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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000020020 (Gene tree)
Gene ID: 102960840
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: ribosomal protein L18a
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3423 bases
Position: chrKE721878.1:2325690-2329112
Accession: 102960840
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000023645	Ribosomal_L18A	PF01775.17	2.1e-56	1	1
ENSPTIP00000023651	Ribosomal_L18A	PF01775.17	4.8e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000028105	-	676	XM_007088367	ENSPTIP00000023645	176 (aa)	XP_007088429	UPI00004A627B
ENSPTIT00000028112	-	414	-	ENSPTIP00000023651	137 (aa)	-	UPI0002A474DF

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03010	Ribosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSG00000105640	RPL18A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSAPOG00000001382	rpl18a	100	88.636	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSAMEG00000010878	RPL18A	99	99.432	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000020020	-	100	87.500	ENSACIG00000008969	rpl18a	100	87.500	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSAOCG00000022332	rpl18a	100	88.636	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000020020	-	100	88.068	ENSAPEG00000024722	rpl18a	100	88.068	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSAPEG00000024678	-	100	88.636	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000020020	-	93	96.850	ENSAPLG00000008007	-	100	97.484	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000020020	-	100	98.864	ENSACAG00000003125	-	100	98.864	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000020020	-	100	78.409	ENSANAG00000025961	-	100	78.409	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000020020	-	100	85.227	ENSANAG00000026599	-	90	96.923	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSANAG00000037640	RPL18A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000020020	-	100	88.068	ENSACLG00000008450	rpl18a	100	88.068	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSAMXG00000034269	rpl18a	100	88.636	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000020020	-	62	90.826	ENSBTAG00000040210	-	100	90.826	Bos_taurus
ENSPTIG00000020020	-	78	94.203	ENSBTAG00000009783	-	68	94.203	Bos_taurus
ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSBTAG00000015831	RPL18A	100	99.432	Bos_taurus
ENSPTIG00000020020	-	99	62.500	WBGene00004432	rpl-20	98	62.500	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCJAG00000040183	RPL18A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCAFG00000015122	-	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPTIG00000020020	-	100	98.864	ENSCAFG00000012879	-	100	98.864	Canis_familiaris
ENSPTIG00000020020	-	65	95.652	ENSCAFG00020020393	-	65	95.652	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCAFG00020011844	-	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCHIG00000025646	-	100	100.000	Capra_hircus
ENSPTIG00000020020	-	93	84.756	ENSTSYG00000028226	-	97	85.806	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000020020	-	97	99.412	ENSTSYG00000032591	-	100	99.412	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000020020	-	100	81.250	ENSTSYG00000034229	-	100	81.250	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000020020	-	85	80.342	ENSCAPG00000016240	-	76	80.342	Cavia_aperea
ENSPTIG00000020020	-	97	99.412	ENSCAPG00000005863	-	93	99.412	Cavia_aperea
ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSCPOG00000015205	-	100	99.432	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000020020	-	81	71.901	ENSCPOG00000021022	-	92	78.261	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000020020	-	93	76.562	ENSCCAG00000023569	-	95	77.707	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCCAG00000022396	RPL18A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000020020	-	99	64.571	ENSCCAG00000025266	-	84	64.571	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000020020	-	95	76.190	ENSCATG00000033551	-	75	76.190	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000020020	-	100	92.701	ENSCATG00000021418	-	100	92.701	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCATG00000030485	-	100	100.000	Cercocebus_atys
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ENSPTIG00000020020	-	100	75.568	ENSCATG00000003729	-	90	84.404	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000020020	-	100	73.295	ENSCLAG00000002210	-	100	73.295	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000020020	-	100	76.642	ENSCLAG00000009994	-	100	81.452	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000020020	-	100	98.864	ENSCLAG00000010952	RPL18A	100	98.864	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSCSAG00000005467	-	100	99.432	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000020020	-	100	92.614	ENSCSAG00000019630	-	100	92.614	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSCPBG00000000983	-	100	99.432	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000020020	-	100	68.539	ENSCING00000005643	-	100	68.539	Ciona_intestinalis
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ENSPTIG00000020020	-	99	68.571	ENSCANG00000033974	-	89	74.312	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000020020	-	83	83.333	ENSCANG00000034442	-	100	72.840	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000020020	-	100	76.705	ENSCANG00000017502	-	100	76.705	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSCANG00000010841	RPL18A	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSPTIG00000020020	-	100	90.909	ENSDARG00000025073	rpl18a	100	90.909	Danio_rerio
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ENSPTIG00000020020	-	99	76.000	ENSDORG00000024213	-	100	76.000	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000020020	-	100	68.750	FBgn0010409	RpL18A	99	68.750	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000020020	-	100	77.273	ENSEBUG00000004139	rpl18a	99	77.273	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000020020	-	100	98.864	ENSEASG00005005956	RPL18A	100	98.864	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000020020	-	100	66.423	ENSEASG00005021380	-	100	66.423	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSELUG00000009374	rpl18a	100	88.636	Esox_lucius
ENSPTIG00000020020	-	61	68.224	ENSFCAG00000042579	-	81	68.224	Felis_catus
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSFCAG00000046739	RPL18A	100	100.000	Felis_catus
ENSPTIG00000020020	-	100	71.533	ENSFCAG00000033151	-	100	71.533	Felis_catus
ENSPTIG00000020020	-	100	98.295	ENSFALG00000009932	-	100	98.295	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000020020	-	100	98.864	ENSFDAG00000014981	RPL18A	100	99.083	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000020020	-	100	89.205	ENSFHEG00000009674	rpl18a	100	89.205	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000020020	-	100	89.205	ENSGMOG00000018907	rpl18a	100	89.205	Gadus_morhua
ENSPTIG00000020020	-	93	96.850	ENSGALG00000049865	-	100	97.959	Gallus_gallus
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ENSPTIG00000020020	-	100	88.636	ENSGACG00000000590	rpl18a	100	88.636	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000020020	-	100	78.652	ENSGAGG00000021349	-	100	78.652	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000020020	-	61	70.238	ENSGAGG00000002452	-	86	70.238	Gopherus_agassizii
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ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSGGOG00000002870	-	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000020020	-	77	97.794	ENSGGOG00000000067	-	100	97.794	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000020020	-	100	90.341	ENSGGOG00000039596	-	85	90.341	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000020020	-	100	93.182	ENSGGOG00000039445	-	100	93.182	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000020020	-	100	88.068	ENSHBUG00000020728	rpl18a	100	88.068	Haplochromis_burtoni
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ENSPTIG00000020020	-	100	90.341	ENSHCOG00000006361	rpl18a	100	90.341	Hippocampus_comes
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ENSPTIG00000020020	-	100	99.432	ENSSTOG00000007788	-	100	99.432	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000020020	-	100	100.000	ENSJJAG00000007815	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000020020	-	100	89.773	ENSKMAG00000019034	rpl18a	100	89.773	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000020020	-	100	81.006	ENSLBEG00000000135	rpl18a	100	81.006	Labrus_bergylta
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