EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000016887 (Gene tree)
Gene ID: 102948532
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11943 bases
Position: chrKE722343.1:489201-501143
Accession: 102948532
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000018924	RRM_1	PF00076.22	4.5e-16	1	2
ENSPTIP00000018924	RRM_1	PF00076.22	4.5e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000023215	HTATSF1-201	2169	XM_015544872	ENSPTIP00000018924	722 (aa)	XP_015400358	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.209	ENSG00000102241	HTATSF1	93	82.128	Homo_sapiens
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	90.780	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	93	90.717	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	77.286	ENSANAG00000025458	-	98	76.143	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	71.325	ENSANAG00000027986	-	92	70.785	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	78.962	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	93	79.861	Bos_taurus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	78.962	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	93	79.861	Bos_taurus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	75.286	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	92	76.857	Bos_taurus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	80.599	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	92	80.029	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	91.292	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	93	91.248	Canis_familiaris
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	89.802	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	93	89.776	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	79.060	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	93	79.972	Capra_hircus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.205	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	93	81.135	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	80.571	ENSCCAG00000022701	-	92	80.000	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	77.457	ENSCCAG00000025329	-	92	77.746	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.014	ENSCATG00000029963	HTATSF1	93	81.986	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	72.881	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	93	73.870	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.014	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	93	81.986	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.871	ENSCANG00000028495	HTATSF1	93	81.844	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	77	77.487	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	93	72.640	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	76	71.025	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	67.403	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	77.871	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	93	80.224	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	73	52.564	ENSETEG00000006377	-	62	51.868	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.127	ENSEASG00005003440	HTATSF1	93	81.032	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.127	ENSECAG00000009156	HTATSF1	93	81.032	Equus_caballus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	64.706	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	92	65.678	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	96.542	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	93	96.542	Felis_catus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.688	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	93	72.791	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.066	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	93	81.986	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	73.555	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	93	73.692	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	79.403	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	92	79.466	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	51	59.794	ENSKMAG00000007622	htatsf1	86	59.794	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	70.247	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	92	69.353	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.871	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	93	81.844	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.871	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	93	81.844	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	74.496	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	92	74.894	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.727	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	93	81.702	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.355	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	92	72.893	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	79.654	ENSMICG00000009348	HTATSF1	93	77.904	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	70.572	ENSMOCG00000023007	-	93	70.236	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	70.682	ENSMOCG00000022370	-	88	69.020	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	50	59.269	ENSMALG00000019977	htatsf1	85	59.269	Monopterus_albus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	70.874	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	92	70.572	Mus_caroli
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	72.143	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	93	72.433	Mus_musculus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	72.166	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	93	72.293	Mus_spretus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	88.326	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	93	88.608	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	76.420	ENSMLUG00000028418	-	93	76.264	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	73.381	ENSMLUG00000009234	-	92	72.355	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	74.601	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	92	74.571	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.636	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	93	81.560	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	76.250	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	93	78.056	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	76.335	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	93	77.151	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	78.822	ENSOARG00000011215	-	93	79.722	Ovis_aries
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	76.011	ENSOARG00000000481	-	93	75.872	Ovis_aries
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.209	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	93	82.128	Pan_paniscus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	98.415	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	93	98.415	Panthera_pardus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	82.209	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	93	82.128	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	80	80.171	ENSPANG00000010946	HTATSF1	84	80.168	Papio_anubis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	72.740	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	92	72.855	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	83	82.587	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	77	84.274	Pongo_abelii
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	93	67.204	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	91	67.540	Procavia_capensis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	80.258	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	92	79.971	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.518	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	92	73.023	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	72.527	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	93	72.802	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	70.504	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	92	70.355	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	81.295	ENSRROG00000021939	HTATSF1	93	81.277	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	78.993	ENSSBOG00000027186	-	93	78.014	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	76.814	ENSSBOG00000017914	-	93	76.245	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	50	59.481	ENSSMAG00000002970	htatsf1	85	59.690	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	63.714	ENSSARG00000005193	HTATSF1	92	63.989	Sorex_araneus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.571	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	92	72.984	Sus_scrofa
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	92	74.086	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	92	72.803	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	93.228	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	93	93.228	Ursus_americanus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	90.999	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	93	90.999	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	76.990	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	100	76.967	Vicugna_pacos
ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	89.518	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	93	89.496	Vulpes_vulpes