EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000017448 (Gene tree)
Gene ID: 102963178
Gene Symbol: TYW3
Alias: -
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17532 bases
Position: chrKE721720.1:13037649-13055180
Accession: 102963178
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000019755	TYW3	PF02676.14	6.7e-57	1	1
ENSPTIP00000019762	TYW3	PF02676.14	1.4e-42	1	2
ENSPTIP00000019762	TYW3	PF02676.14	1.4e-42	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000024089	TYW3-202	675	-	ENSPTIP00000019762	224 (aa)	-	-
ENSPTIT00000024080	TYW3-201	1347	XM_007079241	ENSPTIP00000019755	257 (aa)	XP_007079303	UPI00042BCE8E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	82.375	ENSG00000162623	TYW3	100	92.857	Homo_sapiens
ENSPTIG00000017448	TYW3	93	52.344	ENSAPOG00000009462	tyw3	96	52.344	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	90.734	ENSAMEG00000003461	TYW3	100	90.734	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000017448	TYW3	73	63.102	ENSACIG00000002242	tyw3	80	63.102	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000017448	TYW3	76	61.026	ENSAOCG00000002161	tyw3	73	61.026	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000017448	TYW3	66	53.254	ENSAPEG00000009395	tyw3	92	58.065	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	55.804	ENSATEG00000004411	-	90	55.804	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	55.804	ENSATEG00000004518	tyw3	90	55.804	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000017448	TYW3	85	59.565	ENSACAG00000011380	TYW3	86	59.565	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.057	ENSANAG00000034485	TYW3	100	85.057	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000017448	TYW3	84	54.091	ENSACLG00000022833	tyw3	92	54.091	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000017448	TYW3	98	53.906	ENSAMXG00000039965	tyw3	99	54.475	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.588	ENSBTAG00000005196	TYW3	100	83.588	Bos_taurus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.000	ENSCJAG00000006550	TYW3	100	85.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000017448	TYW3	83	92.093	ENSCAFG00000032209	TYW3	100	92.093	Canis_familiaris
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	91.473	ENSCAFG00020017095	TYW3	92	91.473	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.969	ENSCHIG00000009333	TYW3	100	83.969	Capra_hircus
ENSPTIG00000017448	TYW3	93	79.918	ENSTSYG00000006369	TYW3	98	79.918	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.441	ENSCCAG00000034210	TYW3	100	85.441	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.000	ENSCATG00000044397	TYW3	100	85.000	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.992	ENSCLAG00000004370	TYW3	95	81.992	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.000	ENSCSAG00000001387	TYW3	100	85.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	60.769	ENSCHOG00000005179	TYW3	100	60.769	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000017448	TYW3	97	63.386	ENSCPBG00000017047	TYW3	99	63.386	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.846	ENSCANG00000036108	TYW3	100	83.846	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	69.732	ENSCGRG00001022820	Tyw3	100	74.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000017448	TYW3	75	69.543	ENSCGRG00000003132	Tyw3	93	77.500	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000017448	TYW3	81	59.809	ENSCSEG00000021219	tyw3	74	59.809	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000017448	TYW3	88	53.913	ENSCVAG00000003270	tyw3	93	53.913	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	86	55.605	ENSDARG00000038222	tyw3	87	55.605	Danio_rerio
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	79.537	ENSDNOG00000033863	TYW3	100	79.537	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000017448	TYW3	61	78.723	ENSDORG00000002718	-	100	78.723	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000017448	TYW3	77	79.000	ENSETEG00000012572	TYW3	99	79.000	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000017448	TYW3	54	50.360	ENSEBUG00000014020	tyw3	55	50.360	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	88.123	ENSEASG00005007776	TYW3	100	88.123	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	88.889	ENSECAG00000007888	TYW3	100	88.889	Equus_caballus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	70.196	ENSEEUG00000009289	TYW3	99	70.196	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000017448	TYW3	95	55.422	ENSELUG00000023000	tyw3	98	55.422	Esox_lucius
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	99.611	ENSFCAG00000035340	TYW3	100	99.611	Felis_catus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	79.310	ENSFDAG00000003816	TYW3	100	81.226	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000017448	TYW3	85	57.534	ENSFHEG00000001347	tyw3	88	57.534	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000017448	TYW3	97	51.362	ENSGALG00000032549	TYW3	98	51.362	Gallus_gallus
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	57.080	ENSGAFG00000012457	tyw3	84	57.080	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000017448	TYW3	76	60.513	ENSGACG00000014630	tyw3	86	60.513	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.609	ENSGGOG00000013676	TYW3	100	83.908	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.609	ENSHGLG00000004440	TYW3	100	81.609	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	77.778	ENSHGLG00100018315	TYW3	100	77.778	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000017448	TYW3	76	54.359	ENSHCOG00000016590	TYW3	94	54.359	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000017448	TYW3	77	63.452	ENSIPUG00000012907	tyw3	74	57.018	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	75.096	ENSSTOG00000028816	TYW3	95	75.096	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	56	77.778	ENSJJAG00000005103	-	100	77.778	