EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000020063 (Gene tree)
Gene ID: 102955534
Gene Symbol: ESF1
Alias: -
Full Name: ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 64178 bases
Position: chrKE721844.1:2838120-2902297
Accession: 102955534
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000023691	NUC153	PF08159.12	1.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000028156	ESF1-201	3383	XM_007086805	ENSPTIP00000023691	850 (aa)	XP_007086867	UPI00042B982E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	86.199	ENSG00000089048	ESF1	99	90.969	Homo_sapiens
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	55.048	ENSAPOG00000003004	esf1	99	55.048	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	87.660	ENSAMEG00000008830	ESF1	100	86.380	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	72.000	ENSACIG00000018305	esf1	90	71.831	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	75.325	ENSAOCG00000006033	esf1	87	74.648	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	75.325	ENSAPEG00000022385	esf1	88	74.648	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000020063	ESF1	76	74.324	ENSATEG00000016321	esf1	85	74.648	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	60.905	ENSAPLG00000012113	ESF1	66	74.686	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000020063	ESF1	66	73.451	ENSACAG00000000963	ESF1	66	73.571	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.731	ENSANAG00000036778	ESF1	100	85.848	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000020063	ESF1	76	71.429	ENSACLG00000002972	esf1	87	70.423	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	64.103	ENSAMXG00000001172	esf1	89	64.789	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.863	ENSBTAG00000007130	ESF1	100	85.797	Bos_taurus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.146	ENSCJAG00000004640	ESF1	100	85.263	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	91.335	ENSCAFG00000005587	ESF1	100	91.335	Canis_familiaris
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	91.335	ENSCAFG00020027530	ESF1	100	91.335	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.598	ENSCHIG00000021188	ESF1	100	85.714	Capra_hircus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.094	ENSTSYG00000009956	ESF1	100	83.860	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000020063	ESF1	80	80.360	ENSCAPG00000010333	-	95	83.036	Cavia_aperea
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	68.273	ENSCAPG00000010466	-	100	68.273	Cavia_aperea
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.679	ENSCPOG00000014027	-	100	80.445	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.848	ENSCCAG00000024521	ESF1	100	85.965	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.309	ENSCATG00000042792	ESF1	100	85.831	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	81.125	ENSCLAG00000013266	-	100	81.712	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.714	ENSCSAG00000011777	ESF1	100	85.597	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000020063	ESF1	67	51.515	ENSCSAVG00000009015	-	87	50.000	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.327	ENSCANG00000030674	ESF1	100	84.444	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.211	ENSCGRG00001018257	Esf1	100	80.328	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000020063	ESF1	73	66.154	ENSCSEG00000001159	esf1	85	66.129	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000020063	ESF1	73	75.385	ENSCVAG00000007894	esf1	90	75.806	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	68.919	ENSDARG00000008740	esf1	86	69.014	Danio_rerio
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	82.827	ENSDNOG00000019409	ESF1	100	83.547	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	79.953	ENSDORG00000016313	Esf1	100	80.303	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	51.948	FBgn0024364	CG11417	85	55.385	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000020063	ESF1	80	83.652	ENSETEG00000004471	ESF1	79	83.652	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	50.937	ENSEBUG00000015161	esf1	87	50.171	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	86.901	ENSEASG00005001777	ESF1	100	86.433	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	87.251	ENSECAG00000019188	ESF1	100	86.784	Equus_caballus
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	60.998	ENSEEUG00000015837	-	99	61.695	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	71.795	ENSELUG00000000408	esf1	82	71.831	Esox_lucius
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	98.244	ENSFCAG00000000919	ESF1	100	98.244	Felis_catus
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	74.686	ENSFALG00000010914	ESF1	65	74.731	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	79.977	ENSFDAG00000014777	ESF1	100	79.625	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	59.369	ENSFHEG00000014984	esf1	99	59.961	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	74.414	ENSGALG00000034768	ESF1	65	74.414	Gallus_gallus
