EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000018532 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PUSL1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2555 bases
Position: chrKE722127.1:410712-413266
Accession: 102956724
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000021351	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-33	1	2
ENSPTIP00000021351	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000025728	PUSL1-201	810	XM_007094626	ENSPTIP00000021351	269 (aa)	XP_007094688	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.733	ENSG00000169972	PUSL1	98	84.553	Homo_sapiens
ENSPTIG00000018532	PUSL1	94	48.828	ENSAPOG00000016290	pusl1	83	50.806	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	93.893	ENSAMEG00000013752	PUSL1	87	93.893	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	48.988	ENSACIG00000015240	pusl1	91	48.739	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	95	50.965	ENSAOCG00000019419	pusl1	80	50.806	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	51.210	ENSAPEG00000005452	pusl1	82	51.210	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	51.210	ENSATEG00000024154	pusl1	82	51.210	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	54.826	ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	54.826	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	55.378	ENSACAG00000014111	PUSL1	95	55.378	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.057	ENSANAG00000037456	PUSL1	86	85.057	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	50.806	ENSACLG00000008675	pusl1	94	48.606	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	48.077	ENSAMXG00000044007	pusl1	91	48.790	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.932	ENSBTAG00000007619	PUSL1	90	85.932	Bos_taurus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.824	ENSCJAG00000010972	PUSL1	86	85.824	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	91.571	ENSCAFG00000019291	PUSL1	86	91.571	Canis_familiaris
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	91.571	ENSCAFG00020011568	PUSL1	86	91.571	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.932	ENSCHIG00000012615	PUSL1	92	85.932	Capra_hircus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	79.771	ENSCPOG00000005149	PUSL1	85	79.771	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.441	ENSCCAG00000027475	PUSL1	86	85.441	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.878	ENSCATG00000018260	PUSL1	86	85.878	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	82.061	ENSCLAG00000005232	PUSL1	86	82.061	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.115	ENSCSAG00000000680	PUSL1	86	85.115	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	54.440	ENSCPBG00000022621	PUSL1	89	54.440	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.496	ENSCANG00000034373	PUSL1	86	85.496	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	76.718	ENSCGRG00001012429	Pusl1	90	76.718	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	77.099	ENSCGRG00000006466	Pusl1	90	77.099	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000018532	PUSL1	94	50.196	ENSCSEG00000005159	pusl1	83	50.800	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	45.783	ENSCVAG00000012923	pusl1	95	45.783	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	98	49.624	ENSDARG00000074565	pusl1	94	49.754	Danio_rerio
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	33.088	FBgn0083976	CG34140	88	33.088	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000018532	PUSL1	98	89.179	ENSECAG00000006248	PUSL1	88	89.179	Equus_caballus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	78.491	ENSEEUG00000000837	PUSL1	89	78.491	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	49.430	ENSELUG00000015945	pusl1	89	49.430	Esox_lucius
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	98.077	ENSFCAG00000007617	PUSL1	87	98.077	Felis_catus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	53.968	ENSFHEG00000006370	pusl1	84	53.968	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	52.362	ENSGMOG00000019388	pusl1	89	52.362	Gadus_morhua
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	53.462	ENSGALG00000001714	PUSL1	94	54.365	Gallus_gallus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	52.381	ENSGAFG00000007546	pusl1	85	52.381	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	50.201	ENSGACG00000007848	pusl1	82	50.201	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	55.598	ENSGAGG00000004730	PUSL1	89	55.598	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000018532	PUSL1	90	85.185	ENSGGOG00000005364	PUSL1	94	85.185	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	50.806	ENSHBUG00000001264	pusl1	85	50.806	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	79.545	ENSHGLG00000017570	PUSL1	86	79.545	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	79.545	ENSHGLG00100007641	PUSL1	87	79.545	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	52.174	ENSHCOG00000010077	pusl1	89	53.441	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	47.328	ENSIPUG00000023921	pusl1	89	47.328	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	99	84.074	ENSSTOG00000001783	PUSL1	84	84.074	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	83.908	ENSJJAG00000020471	Pusl1	88	83.908	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	50.806	ENSKMAG00000005154	pusl1	84	50.806	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	51.538	ENSLBEG00000013469	pusl1	89	51.538	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000018532	PUSL1	71	55.670	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	55.670	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000018532	PUSL1	86	30.380	ENSLACG00000016044	-	63	30.380	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	48.846	ENSLOCG00000002210	pusl1	88	48.473	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.932	ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	85.932	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.733	ENSMFAG00000046288	PUSL1	86	84.733	Macaca_fascicularis
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ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.733	ENSMNEG00000037989	PUSL1	87	84.733	Macaca_nemestrina
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ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	79.389	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	90	79.389	Mus_pahari
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	79.389	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	90	79.389	Mus_spretus
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ENSPTIG00000018532	PUSL1	93	51.181	ENSORLG00015008715	pusl1	88	51.181	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	49.194	ENSOMEG00000018897	pusl1	85	49.194	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	83.525	ENSOGAG00000031692	PUSL1	91	83.525	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.496	ENSOARG00000004905	PUSL1	98	85.496	Ovis_aries
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.351	ENSPPAG00000029283	PUSL1	86	84.351	Pan_paniscus
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ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.351	ENSPTRG00000000021	PUSL1	86	84.351	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	84.733	ENSPANG00000000591	PUSL1	86	84.733	Papio_anubis
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	47.170	ENSPKIG00000002447	pusl1	91	47.170	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000018532	PUSL1	94	56.299	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	56.299	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	47.710	ENSPMGG00000011051	pusl1	94	47.710	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	80.153	ENSPEMG00000013541	Pusl1	90	80.153	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000018532	PUSL1	98	64.906	ENSPCIG00000007816	-	61	64.906	Phascolarctos_cinereus
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