EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000021678 (Gene tree)
Gene ID: 102950009
Gene Symbol: MSI2
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 388955 bases
Position: chrKE721843.1:6048795-6437749
Accession: 102950009
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000026166	RRM_1	PF00076.22	2.7e-30	1	2
ENSPTIP00000026166	RRM_1	PF00076.22	2.7e-30	2	2
ENSPTIP00000026168	RRM_1	PF00076.22	4.9e-30	1	2
ENSPTIP00000026168	RRM_1	PF00076.22	4.9e-30	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000030719	MSI2-202	975	XM_007086707	ENSPTIP00000026168	324 (aa)	XP_007086769	-
ENSPTIT00000030716	MSI2-201	756	-	ENSPTIP00000026166	251 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptg03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000021678	MSI2	60	42.105	ENSPTIG00000012111	CIRBP	74	42.105
ENSPTIG00000021678	MSI2	66	46.243	ENSPTIG00000019434	HNRNPD	77	46.243
ENSPTIG00000021678	MSI2	79	32.338	ENSPTIG00000021689	-	76	32.338
ENSPTIG00000021678	MSI2	62	50.000	ENSPTIG00000021727	HNRNPAB	94	44.444
ENSPTIG00000021678	MSI2	88	82.667	ENSPTIG00000021873	-	87	82.667
ENSPTIG00000021678	MSI2	63	48.701	ENSPTIG00000018505	HNRNPDL	79	40.611
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	42.405	ENSPTIG00000008598	HNRNPA3	65	39.013
ENSPTIG00000021678	MSI2	71	37.634	ENSPTIG00000019051	-	88	37.634
ENSPTIG00000021678	MSI2	80	33.083	ENSPTIG00000011396	TARDBP	50	33.333
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	71.519	ENSPTIG00000008913	MSI1	100	69.132
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	40.698	ENSPTIG00000019833	HNRNPA2B1	82	40.230
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	42.405	ENSPTIG00000014387	-	66	39.013
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	40.476	ENSPTIG00000006805	-	58	40.964
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	41.772	ENSPTIG00000015170	HNRNPA1	71	40.476
ENSPTIG00000021678	MSI2	55	43.860	ENSPTIG00000017702	RBM3	89	43.860
ENSPTIG00000021678	MSI2	64	41.447	ENSPTIG00000016796	-	86	36.190
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	41.667	ENSPTIG00000012046	DAZAP1	51	41.667
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	30.323	ENSPTIG00000014945	-	51	30.323

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSG00000153944	MSI2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	88.141	ENSAPOG00000001658	msi2a	94	87.658	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSAMEG00000002697	MSI2	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	92.788	ENSACIG00000009475	msi2a	94	77.528	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	85.965	ENSAOCG00000014822	msi2a	64	85.965	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	88.141	ENSAPEG00000007706	msi2a	94	87.658	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	88.141	ENSATEG00000010498	msi2a	94	87.658	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.500	ENSATEG00000003301	-	100	87.500	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021678	MSI2	84	97.849	ENSACAG00000005452	MSI2	68	97.826	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSANAG00000037827	MSI2	96	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.821	ENSACLG00000007752	msi2a	94	87.342	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	89.423	ENSAMXG00000032796	msi2a	94	85.852	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	90.354	ENSAMXG00000010474	msi2b	97	90.354	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	93.891	ENSBTAG00000004406	MSI2	97	93.891	Bos_taurus
ENSPTIG00000021678	MSI2	79	62.150	WBGene00003423	msi-1	71	62.150	Caenorhabditis_elegans
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSCJAG00000013998	MSI2	96	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSCAFG00020025620	MSI2	81	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	93.891	ENSCHIG00000016580	MSI2	94	93.891	Capra_hircus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	89.667	ENSCPOG00000034042	MSI2	99	89.667	Cavia_porcellus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSCCAG00000033927	MSI2	96	100.000	Cebus_capucinus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSCATG00000040879	MSI2	96	100.000	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSCLAG00000014325	MSI2	94	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSCSAG00000005633	MSI2	94	94.212	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTIG00000021678	MSI2	72	100.000	ENSCHOG00000008660	MSI2	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	93.688	ENSCPBG00000009942	MSI2	96	93.688	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000021678	MSI2	76	72.222	ENSCING00000018579	-	97	49.791	Ciona_intestinalis
ENSPTIG00000021678	MSI2	78	65.217	ENSCSAVG00000010397	-	76	62.389	Ciona_savignyi
