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Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000019988 (Gene tree)
Gene ID: 102955668
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4359 bases
Position: chrKE721679.1:1972632-1976990
Accession: 102955668
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000023582	eRF1_2	PF03464.15	3.1e-37	1	1
ENSPTIP00000023582	eRF1_3	PF03465.15	6.3e-27	1	1
ENSPTIP00000023582	eRF1_1	PF03463.15	1.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000028042	PELO-201	4063	XM_007076649	ENSPTIP00000023582	385 (aa)	XP_007076711	UPI00017A1565

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSG00000152684	PELO	100	97.922	Homo_sapiens
ENSPTIG00000019988	PELO	100	79.740	ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000019988	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000019988	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.221	ENSAMEG00000007734	PELO	100	99.221	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000019988	PELO	97	77.212	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.000	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000019988	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000019988	PELO	98	89.894	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.610	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.182	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000019988	PELO	97	81.769	ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.088	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.182	Bos_taurus
ENSPTIG00000019988	PELO	99	57.743	WBGene00011280	pelo-1	100	57.743	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.182	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.481	ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.481	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.922	Capra_hircus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.701	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.221	ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.182	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.442	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.922	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.351	ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000019988	PELO	97	68.901	ENSCING00000001979	-	100	69.351	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	70.130	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.130	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.442	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	95.584	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000019988	PELO	100	96.623	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.623	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	Danio_rerio
ENSPTIG00000019988	PELO	100	95.078	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.078	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.442	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000019988	PELO	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000019988	PELO	71	80.702	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.702	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.961	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.961	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.519	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	Esox_lucius
ENSPTIG00000019988	PELO	100	100.000	ENSFCAG00000032341	PELO	100	100.000	Felis_catus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.805	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000019988	PELO	74	97.887	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.887	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000019988	PELO	98	79.576	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.039	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.519	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.617	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.442	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000019988	PELO	100	95.844	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000019988	PELO	100	77.662	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.260	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.286	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.286	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.299	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.299	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000019988	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.442	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.442	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.442	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.442	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.442	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000019988	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.000	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000019988	PELO	100	96.623	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.623	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.701	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.143	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000019988	PELO	100	79.481	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.481	Mola_mola
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.818	Monopterus_albus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.403	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	Mus_caroli
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.403	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.403	Mus_musculus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.662	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.662	Mus_pahari
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.403	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.403	Mus_spretus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.805	ENSMLUG00000024132	PELO	100	94.805	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.442	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.286	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.286	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000019988	PELO	98	97.625	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.625	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.662	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.662	Octodon_degus
ENSPTIG00000019988	PELO	96	80.270	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.039	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.299	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.558	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.558	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.558	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.922	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.182	Ovis_aries
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.442	Pan_paniscus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	100.000	ENSPPRG00000018800	PELO	100	100.000	Panthera_pardus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.442	Papio_anubis
ENSPTIG00000019988	PELO	100	83.377	ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.377	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.085	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.727	Pelodiscus_sinensis
ENSPTIG00000019988	PELO	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000019988	PELO	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.182	Pongo_abelii
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.701	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000019988	PELO	97	82.306	ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.039	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.662	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.662	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.442	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.442	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000019988	PELO	98	35.065	YNL001W	-	98	35.065	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.922	ENSSBOG00000036140	PELO	100	97.922	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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