EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000012237 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: -
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8708 bases
Position: chrKE721660.1:268947-277654
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000012057	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	5.8e-26	1	1
ENSPTIP00000012046	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	1.4e-25	1	1
ENSPTIP00000012016	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	2.5e-25	1	1
ENSPTIP00000012057	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.5e-16	1	1
ENSPTIP00000012016	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000016070	POLR2E-203	465	-	ENSPTIP00000012057	155 (aa)	-	-
ENSPTIT00000016059	POLR2E-202	555	-	ENSPTIP00000012046	184 (aa)	-	-
ENSPTIT00000016029	POLR2E-201	468	-	ENSPTIP00000012016	155 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000012237's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000012237's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSG00000099817	POLR2E	90	89.697	Homo_sapiens
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSAPOG00000002935	polr2eb	90	85.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSAMEG00000003159	POLR2E	91	77.604	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	86.061	ENSACIG00000024371	polr2eb	90	86.061	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSAOCG00000018166	polr2eb	90	85.455	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSAPEG00000009000	polr2eb	91	73.438	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSATEG00000023760	polr2eb	90	85.455	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSANAG00000038488	POLR2E	89	90.303	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSACLG00000005254	polr2eb	90	86.061	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSAMXG00000018915	POLR2E	91	73.438	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSBTAG00000020776	POLR2E	91	77.604	Bos_taurus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	72.368	WBGene00019246	rpb-5	91	61.458	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000012237	POLR2E	59	92.391	ENSCJAG00000007666	-	51	92.391	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCAFG00000019546	POLR2E	91	76.562	Canis_familiaris
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCAFG00020017111	POLR2E	91	77.604	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCHIG00000014151	POLR2E	91	77.604	Capra_hircus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	86	92.537	ENSTSYG00000026377	POLR2E	96	69.841	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000012237	POLR2E	93	98.611	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	78.010	Cavia_aperea
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCPOG00000001542	POLR2E	91	77.604	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCCAG00000025658	POLR2E	90	90.303	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCATG00000008926	POLR2E	90	90.303	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSCLAG00000014874	-	91	77.083	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	70.395	ENSCLAG00000009238	-	96	53.030	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCSAG00000012336	POLR2E	91	77.604	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSCPBG00000009702	POLR2E	91	77.083	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	81.579	ENSCING00000024933	-	96	63.235	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSCANG00000025560	POLR2E	90	90.303	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSCGRG00001022927	Polr2e	91	77.083	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000012237	POLR2E	94	94.483	ENSCGRG00000016441	Polr2e	96	69.231	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSCSEG00000007107	polr2eb	90	84.848	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSCVAG00000019940	polr2eb	90	85.455	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.816	ENSDARG00000026183	polr2eb	91	72.396	Danio_rerio
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSDNOG00000044994	POLR2E	67	94.079	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSDORG00000001154	Polr2e	91	77.604	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	80.921	FBgn0033571	Rpb5	96	61.386	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	85.034	ENSEBUG00000010159	-	71	85.034	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000012237	POLR2E	63	89.691	ENSEASG00005021615	POLR2E	66	61.491	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSECAG00000011124	POLR2E	90	90.303	Equus_caballus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.158	ENSELUG00000020646	polr2e	90	83.030	Esox_lucius
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.158	ENSELUG00000005815	POLR2E	90	83.636	Esox_lucius
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSFCAG00000007318	POLR2E	91	90.303	Felis_catus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	93	97.917	ENSFALG00000013986	POLR2E	98	77.487	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSFDAG00000014539	POLR2E	91	77.604	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSFHEG00000022398	polr2eb	90	85.455	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	89.474	ENSGMOG00000007615	polr2eb	91	71.875	Gadus_morhua
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSGALG00000002591	POLR2E	91	77.083	Gallus_gallus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSGAFG00000005087	polr2eb	90	86.061	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.158	ENSGACG00000013247	polr2eb	96	67.157	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSGAGG00000008356	POLR2E	91	77.083	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSGGOG00000011267	POLR2E	90	90.303	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000012237	POLR2E	61	87.234	ENSHBUG00000011099	polr2eb	99	75.439	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	92.763	ENSHGLG00000013330	POLR2E	91	76.562	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	92.763	ENSHGLG00100011014	POLR2E	91	76.562	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.158	ENSHCOG00000000906	polr2eb	90	83.636	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	72	91.071	ENSHCOG00000012099	-	88	91.071	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSIPUG00000019801	polr2e	91	73.438	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSSTOG00000002853	POLR2E	91	77.604	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSJJAG00000016595	-	91	77.083	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	83.030	ENSJJAG00000003145	-	90	83.030	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	97	79.470	ENSJJAG00000015812	-	95	79.470	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSKMAG00000005954	polr2eb	91	73.438	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSLBEG00000024802	polr2eb	90	85.455	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSLACG00000013686	POLR2E	91	73.438	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSLOCG00000004599	POLR2E	94	90.789	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	93	70.345	ENSLAFG00000025587	POLR2E	96	50.971	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSMFAG00000002884	POLR2E	90	90.303	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSMMUG00000013927	POLR2E	90	90.303	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	97.279	ENSMNEG00000034046	-	90	90.303	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	67.308	ENSMNEG00000033452	-	83	67.308	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000012237	POLR2E	100	69.643	ENSMLEG00000012405	POLR2E	95	69.643	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSMAMG00000018703	polr2eb	90	85.455	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSMZEG00005010796	polr2eb	90	86.061	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	91.503	ENSMGAG00000003769	POLR2E	91	75.648	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000012237	POLR2E	92	67.133	ENSMAUG00000011003	-	94	54.054	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	97.279	ENSMAUG00000010125	-	99	77.368	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	97.279	ENSMICG00000013063	POLR2E	90	90.303	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSMOCG00000013414	Polr2e	91	77.083	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	85.034	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	65.263	Mola_mola
