EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000013471 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11676 bases
Position: chrKE721640.1:1428190-1439865
Accession: 102970089
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000013893	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000017968	RAB1A-201	1474	XM_015544992	ENSPTIP00000013893	204 (aa)	XP_015400478	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000013471	RAB1A	78	39.264	ENSPTIG00000018074	RAB7A	79	39.264
ENSPTIG00000013471	RAB1A	77	45.625	ENSPTIG00000006927	RAB39B	79	45.625
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	46.829	ENSPTIG00000021637	RAB11A	95	46.829
ENSPTIG00000013471	RAB1A	57	36.134	ENSPTIG00000007233	ARL14	59	36.134
ENSPTIG00000013471	RAB1A	57	31.933	ENSPTIG00000001360	ARL4A	59	31.933
ENSPTIG00000013471	RAB1A	95	45.596	ENSPTIG00000017871	RAB14	89	45.596
ENSPTIG00000013471	RAB1A	60	34.959	ENSPTIG00000006043	HRAS	92	34.959
ENSPTIG00000013471	RAB1A	76	39.623	ENSPTIG00000009359	RAB9B	79	39.623
ENSPTIG00000013471	RAB1A	81	35.928	ENSPTIG00000019813	MRAS	80	35.928
ENSPTIG00000013471	RAB1A	80	50.610	ENSPTIG00000009836	RAB30	81	50.610
ENSPTIG00000013471	RAB1A	98	92.462	ENSPTIG00000011013	RAB1B	88	92.462
ENSPTIG00000013471	RAB1A	95	42.564	ENSPTIG00000008177	RAB5C	89	42.564
ENSPTIG00000013471	RAB1A	95	43.814	ENSPTIG00000021685	RAB5A	90	43.814
ENSPTIG00000013471	RAB1A	80	44.643	ENSPTIG00000007518	RAB33B	73	44.643
ENSPTIG00000013471	RAB1A	79	30.120	ENSPTIG00000013443	DNAJC27	89	30.380
ENSPTIG00000013471	RAB1A	57	31.092	ENSPTIG00000011404	ARL4C	58	31.092
ENSPTIG00000013471	RAB1A	96	36.735	ENSPTIG00000014452	RAB17	90	36.735
ENSPTIG00000013471	RAB1A	69	31.081	ENSPTIG00000010084	ARL4D	73	31.081
ENSPTIG00000013471	RAB1A	80	47.619	ENSPTIG00000019544	RAB33A	71	47.619
ENSPTIG00000013471	RAB1A	81	34.545	ENSPTIG00000009435	RAB23	69	34.545
ENSPTIG00000013471	RAB1A	77	39.752	ENSPTIG00000021241	RAB34	62	39.752
ENSPTIG00000013471	RAB1A	80	37.805	ENSPTIG00000012574	KRAS	95	35.912
ENSPTIG00000013471	RAB1A	90	48.634	ENSPTIG00000021935	RAB2B	85	48.634
ENSPTIG00000013471	RAB1A	57	33.058	ENSPTIG00000015160	ARL2-SNX15	61	33.058
ENSPTIG00000013471	RAB1A	80	38.415	ENSPTIG00000018869	NRAS	86	38.415
ENSPTIG00000013471	RAB1A	89	46.703	ENSPTIG00000011667	RAB18	93	45.361
ENSPTIG00000013471	RAB1A	88	32.973	ENSPTIG00000008594	RERG	90	32.973
ENSPTIG00000013471	RAB1A	75	35.948	ENSPTIG00000018747	-	67	35.948

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	96	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.431	ENSAPOG00000008143	-	98	95.431	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	99	99.507	ENSAMEG00000001127	RAB1A	99	99.507	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.431	ENSAOCG00000020606	-	99	95.431	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.431	ENSAPEG00000022488	-	98	95.431	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	96	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.939	ENSACLG00000003326	-	98	95.939	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	94.416	ENSAMXG00000034850	-	98	94.416	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	100.000	Bos_taurus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	96	100.000	Canis_familiaris
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	96	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	99.020	ENSCHIG00000014060	RAB1A	99	99.020	Capra_hircus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	97.549	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	96	100.000	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	97	100.000	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	99.510	ENSCATG00000030853	RAB1A	97	100.000	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000013471	RAB1A	99	98.522	ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSCPBG00000013243	RAB1A	96	99.492	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	97.059	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	97.462	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCGRG00001012691	-	99	97.537	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSCGRG00000008456	-	99	97.537	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	96	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSDORG00000028628	-	96	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	84.343	FBgn0285937	Rab1	96	84.343	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	98	100.000	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	96	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	96	100.000	Equus_caballus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	98	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.477	ENSELUG00000012166	RAB1A	93	95.477	Esox_lucius
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	96	100.000	Felis_catus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	98.529	ENSFALG00000013624	RAB1A	97	99.495	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSFDAG00000019505	-	96	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	94.416	ENSFHEG00000014414	-	98	94.416	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.495	ENSGALG00000031582	RAB1A	96	99.492	Gallus_gallus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	94.416	ENSGAFG00000000918	-	98	94.416	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSGAGG00000006802	RAB1A	96	99.492	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSSTOG00000020693	-	98	99.495	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	94.924	ENSLBEG00000028426	RAB1A	98	94.924	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	98.985	ENSLACG00000012869	RAB1A	96	98.985	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	97.059	ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	97.059	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	99.510	ENSMFAG00000046246	RAB1A	96	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	99.510	ENSMMUG00000021721	RAB1A	94	99.510	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000013471	RAB1A	91	99.462	ENSMNEG00000028414	-	93	99.462	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	97	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.939	ENSMZEG00005013959	-	98	95.939	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000013471	RAB1A	99	98.515	ENSMGAG00000004611	RAB1A	100	98.515	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSMAUG00000012156	Rab1a	97	99.492	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	96	100.000	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSMOCG00000017022	Rab1a	98	99.492	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	93.401	ENSMMOG00000018709	RAB1A	97	93.401	Mola_mola
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSMODG00000003340	RAB1A	96	99.492	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	96	100.000	Mus_caroli
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	98	100.000	Mus_musculus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	96	100.000	Mus_pahari
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	98	100.000	Mus_spretus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	78	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	96	100.000	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	96	100.000	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.939	ENSNBRG00000020492	-	98	95.939	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000013471	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	93.909	ENSONIG00000006819	-	97	93.909	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSOANG00000012438	RAB1A	96	99.492	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	96	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	99	99.015	ENSOARG00000019997	RAB1A	100	99.015	Ovis_aries
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	98	100.000	Pan_paniscus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	96	100.000	Panthera_pardus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	98	99.495	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	99.510	ENSPANG00000010485	RAB1A	97	100.000	Papio_anubis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.495	ENSPSIG00000008028	RAB1A	97	99.495	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.939	ENSPMGG00000021015	-	96	95.939	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	ENSPCIG00000023212	RAB1A	96	99.492	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	93.909	ENSPFOG00000000498	-	95	93.909	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	93.909	ENSPLAG00000015592	-	98	93.909	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	93.909	ENSPMEG00000005288	-	98	93.909	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSPPYG00000012360	RAB1A	97	99.495	Pongo_abelii
ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	97.059	ENSPCOG00000017244	RAB1A	97	99.495	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.939	ENSPNYG00000015841	-	98	95.939	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	ENSRNOG00000004992	Rab1a	96	100.000	Rattus_norvegicus
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