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	67.568	ENSGAFG00000000540	esf1	90	67.606	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.965	ENSGGOG00000006692	ESF1	100	85.614	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000020063	ESF1	79	72.727	ENSHBUG00000001890	esf1	87	71.831	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.751	ENSHGLG00000011505	ESF1	100	80.282	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.751	ENSHGLG00100015045	ESF1	100	80.282	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	69.231	ENSIPUG00000006507	esf1	85	69.014	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	82.593	ENSSTOG00000009846	ESF1	100	82.477	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	79.556	ENSJJAG00000012570	Esf1	100	79.322	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	69.489	ENSLACG00000016439	ESF1	66	69.718	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	71.795	ENSLOCG00000015979	esf1	82	73.239	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	82.009	ENSLAFG00000005479	ESF1	100	82.126	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.426	ENSMFAG00000036841	ESF1	100	85.948	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.309	ENSMNEG00000044042	ESF1	100	85.831	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.192	ENSMLEG00000037121	ESF1	100	85.714	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	74.324	ENSMAMG00000018648	esf1	88	74.648	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	58.532	ENSMZEG00005013912	esf1	99	58.532	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	60.735	ENSMGAG00000004291	ESF1	66	73.874	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	78.246	ENSMAUG00000015975	Esf1	100	79.064	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.082	ENSMICG00000010711	ESF1	100	85.748	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	77.635	ENSMOCG00000005902	Esf1	100	77.310	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	57.795	ENSMMOG00000018693	esf1	99	58.733	Mola_mola
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	69.977	ENSMODG00000005066	ESF1	100	69.357	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000020063	ESF1	68	70.270	ENSMALG00000007338	esf1	79	70.423	Monopterus_albus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	78.154	MGP_CAROLIEiJ_G0024365	Esf1	100	78.322	Mus_caroli
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	77.453	ENSMUSG00000045624	Esf1	100	78.205	Mus_musculus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	79.064	MGP_PahariEiJ_G0025810	Esf1	100	78.713	Mus_pahari
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	77.687	MGP_SPRETEiJ_G0025285	Esf1	98	82.550	Mus_spretus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	91.452	ENSMPUG00000001450	ESF1	100	89.696	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	87.368	ENSMLUG00000013080	ESF1	100	87.135	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	83.860	ENSNLEG00000014563	ESF1	100	83.158	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000020063	ESF1	58	96.000	ENSMEUG00000005061	-	72	60.248	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000020063	ESF1	60	83.858	ENSOPRG00000004862	ESF1	100	83.858	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.422	ENSODEG00000006824	ESF1	100	80.305	Octodon_degus
ENSPTIG00000020063	ESF1	77	72.727	ENSONIG00000006804	esf1	87	71.831	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	82.079	ENSOANG00000008432	-	100	67.691	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	80.140	ENSOCUG00000005414	ESF1	100	79.439	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	54.135	ENSORLG00000018625	esf1	99	52.820	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	69.231	ENSORLG00015022826	esf1	91	67.606	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	54.215	ENSOMEG00000009311	esf1	99	54.286	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	79.322	ENSOGAG00000016912	ESF1	100	78.972	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.091	ENSOARG00000011158	ESF1	100	83.636	Ovis_aries
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.146	ENSPPAG00000024379	ESF1	100	84.561	Pan_paniscus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	99.060	ENSPPRG00000012007	ESF1	100	99.060	Panthera_pardus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.579	ENSPTRG00000013258	ESF1	100	85.514	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	73.077	ENSPKIG00000024448	esf1	78	74.648	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000020063	ESF1	78	64.935	ENSPMGG00000016911	esf1	72	53.251	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	70.396	ENSPCIG00000019331	ESF1	100	70.163	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000020063	ESF1	76	63.514	ENSPFOG00000010101	esf1	88	64.789	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000020063	ESF1	59	57.874	ENSPLAG00000006452	esf1	99	57.480	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	64.865	ENSPMEG00000000713	esf1	88	64.789	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000020063	ESF1	78	64.865	ENSPREG00000004431	esf1	86	64.789	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.579	ENSPPYG00000010715	ESF1	100	85.164	Pongo_abelii
ENSPTIG00000020063	ESF1	74	76.101	ENSPCAG00000006881	ESF1	100	75.350	Procavia_capensis
ENSPTIG00000020063	ESF1	84	94.444	ENSPVAG00000001295	ESF1	83	94.366	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000020063	ESF1	79	70.130	ENSPNYG00000015735	esf1	88	70.423	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000020063	ESF1	65	54.983	ENSPNAG00000014721	esf1	100	48.808	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	77.220	ENSRNOG00000004777	Esf1	100	77.804	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.597	ENSRBIG00000035763	ESF1	100	86.066	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	86.066	ENSRROG00000032022	ESF1	100	86.066	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000020063	ESF1	55	34.834	YDR365C	-	73	35.019	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	84.168	ENSSBOG00000030387	ESF1	100	84.831	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	69.464	ENSSHAG00000000449	ESF1	100	69.930	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	72.973	ENSSDUG00000019460	esf1	91	73.239	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	62.515	ENSSPUG00000012635	ESF1	70	75.357	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000020063	ESF1	75	73.077	ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.239	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000020063	ESF1	100	85.930	ENSSSCG00000007077	ESF1	100	86.395	Sus_scrofa
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