSD4-201	2073	XM_007082711	ENSPTIP00000011742	377 (aa)	XP_007082773	UPI00042C0C63
ENSPTIT00000015759	RPUSD4-202	1984	-	ENSPTIP00000011754	349 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	79	30.068	ENSPTIG00000006828	RPUSD3	82	30.068

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.167	ENSG00000165526	RPUSD4	100	81.167	Homo_sapiens
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	52.903	ENSAPOG00000011024	rpusd4	84	50.442	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	88.594	ENSAMEG00000000127	-	100	88.594	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	86	87.805	ENSAMEG00000005953	-	100	90.991	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	50.814	ENSACIG00000003533	rpusd4	98	48.521	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	52.581	ENSAOCG00000015409	rpusd4	81	51.524	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	52.903	ENSAPEG00000018935	rpusd4	81	51.829	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	54.636	ENSATEG00000008059	rpusd4	79	53.251	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	79	62.455	ENSAPLG00000013250	RPUSD4	99	61.092	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	64.052	ENSACAG00000000189	RPUSD4	92	62.090	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	81.941	ENSANAG00000024050	RPUSD4	99	81.941	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	53.420	ENSACLG00000020996	rpusd4	86	51.327	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	86	51.645	ENSAMXG00000031479	rpusd4	95	48.961	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	79.894	ENSBTAG00000020900	RPUSD4	100	79.894	Bos_taurus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	82.703	ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	85.185	ENSCAFG00000010488	RPUSD4	100	85.185	Canis_familiaris
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	85.185	ENSCAFG00020010621	RPUSD4	100	85.185	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	79.947	ENSCHIG00000009975	RPUSD4	100	79.683	Capra_hircus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	85.411	ENSTSYG00000008456	RPUSD4	100	85.411	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	74	77.132	ENSCAPG00000006040	RPUSD4	100	77.132	Cavia_aperea
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	78.780	ENSCPOG00000014971	RPUSD4	100	78.780	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	83.019	ENSCCAG00000027838	RPUSD4	99	83.019	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	82.228	ENSCATG00000041570	RPUSD4	100	82.228	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	82.228	ENSCLAG00000016553	RPUSD4	100	82.228	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSCSAG00000002274	RPUSD4	100	81.698	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	81	84.452	ENSCHOG00000010249	RPUSD4	100	84.452	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	81	68.182	ENSCPBG00000011175	RPUSD4	99	68.182	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	77	42.086	ENSCSAVG00000000872	-	54	42.086	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.371	ENSCANG00000039684	RPUSD4	100	80.371	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSCGRG00001024141	Rpusd4	100	81.698	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSCGRG00000014415	Rpusd4	100	81.698	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	88	51.757	ENSCVAG00000008761	rpusd4	83	51.840	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	88	52.077	ENSCVAG00000000392	rpusd4	93	51.360	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	50.654	ENSDARG00000012674	rpusd4	91	49.538	Danio_rerio
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.106	ENSDNOG00000020026	RPUSD4	100	80.106	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	82.493	ENSDORG00000016717	Rpusd4	100	82.493	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	99	80.481	ENSETEG00000013953	RPUSD4	99	80.481	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	84.350	ENSEASG00005022982	RPUSD4	100	84.350	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	84.085	ENSECAG00000000557	RPUSD4	100	84.085	Equus_caballus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	81	81.183	ENSEEUG00000014036	RPUSD4	81	81.183	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	88	57.097	ENSELUG00000008075	rpusd4	89	53.936	Esox_lucius
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	99.204	ENSFCAG00000029789	RPUSD4	100	99.204	Felis_catus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	86	62.126	ENSFALG00000005171	RPUSD4	98	59.940	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	80.863	ENSFDAG00000014307	RPUSD4	98	80.863	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	52.273	ENSFHEG00000004329	rpusd4	86	50.898	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	52.174	ENSGMOG00000017726	rpusd4	96	51.227	Gadus_morhua
