EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000017803 (Gene tree)
Gene ID: 102962992
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44344 bases
Position: chrKE721725.1:854434-898777
Accession: 102962992
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000020342	ResIII	PF04851.15	7.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000024683	SBNO1-201	4170	XM_015536419	ENSPTIP00000020342	1390 (aa)	XP_015391905	-

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000017803's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000017803's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.134	ENSG00000139697	SBNO1	100	98.134	Homo_sapiens
ENSPTIG00000017803	SBNO1	83	80.825	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.083	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.854	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.854	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.542	ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.366	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.176	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.369	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.176	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.369	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.930	ENSATEG00000006667	sbno1	99	76.211	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.960	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.679	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	87.687	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.544	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.918	ENSANAG00000029958	-	100	97.918	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.462	ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.553	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	79.544	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	80.257	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	98.779	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	98.779	Bos_taurus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.134	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.134	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	99.068	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	99.068	Canis_familiaris
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.349	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	98.349	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	98.563	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.563	Capra_hircus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.564	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.564	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000017803	SBNO1	96	98.272	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	98.272	Cavia_aperea
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.487	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	98.399	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	93.687	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	93.687	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	97	98.443	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	99.458	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.487	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	98.399	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000017803	SBNO1	83	99.050	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	99.050	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	96	94.712	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.519	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	92.241	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	92.026	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	92.616	ENSCANG00000042688	-	100	92.258	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.270	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	97.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.270	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	97.270	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.684	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	75.668	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.775	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	76.174	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	79.399	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.757	Danio_rerio
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.865	ENSDNOG00000017147	SBNO1	99	98.256	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	83.691	ENSDORG00000015261	Sbno1	100	83.691	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	93	90.596	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.596	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000017803	SBNO1	75	63.119	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.745	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000017803	SBNO1	51	94.759	ENSEASG00005012595	-	92	94.759	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.923	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	98.923	Equus_caballus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	83	99.451	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	99.451	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	78.224	ENSELUG00000002886	sbno1	99	78.154	Esox_lucius
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	99.713	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	99.713	Felis_catus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.960	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	91.750	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	95.977	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.977	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.867	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.056	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	94	78.234	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	Gadus_morhua
ENSPTIG00000017803	SBNO1	88	92.439	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.195	Gallus_gallus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.918	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.070	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	94	79.252	ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.379	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.990	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	97.990	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	68.714	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.897	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.703	ENSHGLG00000014165	-	99	99.277	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000017803	SBNO1	91	84.980	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	78.932	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.932	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.492	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.492	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.990	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.990	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.743	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	75.932	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.910	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	76.261	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	81.357	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.172	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	81.708	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.909	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.272	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.272	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.990	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	97.990	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.990	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	97.990	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	96.267	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	99.458	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.847	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	75.989	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	92.020	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	92.026	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000017803	SBNO1	50	93.678	ENSMAUG00000004834	-	100	93.678	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.344	ENSMICG00000006573	-	100	97.344	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	93.759	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	97.509	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	71.893	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	72.073	Mola_mola
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	94.899	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	94.756	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.543	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.770	Monopterus_albus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	97.268	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	97.268	Mus_caroli
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	97.628	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	96.947	Mus_musculus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	97.628	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	97.074	Mus_pahari
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	97.412	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	99	97.412	Mus_spretus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	99.354	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	99.354	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.205	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	98.205	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.062	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	98.062	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.480	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	74.571	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	94.185	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.185	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000017803	SBNO1	62	84.810	ENSMEUG00000008768	-	93	89.241	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	94.624	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.337	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.487	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	97.487	Octodon_degus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.529	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.755	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	98	96.645	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.645	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.123	ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.405	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.352	ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.476	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.247	ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.371	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.299	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.581	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000017803	SBNO1	50	90.517	ENSOGAG00000010781	-	100	90.230	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	98.350	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.350	Ovis_aries
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.134	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	98.134	Pan_paniscus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	99.713	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	99.713	Panthera_pardus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.205	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	98.205	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.990	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	99.458	Papio_anubis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	80.444	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.528	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000017803	SBNO1	92	87.947	ENSPSIG00000009256	-	100	87.947	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.422	ENSPSIG00000009572	-	100	91.339	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.126	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.126	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	94.042	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	94.042	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	76.147	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.297	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	76.006	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	76.334	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	76.093	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	76.124	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.740	ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.772	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.703	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	97.703	Pongo_abelii
ENSPTIG00000017803	SBNO1	89	92.466	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	92.022	Procavia_capensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.421	ENSPCOG00000024277	SBNO1	100	98.421	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000017803	SBNO1	87	99.405	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	99.405	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.847	ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.862	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	79.445	ENSPNAG00000015622	sbno1	99	79.232	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	97.340	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	98.217	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.134	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	99.458	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000017803	SBNO1	97	93.155	ENSSBOG00000015422	SBNO1	100	93.155	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	80.315	ENSSFOG00015019025	sbno1	99	80.387	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	76.130	ENSSMAG00000013640	sbno1	99	76.342	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.632	ENSSDUG00000023480	sbno1	99	75.772	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.562	ENSSLDG00000007928	sbno1	99	75.702	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	89	99.029	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	99.029	Sorex_araneus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	89.216	ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.504	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.035	ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.245	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.708	ENSSSCG00000009776	SBNO1	100	98.708	Sus_scrofa
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.888	ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.679	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.501	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	75.632	Takifugu_rubripes
ENSPTIG00000017803	SBNO1	56	70.545	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	70.647	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	99.354	ENSUAMG00000019671	SBNO1	100	99.354	Ursus_americanus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	99.354	ENSUMAG00000004002	SBNO1	100	99.354	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	95	97.826	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	97.826	Vicugna_pacos
ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	99.282	ENSVVUG00000027807	SBNO1	100	99.282	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	82.265	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.838	Xenopus_tropicalis
ENSPTIG00000017803	SBNO1	88	74.681	ENSXCOG00000011607	sbno1	95	75.201	Xiphophorus_couchianus
ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.901	ENSXMAG00000002140	sbno1	99	76.104	Xiphophorus_maculatus