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000017448	TYW3	79	60.891	ENSKMAG00000020761	tyw3	72	61.500	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000017448	TYW3	70	61.667	ENSLBEG00000021318	tyw3	87	54.545	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	53.435	ENSLACG00000012636	TYW3	100	53.435	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000017448	TYW3	94	54.132	ENSLOCG00000003437	tyw3	93	54.132	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	80.769	ENSLAFG00000011373	TYW3	100	82.692	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	84.231	ENSMFAG00000003496	TYW3	100	84.231	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.700	ENSMMUG00000014595	TYW3	100	83.700	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.846	ENSMNEG00000028346	TYW3	100	83.846	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	84.615	ENSMLEG00000041647	TYW3	100	84.615	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000017448	TYW3	80	61.650	ENSMAMG00000010987	tyw3	89	56.780	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	82	58.571	ENSMZEG00005023808	tyw3	80	58.140	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000017448	TYW3	66	52.023	ENSMGAG00000012152	TYW3	99	52.023	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	59.211	ENSMAUG00000000522	Tyw3	100	66.667	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.057	ENSMICG00000015883	TYW3	100	84.211	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	57.143	ENSMOCG00000021348	Tyw3	99	72.857	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000017448	TYW3	89	56.957	ENSMMOG00000021442	tyw3	91	56.957	Mola_mola
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	67.308	ENSMODG00000019082	TYW3	93	67.308	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000017448	TYW3	76	63.265	ENSMALG00000014442	tyw3	73	63.265	Monopterus_albus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	71.648	MGP_CAROLIEiJ_G0025755	Tyw3	100	79.167	Mus_caroli
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	72.093	ENSMUSG00000047583	Tyw3	100	79.167	Mus_musculus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	72.093	MGP_PahariEiJ_G0027206	Tyw3	100	78.472	Mus_pahari
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	72.481	MGP_SPRETEiJ_G0026708	Tyw3	100	78.472	Mus_spretus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	90.347	ENSMPUG00000010967	TYW3	100	90.347	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	87.259	ENSMLUG00000005999	TYW3	100	87.259	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000017448	TYW3	56	80.000	ENSNGAG00000000586	-	100	80.000	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.769	ENSNLEG00000009556	TYW3	100	85.769	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	62.069	ENSOPRG00000014182	TYW3	100	62.069	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	76.538	ENSODEG00000005361	TYW3	100	83.448	Octodon_degus
ENSPTIG00000017448	TYW3	74	62.632	ENSONIG00000019965	tyw3	96	62.632	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000017448	TYW3	76	61.616	ENSOANG00000002172	-	98	61.616	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	78.927	ENSOCUG00000003043	TYW3	100	78.927	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000017448	TYW3	85	52.941	ENSORLG00000004470	tyw3	87	52.941	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000017448	TYW3	75	58.247	ENSORLG00020003793	tyw3	87	52.489	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000017448	TYW3	75	58.763	ENSORLG00015006950	tyw3	87	52.941	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000017448	TYW3	90	51.695	ENSOMEG00000016176	tyw3	93	51.695	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	81.538	ENSOGAG00000011590	-	99	81.538	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	71.538	ENSOGAG00000025029	-	99	75.000	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	83.525	ENSOARG00000012508	TYW3	99	83.525	Ovis_aries
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.992	ENSPPAG00000043438	TYW3	100	84.291	Pan_paniscus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	98.833	ENSPPRG00000023209	TYW3	100	98.833	Panthera_pardus
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.992	ENSPTRG00000000867	TYW3	100	84.291	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	85.000	ENSPANG00000013397	TYW3	100	85.000	Papio_anubis
ENSPTIG00000017448	TYW3	93	46.183	ENSPKIG00000009802	tyw3	94	46.183	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000017448	TYW3	65	62.941	ENSPSIG00000008432	TYW3	99	62.941	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000017448	TYW3	85	56.164	ENSPMGG00000005290	tyw3	79	58.470	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	71.264	ENSPEMG00000013100	Tyw3	100	77.083	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000017448	TYW3	95	72.874	ENSPCIG00000024204	TYW3	81	72.874	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	57.522	ENSPFOG00000000927	tyw3	83	57.522	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	57.080	ENSPLAG00000009891	tyw3	83	57.080	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000017448	TYW3	87	57.522	ENSPMEG00000002006	tyw3	83	57.522	Poecilia_mexicana
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ENSPTIG00000017448	TYW3	100	83.142	ENSPCOG00000023207	TYW3	97	85.824	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000017448	TYW3	100	81.712	ENSPVAG00000002356	TYW3	100	82.946	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000017448	TYW3	70	62.703	ENSPNYG00000017982	tyw3	59	62.703	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	56.078	ENSPNAG00000028431	tyw3	100	56.078	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000017448	TYW3	99	71.429	ENSRNOG00000028328	Tyw3	88	71.429	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000017448	TYW3	61	81.429	ENSRBIG00000040137	-	100	81.429	Rhinopithecus_bieti
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