EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000012577 (Gene tree)
Gene ID: 102963296
Gene Symbol: URB2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27819 bases
Position: chrKE721834.1:822396-850214
Accession: 102963296
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000012544	Urb2	PF10441.9	3.2e-25	1	1
ENSPTIP00000012555	Urb2	PF10441.9	1e-24	1	1
ENSPTIP00000012564	Urb2	PF10441.9	8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000016592	URB2-203	4641	XM_007086005	ENSPTIP00000012564	1445 (aa)	XP_007086067	-
ENSPTIT00000016583	URB2-202	4692	-	ENSPTIP00000012555	1462 (aa)	-	-
ENSPTIT00000016572	URB2-201	5292	XM_007086004	ENSPTIP00000012544	1521 (aa)	XP_007086066	UPI00042BF933

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSG00000135763	URB2	99	86.747	Homo_sapiens
ENSPTIG00000012577	URB2	93	35.793	ENSAPOG00000000608	urb2	94	35.828	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	90.769	ENSAMEG00000009206	URB2	95	90.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000012577	URB2	96	75.000	ENSAOCG00000019961	urb2	89	75.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000012577	URB2	96	75.000	ENSAPEG00000005263	urb2	89	75.000	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000012577	URB2	99	34.553	ENSATEG00000020930	urb2	99	34.246	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000012577	URB2	97	68.182	ENSAPLG00000002998	URB2	95	68.182	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000012577	URB2	100	56.061	ENSACAG00000001285	URB2	95	56.061	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSANAG00000033963	URB2	95	90.909	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000012577	URB2	93	35.027	ENSACLG00000009254	urb2	95	34.708	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000012577	URB2	100	56.061	ENSAMXG00000003474	urb2	95	56.061	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	73.867	ENSBTAG00000010180	URB2	99	73.867	Bos_taurus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	88.636	ENSCJAG00000010968	URB2	96	88.636	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSCAFG00000012118	URB2	95	90.909	Canis_familiaris
ENSPTIG00000012577	URB2	93	90.909	ENSCAFG00020027217	URB2	94	90.909	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000012577	URB2	99	81.538	ENSCHIG00000014513	URB2	95	81.538	Capra_hircus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	84.375	ENSTSYG00000006924	URB2	95	84.375	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000012577	URB2	64	80.556	ENSCPOG00000020777	-	100	80.556	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSCCAG00000023932	URB2	95	89.394	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSCATG00000043366	URB2	95	87.879	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000012577	URB2	100	74.458	ENSCLAG00000006268	URB2	100	74.458	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000012577	URB2	100	88.636	ENSCSAG00000010599	URB2	96	88.636	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000012577	URB2	67	86.364	ENSCHOG00000010163	URB2	71	81.497	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000012577	URB2	100	66.667	ENSCPBG00000006191	URB2	95	66.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSCANG00000023711	URB2	95	87.879	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSCGRG00001009591	Urb2	96	90.909	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSCGRG00000011259	Urb2	96	90.909	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000012577	URB2	99	35.374	ENSCSEG00000000299	urb2	99	35.374	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000012577	URB2	99	55.385	ENSCVAG00000011011	urb2	95	55.385	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	51.515	ENSDARG00000003217	urb2	94	61.165	Danio_rerio
ENSPTIG00000012577	URB2	97	61.689	ENSDNOG00000043064	URB2	99	61.808	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	84.848	ENSDORG00000014975	Urb2	95	84.848	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000012577	URB2	95	81.250	ENSETEG00000002869	URB2	90	81.250	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSEASG00005012060	URB2	95	89.231	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	89.231	ENSECAG00000012338	URB2	99	88.652	Equus_caballus
ENSPTIG00000012577	URB2	91	90.741	ENSEEUG00000002669	URB2	86	90.741	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000012577	URB2	98	60.976	ENSELUG00000014647	urb2	92	60.976	Esox_lucius
ENSPTIG00000012577	URB2	100	98.291	ENSFCAG00000007662	URB2	100	98.291	Felis_catus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	66.667	ENSFALG00000003385	URB2	95	66.667	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000012577	URB2	100	73.294	ENSFDAG00000021079	URB2	100	73.294	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000012577	URB2	99	57.812	ENSFHEG00000010357	urb2	97	57.812	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000012577	URB2	87	72.727	ENSGMOG00000012459	urb2	95	72.727	Gadus_morhua