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	79	65.343	ENSGALG00000024326	RPUSD4	93	59.880	Gallus_gallus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	88	49.196	ENSGAFG00000021559	rpusd4	88	47.143	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	49.701	ENSGACG00000001657	rpusd4	100	50.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	67.333	ENSGAGG00000000132	RPUSD4	98	61.064	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.902	ENSGGOG00000016494	RPUSD4	100	80.902	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	53.420	ENSHBUG00000022838	rpusd4	86	51.327	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.371	ENSHGLG00000002285	RPUSD4	100	80.371	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.371	ENSHGLG00100006385	RPUSD4	100	80.371	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	88	51.125	ENSHCOG00000006612	rpusd4	83	51.064	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	52.117	ENSIPUG00000023879	rusd4	84	51.534	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	97	81.868	ENSSTOG00000025280	RPUSD4	100	81.868	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	81.132	ENSJJAG00000018673	Rpusd4	99	81.132	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	95	51.093	ENSKMAG00000021805	rpusd4	95	51.093	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	51.613	ENSLBEG00000020394	rpusd4	91	50.305	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	65.101	ENSLACG00000011028	RPUSD4	82	62.654	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	86	49.695	ENSLOCG00000003124	rpusd4	87	49.390	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.902	ENSLAFG00000005211	RPUSD4	100	80.902	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.963	ENSMFAG00000039513	RPUSD4	100	81.963	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSMMUG00000007933	RPUSD4	100	81.698	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSMNEG00000027414	RPUSD4	100	81.698	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSMLEG00000042461	RPUSD4	100	81.698	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	86	50.485	ENSMAMG00000023839	rpusd4	85	48.943	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	53.420	ENSMZEG00005011999	rpusd4	86	51.327	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	78	63.636	ENSMGAG00000000840	RPUSD4	98	59.875	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.637	ENSMAUG00000010280	Rpusd4	100	80.637	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	83.024	ENSMICG00000015979	RPUSD4	100	83.024	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	77.719	ENSMOCG00000000661	Rpusd4	100	77.719	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	84	54.515	ENSMMOG00000021731	rpusd4	88	54.515	Mola_mola
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	92	72.622	ENSMODG00000004521	RPUSD4	89	72.622	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	51.456	ENSMALG00000005839	rpusd4	97	50.464	Monopterus_albus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	78.249	MGP_CAROLIEiJ_G0031954	Rpusd4	100	78.249	Mus_caroli
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	78.249	ENSMUSG00000032044	Rpusd4	100	78.249	Mus_musculus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	78.780	MGP_PahariEiJ_G0014819	Rpusd4	100	78.780	Mus_pahari
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	77.984	MGP_SPRETEiJ_G0033078	Rpusd4	100	77.984	Mus_spretus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	99	86.863	ENSMPUG00000006608	RPUSD4	99	86.863	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	97	83.562	ENSMLUG00000017328	-	96	83.562	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	73	86.220	ENSMLUG00000029348	-	100	86.220	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	99	80.697	ENSNGAG00000020847	Rpusd4	99	80.697	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	53.746	ENSNBRG00000005207	rpusd4	98	51.622	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	82.210	ENSNLEG00000007465	RPUSD4	98	82.210	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	68.649	ENSMEUG00000004370	RPUSD4	99	68.649	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	70	60.755	ENSOPRG00000013141	-	100	60.755	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	80.371	ENSODEG00000004577	RPUSD4	100	80.371	Octodon_degus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	95	49.315	ENSONIG00000018879	rpusd4	97	49.315	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	83	68.027	ENSOANG00000007247	RPUSD4	95	67.677	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	81.402	ENSOCUG00000017039	RPUSD4	98	81.402	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	90	48.980	ENSORLG00000002750	rpusd4	93	48.980	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	52.318	ENSORLG00020002044	rpusd4	82	49.850	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	52.649	ENSORLG00015020034	rpusd4	82	49.850	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	82	56.164	ENSOMEG00000004861	rpusd4	79	52.941	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	79.894	ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.894	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	80.541	ENSOARG00000012238	RPUSD4	97	80.270	Ovis_aries
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.432	ENSPPAG00000042883	RPUSD4	93	81.432	Pan_paniscus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	100.000	ENSPPRG00000003081	RPUSD4	100	100.000	Panthera_pardus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.167	ENSPTRG00000004454	RPUSD4	100	81.167	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	81.698	ENSPANG00000015040	RPUSD4	100	81.698	Papio_anubis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	59.416	ENSPKIG00000023986	rpusd4	86	57.101	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	85	67.333	ENSPSIG00000014268	RPUSD4	95	67.333	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	90	48.711	ENSPMGG00000002806	rpusd4	97	48.711	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	74.801	ENSPEMG00000000278	Rpusd4	100	74.801	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	87	45.373	ENSPMAG00000008183	rpusd4	97	43.881	Petromyzon_marinus
ENSPTIG00000012059	RPUSD4	97	70.879	ENSPCIG00000010212	RPUSD4	100	70.879	Phascolarctos_cinereus
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