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	84.242	ENSMMOG00000001161	polr2eb	90	84.242	Mola_mola
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSMODG00000005494	POLR2E	91	77.083	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSMALG00000021888	polr2eb	91	73.958	Monopterus_albus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	91	77.083	Mus_caroli
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSMUSG00000004667	Polr2e	91	77.083	Mus_musculus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	91	77.083	Mus_pahari
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	91	77.083	Mus_spretus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSMPUG00000008953	POLR2E	91	77.083	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000012237	POLR2E	83	86.719	ENSMLUG00000006376	-	94	75.658	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSMLUG00000013193	POLR2E	91	77.604	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSNGAG00000001147	Polr2e	91	77.083	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	70.395	ENSNGAG00000017344	-	79	70.395	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	86.061	ENSNBRG00000022772	polr2eb	90	86.061	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	71.711	ENSNLEG00000031364	-	91	65.556	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.889	ENSNLEG00000001207	-	90	85.542	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	78.289	ENSOPRG00000008331	POLR2E	91	64.583	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSODEG00000013230	-	91	77.604	Octodon_degus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	84.211	ENSODEG00000007985	-	81	84.211	Octodon_degus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	69.697	ENSODEG00000011490	-	89	69.697	Octodon_degus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSONIG00000002519	polr2eb	91	73.958	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSORLG00000015346	polr2eb	90	86.061	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSORLG00020020700	polr2e	90	86.061	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSORLG00015016842	polr2e	90	86.061	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSOMEG00000002709	polr2eb	91	73.438	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSOGAG00000012311	POLR2E	91	77.604	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSOARG00000010994	POLR2E	91	77.604	Ovis_aries
ENSPTIG00000012237	POLR2E	92	99.301	ENSPPAG00000003145	POLR2E	99	90.798	Pan_paniscus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSPPRG00000000777	POLR2E	91	90.303	Panthera_pardus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSPTRG00000010183	POLR2E	90	90.303	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSPANG00000018011	POLR2E	90	90.303	Papio_anubis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.816	ENSPKIG00000009607	POLR2E	90	84.242	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	88.816	ENSPKIG00000024123	POLR2E	90	84.242	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000012237	POLR2E	96	94.631	ENSPSIG00000002870	POLR2E	93	77.202	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	85.455	ENSPMGG00000014354	polr2eb	90	85.455	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.737	ENSPEMG00000023261	Polr2e	91	77.083	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSPCIG00000007312	POLR2E	60	93.421	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSPFOG00000005734	polr2eb	91	73.958	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSPLAG00000014496	polr2eb	90	86.061	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSPMEG00000008053	polr2eb	90	86.061	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSPREG00000006489	polr2eb	90	86.061	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	84.314	ENSPPYG00000009305	POLR2E	96	73.039	Pongo_abelii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	54	98.810	ENSPCAG00000016605	POLR2E	76	98.810	Procavia_capensis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSPCOG00000014491	POLR2E	89	90.303	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000012237	POLR2E	64	98.990	ENSPVAG00000007718	-	51	93.519	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSPNYG00000019797	polr2eb	77	90.789	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	89.474	ENSPNAG00000026263	POLR2E	90	84.848	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000012237	POLR2E	95	97.959	ENSRNOG00000013545	Polr2e	95	77.487	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	97	72.185	ENSRBIG00000027259	-	96	51.546	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSRBIG00000028726	-	90	90.303	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSRROG00000043763	POLR2E	90	90.303	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	37.037	YBR154C	RPB5	94	35.238	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPTIG00000012237	POLR2E	99	94.156	ENSSBOG00000027241	POLR2E	90	90.303	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	93.421	ENSSHAG00000010690	POLR2E	91	77.083	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSSFOG00015006073	polr2e	90	85.455	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSSMAG00000012782	polr2eb	89	76.364	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSSDUG00000003352	polr2eb	90	85.455	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSSLDG00000004965	polr2eb	90	85.455	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	91.447	ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	75.521	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSSPAG00000017556	polr2eb	90	85.455	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSSSCG00000021472	POLR2E	91	77.604	Sus_scrofa
ENSPTIG00000012237	POLR2E	83	83.077	ENSTGUG00000000922	POLR2E	92	83.077	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000012237	POLR2E	92	95.105	ENSTRUG00000018238	polr2eb	90	85.455	Takifugu_rubripes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	ENSTNIG00000013187	polr2eb	91	73.438	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	77.604	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSUAMG00000009166	POLR2E	90	89.697	Ursus_americanus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	ENSVVUG00000022818	POLR2E	50	77.604	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	92.105	ENSXETG00000003291	polr2e	91	75.521	Xenopus_tropicalis
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	86.061	ENSXCOG00000009197	polr2eb	90	86.061	Xiphophorus_couchianus
ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.789	ENSXMAG00000026495	polr2eb	90	86.061	Xiphophorus_maculatus