ENSPTIG00000012577	URB2	98	65.789	ENSGALG00000011101	URB2	95	65.789	Gallus_gallus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	37.084	ENSGACG00000016179	urb2	99	37.061	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	68.182	ENSGAGG00000021879	URB2	95	68.182	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSGGOG00000025643	URB2	95	89.394	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000012577	URB2	96	72.727	ENSHBUG00000018469	urb2	89	72.727	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000012577	URB2	97	84.848	ENSHGLG00000016561	URB2	94	84.848	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000012577	URB2	100	84.848	ENSHGLG00100001838	URB2	95	84.848	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000012577	URB2	100	53.030	ENSIPUG00000020315	urb2	97	53.030	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	84.848	ENSSTOG00000025323	URB2	95	84.848	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	78.788	ENSJJAG00000011998	Urb2	95	78.788	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	56.923	ENSKMAG00000020129	urb2	97	56.923	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	62.121	ENSLACG00000002038	URB2	95	62.121	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000012577	URB2	100	54.545	ENSLOCG00000015462	urb2	95	54.545	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	81.538	ENSLAFG00000012484	URB2	100	76.822	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSMFAG00000039905	URB2	95	87.879	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSMMUG00000009509	URB2	95	87.879	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000012577	URB2	100	86.364	ENSMNEG00000038762	URB2	95	86.364	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000012577	URB2	100	86.364	ENSMLEG00000043252	URB2	95	86.364	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	60.000	ENSMAMG00000020365	urb2	97	60.000	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000012577	URB2	96	72.727	ENSMZEG00005011027	urb2	89	72.727	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000012577	URB2	94	63.636	ENSMGAG00000012073	URB2	95	63.636	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000012577	URB2	94	90.909	ENSMAUG00000017980	Urb2	96	90.909	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	81.538	ENSMICG00000033302	URB2	99	79.514	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSMOCG00000020369	Urb2	96	90.909	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000012577	URB2	99	72.727	ENSMALG00000006529	urb2	97	56.923	Monopterus_albus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	75.758	ENSMUSG00000031976	Urb2	95	75.758	Mus_musculus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	92.424	ENSMPUG00000012438	URB2	95	92.424	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000012577	URB2	100	78.788	ENSNGAG00000016524	Urb2	95	78.788	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000012577	URB2	100	87.879	ENSNLEG00000014450	URB2	95	87.879	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000012577	URB2	91	76.923	ENSMEUG00000016434	URB2	89	76.923	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000012577	URB2	92	92.857	ENSOPRG00000009906	URB2	88	92.857	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000012577	URB2	100	74.064	ENSODEG00000005593	URB2	100	74.064	Octodon_degus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	72.727	ENSONIG00000017078	urb2	99	37.749	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	71.875	ENSOANG00000013732	URB2	95	71.875	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	78.462	ENSOCUG00000010700	URB2	99	77.938	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	ENSORLG00000010915	urb2	95	75.000	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	ENSORLG00020003361	urb2	96	75.000	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	ENSORLG00015001534	urb2	96	75.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000012577	URB2	99	56.250	ENSOMEG00000010076	urb2	97	56.250	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000012577	URB2	99	89.231	ENSOGAG00000003021	URB2	95	89.231	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000012577	URB2	99	78.462	ENSOARG00000003102	URB2	95	78.462	Ovis_aries
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSPPAG00000040629	URB2	95	89.394	Pan_paniscus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	99.080	ENSPPRG00000012767	URB2	100	99.080	Panthera_pardus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSPTRG00000002092	URB2	95	89.394	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000012577	URB2	100	89.394	ENSPANG00000002245	URB2	95	89.394	Papio_anubis
ENSPTIG00000012577	URB2	100	60.606	ENSPKIG00000005787	urb2	95	60.606	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000012577	URB2	100	66.667	ENSPSIG00000002690	URB2	95	66.667	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000012577	URB2	96	90.909	ENSPEMG00000019551	Urb2	96	90.909	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000012577	URB2	100	62.762	ENSPCIG00000030071	URB2	100	62.762	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.032	Poecilia_formosa
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ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	ENSPMEG00000012356	urb2	95	75.000	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000012577	URB2	99	70.455	ENSPREG00000010268	urb2	99	34.136	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000012577	URB2	99	89.062	ENSPPYG00000000123	URB2	95	89.062	Pongo_abelii
ENSPTIG00000012577	URB2	99	83.077	ENSPCOG00000023537	URB2	99	80.959	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000012577	URB2	100	84.091	ENSPVAG00000002108	URB2	96	84.091	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000012577	URB2	93	35.096	ENSPNYG00000016840	urb2	95	34.777	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000012577	URB2	100	51.515	ENSPNAG00000013684	urb2	97	51.515	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	ENSRNOG00000026853	Urb2	94	90.909	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000012577	URB2	100	83.333	ENSRBIG00000037937	URB2	100	79.921	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000012577	URB2	100	83.333	ENSRROG00000039854	URB2	100	79.921	Rhinopithecus_roxellana
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ENSPTIG00000012577	URB2	100	75.758	ENSSHAG00000014735	URB2	95	75.758	Sarcophilus_harrisii
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