EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000018126 (Gene tree)
Gene ID: 102957843
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29019 bases
Position: chrKE721640.1:5192459-5221477
Accession: 102957843
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000020760	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.7e-28	1	2
ENSPTIP00000020760	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.7e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000025115	PAPOLG-201	3754	XM_007075373	ENSPTIP00000020760	741 (aa)	XP_007075435	UPI00042C245A

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000018126's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000018126's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	59.892	ENSPTIG00000018852	PAPOLA	98	60.107

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.112	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.081	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	97.561	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	97.561	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.003	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.314	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.713	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.112	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.846	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.244	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.074	ENSATEG00000009007	papolg	97	72.473	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	72.751	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.751	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	81	63.262	ENSACAG00000015048	-	100	63.262	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	94.332	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.952	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.481	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.237	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.237	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.761	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	96.761	Bos_taurus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.602	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.602	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	97.031	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	90.220	Canis_familiaris
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.386	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.386	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.221	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	96.221	Capra_hircus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.142	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	95.142	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	51	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.872	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.872	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.737	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.737	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.682	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.737	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.737	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	89	92.716	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.716	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	67	64.554	ENSCING00000024664	-	94	64.554	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	65	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.872	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.315	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00000005552	-	100	93.315	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.880	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.281	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	67.439	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	73.016	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.016	Danio_rerio
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	93.252	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.252	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	58	99.301	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	73.713	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.649	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	65	56.695	ENSEBUG00000005042	-	90	53.551	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	60	70.833	ENSEBUG00000004020	papolg	90	70.833	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.491	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.491	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.626	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	96.206	Equus_caballus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	83.941	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.941	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.663	ENSELUG00000014497	papolg	83	73.088	Esox_lucius
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	99.595	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	99.595	Felis_catus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	65.339	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.339	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.872	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.872	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	66	61.877	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.035	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	87	82.671	ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.671	Gadus_morhua
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.439	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.439	Gallus_gallus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.668	ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.000	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.485	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.602	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.602	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.952	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.481	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	94.986	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.986	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.412	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.518	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.916	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.578	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.654	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.547	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.547	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	58	99.068	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.068	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.557	ENSKMAG00000016439	papolg	97	68.817	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	67.812	ENSLBEG00000023218	papolg	97	67.812	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	69.920	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.920	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.409	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.409	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	93.674	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.007	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.007	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.007	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.007	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	86.059	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	86.059	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.737	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	94.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.713	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.016	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.952	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.652	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.683	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.683	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	93.588	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.588	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.277	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.277	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	93.387	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.387	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.126	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.656	Mola_mola
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	87.399	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.399	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.713	ENSMALG00000007012	papolg	97	71.846	Monopterus_albus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.467	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.533	Mus_caroli
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	Mus_musculus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.197	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	Mus_pahari
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.197	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	Mus_spretus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	97.706	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	97.706	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	94.444	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	94.444	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.602	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	94.602	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	62.665	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.720	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	58	98.834	ENSNLEG00000009507	-	100	98.834	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	82	78.082	ENSMEUG00000013605	-	88	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.007	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.007	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	57	94.366	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	Octodon_degus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	65.154	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.554	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	86.193	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.193	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.816	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.816	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.934	ENSORLG00000001577	papolg	98	70.185	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.252	ENSORLG00020002482	papolg	98	70.916	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.934	ENSORLG00015008836	papolg	98	70.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.213	ENSOMEG00000001406	papolg	98	70.106	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	58	88.605	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	88.605	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.356	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	96.356	Ovis_aries
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	94.332	Pan_paniscus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	99.865	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	99.865	Panthera_pardus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	94.332	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	90.579	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	90.579	Papio_anubis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	93	69.972	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.972	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.340	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.340	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	78.841	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.841	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	92.633	ENSPEMG00000008960	-	100	92.633	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	53.369	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.369	Petromyzon_marinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	87.583	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.840	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.170	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.930	ENSPLAG00000018445	papolg	97	69.342	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.880	ENSPMEG00000003961	papolg	97	70.026	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.661	ENSPREG00000010358	papolg	97	69.091	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.467	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	94.467	Pongo_abelii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	81.769	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	Procavia_capensis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	84.615	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.615	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	89	94.326	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.350	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.081	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	73.031	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.031	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.062	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.062	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	88.799	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.799	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.737	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.737	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.467	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.467	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	94	87.660	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.660	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.433	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.433	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	63.844	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	75	82.975	ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.665	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.620	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.620	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.049	ENSSLDG00000001217	papolg	96	71.448	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	78.162	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.162	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.858	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.081	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.896	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.896	Sus_scrofa
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	73	76.568	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.568	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	70.485	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.485	Takifugu_rubripes
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	66.316	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	87.347	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.347	Tupaia_belangeri
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	91.498	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	91.498	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	97.954	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.954	Ursus_americanus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	97.954	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	97.954	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	92.653	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	92.653	Vicugna_pacos
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	97.301	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.301	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	74.801	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	Xenopus_tropicalis
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	67	84.970	ENSXCOG00000006611	papolg	73	84.970	Xiphophorus_couchianus
ENSPTIG00000018126	PAPOLG	74	82.400	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.400	Xiphophorus_maculatus