EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000021539 (Gene tree)
Gene ID: 102961423
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31424 bases
Position: chrKE721890.1:6559257-6590680
Accession: 102961423
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000025932	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	8.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000030476	TWISTNB-201	2398	XM_007089109	ENSPTIP00000025932	297 (aa)	XP_007089171	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	83.108	ENSG00000105849	TWISTNB	87	83.446	Homo_sapiens
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	42.405	ENSAPOG00000011796	twistnb	75	44.792	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	75.723	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	88	75.723	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	92	44.257	ENSACIG00000020400	twistnb	76	44.251	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	64	53.061	ENSAOCG00000024200	twistnb	75	45.139	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	64	53.061	ENSAPEG00000016750	twistnb	75	45.833	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	54	59.375	ENSATEG00000017956	twistnb	84	45.483	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	54	65.000	ENSACAG00000011817	TWISTNB	81	65.000	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	81.570	ENSANAG00000026418	TWISTNB	89	81.333	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	58	57.225	ENSAMXG00000035868	twistnb	52	57.225	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.550	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	90	81.544	Bos_taurus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	82.935	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	88	82.667	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.046	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	89	83.333	Canis_familiaris
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.237	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	83	84.539	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.728	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	90	81.728	Capra_hircus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	80.936	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	88	80.667	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	79.470	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	89	79.801	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.145	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	88	82.215	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSCATG00000035621	TWISTNB	87	82.770	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	79.333	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	89	79.402	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	87	82.770	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	75	97.872	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	66	97.872	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	61.794	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	91	63.423	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSCANG00000038759	TWISTNB	87	82.770	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	76.431	ENSCGRG00001000499	Twistnb	88	76.431	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.609	ENSDNOG00000006438	-	89	83.612	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	90	81.852	ENSDORG00000007795	Twistnb	84	81.852	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	88.926	ENSEASG00005021702	TWISTNB	85	88.926	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	88.926	ENSECAG00000014563	TWISTNB	85	88.926	Equus_caballus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	93	43.643	ENSELUG00000000098	TWISTNB	77	45.361	Esox_lucius
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	96.970	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	89	96.970	Felis_catus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	95	51.667	ENSFALG00000009761	TWISTNB	98	51.667	Ficedula_albicollis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	81.229	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	89	80.667	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	56.376	ENSGALG00000010863	TWISTNB	74	56.478	Gallus_gallus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	79	46.025	ENSGACG00000006425	twistnb	63	56.364	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.770	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	87	83.108	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.145	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	89	80.936	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	81.507	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	89	80.936	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	40.373	ENSIPUG00000004117	twistnb	87	41.358	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.605	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	82	81.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	77.027	ENSJJAG00000015887	Twistnb	88	77.027	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	92	45.238	ENSLBEG00000024225	twistnb	75	46.479	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	53.698	ENSLACG00000010508	TWISTNB	86	53.094	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	56	67.470	ENSLOCG00000011399	twistnb	50	67.470	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	84.848	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	89	85.522	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	87	82.770	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	86	82.770	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	87	82.770	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	87	82.770	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	83.444	ENSMICG00000036489	TWISTNB	89	83.444	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	94	78.445	ENSMOCG00000003458	Twistnb	87	78.799	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	92	61.071	ENSMODG00000001402	-	64	60.269	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	76.412	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	87	78.472	Mus_caroli
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	76.846	ENSMUSG00000020561	Twistnb	89	76.333	Mus_musculus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	95	79.371	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	87	79.371	Mus_pahari
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	76.667	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	89	76.667	Mus_spretus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	89.226	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	83	89.226	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	76.080	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	96	78.073	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	55	91.975	ENSNGAG00000022455	Twistnb	81	91.975	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.828	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	88	82.886	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	76.159	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	89	76.490	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	78.146	ENSODEG00000007222	TWISTNB	89	76.721	Octodon_degus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.940	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	88	81.395	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	82.000	ENSOARG00000009803	TWISTNB	88	82.000	Ovis_aries
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	83.108	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	87	83.108	Pan_paniscus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	97.643	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	89	97.643	Panthera_pardus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	83.108	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	87	83.446	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSPANG00000015736	TWISTNB	87	82.770	Papio_anubis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	88	61.654	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	88	57.576	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	81.818	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	87	82.155	Pongo_abelii
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	95	83.333	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	85	84.722	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	80.201	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	87	81.879	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	94	41.275	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	53.514	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	94	79.787	ENSRNOG00000010750	Twistnb	88	79.225	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	86	82.770	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	82.095	ENSRROG00000040155	TWISTNB	87	82.770	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	97	80.887	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	89	81.333	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	45.307	ENSSFOG00015012788	twistnb	96	45.307	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	41.772	ENSSMAG00000012792	twistnb	76	42.908	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	56	58.788	ENSSDUG00000007038	twistnb	76	46.181	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	93	53.819	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	85	53.358	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	64	53.061	ENSSPAG00000005871	twistnb	75	43.706	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	84.158	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	89	83.168	Sus_scrofa
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	51	72.848	ENSTGUG00000002645	TWISTNB	100	72.848	Taeniopygia_guttata
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	93	43.599	ENSTNIG00000017778	twistnb	82	46.097	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	98	83.446	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	87	83.446	Tupaia_belangeri
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	89.632	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	89	89.632	Ursus_americanus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	89.298	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	89	89.298	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	83.224	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	90	85.197	Vulpes_vulpes