EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000019578 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3925 bases
Position: chrKE721817.1:9322977-9326901
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000022943	Ribosomal_L37ae	PF01780.19	4.2e-40	1	1
ENSPTIP00000022936	Ribosomal_L37ae	PF01780.19	2.5e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000027385	-	297	-	ENSPTIP00000022943	98 (aa)	-	-
ENSPTIT00000027378	-	207	-	ENSPTIP00000022936	68 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000019578	-	90	77.273	ENSPTIG00000003092	-	96	77.273
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSPTIG00000021853	-	96	88.636

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSG00000197756	RPL37A	100	94.118	Homo_sapiens
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSAPOG00000010110	zgc:171772	96	88.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000019578	-	88	80.233	ENSAMEG00000019756	-	93	80.233	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSAMEG00000003377	-	96	88.636	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000019578	-	88	65.116	ENSAMEG00000020228	-	93	65.116	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSACIG00000010196	-	96	87.500	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSAOCG00000010205	zgc:171772	60	87.500	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSAPEG00000021880	zgc:171772	59	87.500	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSATEG00000005373	zgc:171772	96	87.500	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSAPLG00000009836	RPL37A	96	87.500	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSACAG00000004591	-	96	87.500	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000019578	-	90	71.591	ENSACAG00000005585	-	96	71.591	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000019578	-	90	84.091	ENSANAG00000019987	-	96	84.091	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	68	89.130	ENSANAG00000024516	-	88	82.353	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	90	85.227	ENSANAG00000019647	-	96	85.227	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSANAG00000033950	RPL37A	96	88.636	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	90	89.773	ENSANAG00000006555	-	96	89.773	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSANAG00000019149	-	96	87.500	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSACLG00000018074	zgc:171772	96	87.500	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000019578	-	90	81.818	ENSAMXG00000041482	zgc:171772	96	81.818	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSBTAG00000051254	RPL37A	96	88.636	Bos_taurus
ENSPTIG00000019578	-	85	63.095	ENSBTAG00000051973	-	94	63.095	Bos_taurus
ENSPTIG00000019578	-	75	72.549	ENSBTAG00000051185	-	100	72.727	Bos_taurus
ENSPTIG00000019578	-	56	71.053	ENSCJAG00000048683	-	100	93.750	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000019578	-	93	85.714	ENSCJAG00000021746	-	60	85.714	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000019578	-	90	85.227	ENSCJAG00000047952	-	96	85.227	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000019578	-	90	84.091	ENSCAFG00000024313	-	94	84.091	Canis_familiaris
ENSPTIG00000019578	-	88	54.651	ENSCAFG00000005195	-	95	54.651	Canis_familiaris
ENSPTIG00000019578	-	66	80.000	ENSCAFG00000009988	-	90	78.462	Canis_familiaris
ENSPTIG00000019578	-	59	95.000	ENSCAFG00000032717	-	81	85.938	Canis_familiaris
ENSPTIG00000019578	-	61	64.062	ENSCAFG00020014544	-	94	64.062	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	90	84.091	ENSCAFG00020010199	-	96	84.091	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	90	84.091	ENSCAFG00020025594	-	96	84.091	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	90	80.682	ENSCAFG00020023400	-	91	80.682	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	75	86.275	ENSCAFG00020017929	-	100	85.294	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	89	68.182	ENSCAFG00020019643	-	94	68.182	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	90	79.545	ENSCAFG00020027264	-	96	79.545	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	69	89.362	ENSCAFG00020007706	-	51	89.362	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019578	-	82	78.571	ENSCHIG00000017509	-	84	80.303	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	81	83.636	ENSCHIG00000004998	-	100	91.176	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	90	67.045	ENSCHIG00000001509	-	95	67.045	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSCHIG00000007926	-	96	88.636	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	88	87.209	ENSCHIG00000009937	-	95	87.209	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	86	64.286	ENSCHIG00000018202	-	95	64.286	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	90	82.955	ENSCHIG00000000883	-	96	82.955	Capra_hircus
ENSPTIG00000019578	-	90	88.636	ENSTSYG00000025509	RPL37A	96	88.636	Carlito_syrichta
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ENSPTIG00000019578	-	81	78.182	ENSTSYG00000000954	-	100	86.765	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000019578	-	74	88.000	ENSTSYG00000035326	-	91	73.684	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000019578	-	90	86.364	ENSTSYG00000027569	-	96	86.364	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSCAPG00000013275	RPL37A	96	87.500	Cavia_aperea
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ENSPTIG00000019578	-	90	87.500	ENSCANG00000005155	-	96	87.500	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSPTIG00000019578	-	92	73.333	ENSCGRG00001008454	-	94	73.333	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000019578	-	90	81.818	ENSCGRG00001006356	-	96	81.818	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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