EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000021656 (Gene tree)
Gene ID: 102967970
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11227 bases
Position: chrKE722358.1:37566-48792
Accession: 102967970
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000026137	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.2e-39	1	1
ENSPTIP00000026137	DEAD	PF00270.29	3.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000030686	SKIV2L-201	3738	XM_007098748	ENSPTIP00000026137	1245 (aa)	XP_007098810	-
ENSPTIT00000030689	SKIV2L-202	210	-	ENSPTIP00000026140	70 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPTIG00000021656's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTIG00000021656's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	76	35.781	ENSPTIG00000009313	MTREX	87	35.781

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.944	ENSG00000204351	SKIV2L	100	94.944	Homo_sapiens
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.349	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.512	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	97.512	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.936	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.190	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.205	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.032	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.044	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.766	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.528	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	64.863	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	65.605	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.265	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	95.265	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.349	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.384	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	59.392	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.472	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.265	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	95.265	Bos_taurus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	96	39.158	WBGene00008502	skih-2	99	39.127	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.623	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.623	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.111	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	97.111	Canis_familiaris
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.030	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	97.030	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.265	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	95.265	Capra_hircus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.703	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.703	Carlito_syrichta
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.536	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.536	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.185	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	95.185	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.543	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	94.543	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.419	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.419	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.623	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	94.623	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	94	50.804	ENSCING00000005576	-	99	50.464	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	94.940	ENSCANG00000039709	SKIV2L	98	94.939	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.665	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.665	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.876	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.628	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.164	ENSCVAG00000003072	skiv2l	97	65.041	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.568	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.512	Danio_rerio
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	88.471	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	89.103	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	93	43.504	FBgn0039117	tst	97	43.515	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	69	93.702	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	93.702	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	89	56.397	ENSEBUG00000013680	-	95	57.007	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	93	96.127	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	96.127	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	96	95.210	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	95.847	Equus_caballus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	54	99.597	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	99.597	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.206	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.391	Esox_lucius
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	99.037	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	99.037	Felis_catus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	89.816	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.056	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.997	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.107	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.392	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.416	Gadus_morhua
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	77	60.395	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.619	Gallus_gallus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.234	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.187	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.921	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.032	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.783	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	94.783	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.190	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.223	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	91.026	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	91.026	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	88.542	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	88.542	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	59.642	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.235	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.479	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.583	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.104	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.104	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	71	59.953	ENSLACG00000002986	-	73	59.701	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.660	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.660	Loxodonta_africana
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.783	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.783	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.703	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	94.703	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.703	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.703	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.543	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	94.543	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.777	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.723	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.190	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.223	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	70	50.314	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.314	Meleagris_gallopavo
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.702	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.949	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.623	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	94.776	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.061	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.414	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.537	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.520	Mola_mola
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	87.990	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.990	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.581	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	Monopterus_albus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.943	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.943	Mus_caroli
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.943	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	92.943	Mus_musculus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.702	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.702	Mus_pahari
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.542	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.542	Mus_spretus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.191	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	97.191	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.462	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	94.462	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.495	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.645	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	91.524	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	91.755	Nomascus_leucogenys
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.222	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	Ochotona_princeps
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.055	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.055	Octodon_degus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.901	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.267	Oreochromis_niloticus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.864	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.864	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.490	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.365	Oryzias_latipes
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.410	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.285	Oryzias_latipes_hni
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.124	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.124	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	62.033	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.767	Oryzias_melastigma
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.703	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.703	Otolemur_garnettii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	89.663	ENSOARG00000002411	-	100	89.663	Ovis_aries
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	93.922	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	93.994	Pan_paniscus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	99.278	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	99.278	Panthera_pardus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.864	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.864	Pan_troglodytes
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	93.350	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	93.420	Papio_anubis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.331	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.370	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.520	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.585	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	93.585	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	87.760	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.760	Phascolarctos_cinereus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.234	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.187	Poecilia_formosa
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.362	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.316	Poecilia_latipinna
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.313	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.267	Poecilia_mexicana
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.887	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.854	Poecilia_reticulata
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.222	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.222	Pongo_abelii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	77	94.730	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.730	Procavia_capensis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.827	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.827	Propithecus_coquereli
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.900	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.900	Pteropus_vampyrus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.839	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	66.219	Pundamilia_nyererei
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	60.786	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.946	Pygocentrus_nattereri
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.665	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.665	Rattus_norvegicus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	92.146	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	92.214	Rhinopithecus_bieti
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.623	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	94.623	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	93	37.460	YLR398C	-	93	37.381	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	94.944	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.944	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	87.430	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.458	Sarcophilus_harrisii
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.770	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.133	Scleropages_formosus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.814	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.514	Scophthalmus_maximus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.203	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.236	Seriola_dumerili
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.614	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	59.756	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	62.026	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.126	Sphenodon_punctatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	94	61.037	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.814	Stegastes_partitus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.506	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.506	Sus_scrofa
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	74	62.231	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.217	Takifugu_rubripes
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.363	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.355	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	94	93.497	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	Tupaia_belangeri
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	90.530	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.530	Tursiops_truncatus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	97.913	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	97.913	Ursus_americanus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	93	98.021	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	98.021	Ursus_maritimus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	97.258	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	97.258	Vulpes_vulpes
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	58.208	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.399	Xenopus_tropicalis
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.218	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.215	Xiphophorus_couchianus
ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.966	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.835	Xiphophorus_maculatus