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSCANG00000036414	MSI2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	93.910	ENSCGRG00001013330	Msi2	94	93.910	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	99.679	ENSCGRG00000003141	Msi2	100	99.679	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTIG00000021678	MSI2	84	69.340	ENSCSEG00000013557	msi2a	83	67.925	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	70.470	ENSCSEG00000013549	msi2a	88	70.470	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	79.100	ENSCSEG00000003266	-	91	79.100	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.821	ENSCVAG00000017075	msi2a	94	87.342	Cyprinodon_variegatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	92.823	ENSDARG00000033901	msi2a	95	78.754	Danio_rerio
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	96.172	ENSDARG00000032614	msi2b	100	98.020	Danio_rerio
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.118	ENSDNOG00000014501	MSI2	100	94.118	Dasypus_novemcinctus
ENSPTIG00000021678	MSI2	84	81.395	ENSDORG00000005394	Msi2	84	81.395	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000021678	MSI2	62	100.000	ENSDORG00000028440	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	58.258	FBgn0260943	Rbp6	88	68.750	Drosophila_melanogaster
ENSPTIG00000021678	MSI2	82	76.316	ENSETEG00000012450	-	64	76.316	Echinops_telfairi
ENSPTIG00000021678	MSI2	84	81.604	ENSEBUG00000006732	msi2a	86	68.710	Eptatretus_burgeri
ENSPTIG00000021678	MSI2	88	100.000	ENSEASG00005002965	MSI2	97	88.690	Equus_asinus_asinus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	97.179	ENSECAG00000011435	MSI2	94	97.179	Equus_caballus
ENSPTIG00000021678	MSI2	89	78.967	ENSEEUG00000007810	MSI2	100	78.967	Erinaceus_europaeus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	89.032	ENSELUG00000011747	msi2a	93	89.032	Esox_lucius
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	92.332	ENSELUG00000001361	msi2b	93	92.332	Esox_lucius
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	82.645	ENSFCAG00000033787	-	69	82.645	Felis_catus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSFCAG00000041686	MSI2	96	100.000	Felis_catus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.821	ENSFHEG00000000084	msi2a	94	87.342	Fundulus_heteroclitus
ENSPTIG00000021678	MSI2	59	95.652	ENSGMOG00000007596	-	80	95.652	Gadus_morhua
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	98.392	ENSGALG00000005567	MSI2	94	98.392	Gallus_gallus
ENSPTIG00000021678	MSI2	92	79.139	ENSGAFG00000006974	msi2a	78	95.690	Gambusia_affinis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	96.053	ENSGAGG00000016542	MSI2	100	96.053	Gopherus_agassizii
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSGGOG00000013182	MSI2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.821	ENSHBUG00000020800	msi2a	94	87.342	Haplochromis_burtoni
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	90.032	ENSHGLG00000012444	MSI2	89	90.032	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTIG00000021678	MSI2	81	100.000	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000021678	MSI2	62	99.020	ENSHGLG00100004028	-	88	99.020	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTIG00000021678	MSI2	93	85.149	ENSHCOG00000000266	msi2a	91	84.691	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	86.603	ENSHCOG00000017241	-	70	87.560	Hippocampus_comes
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	86.452	ENSIPUG00000003732	msi2b	93	86.452	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.742	ENSIPUG00000021097	msi2a	93	86.452	Ictalurus_punctatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	89.667	ENSSTOG00000007884	MSI2	99	89.667	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	62	100.000	ENSJJAG00000009467	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000021678	MSI2	81	88.889	ENSJJAG00000006292	-	100	88.406	Jaculus_jaculus
ENSPTIG00000021678	MSI2	92	86.242	ENSKMAG00000009494	msi2a	89	86.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	85.052	ENSLBEG00000026223	-	100	68.915	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.742	ENSLBEG00000007061	msi2a	93	87.742	Labrus_bergylta
ENSPTIG00000021678	MSI2	61	97.101	ENSLACG00000016798	MSI2	89	97.101	Latimeria_chalumnae
ENSPTIG00000021678	MSI2	83	96.172	ENSLOCG00000004675	msi2b	95	81.818	Lepisosteus_oculatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSMFAG00000003775	MSI2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSMMUG00000002069	MSI2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSMNEG00000045275	MSI2	96	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSMLEG00000033888	MSI2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	85.161	ENSMAMG00000002488	-	85	95.690	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.138	ENSMAMG00000010503	msi2a	94	85.489	Mastacembelus_armatus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.460	ENSMZEG00005007676	msi2a	94	87.460	Maylandia_zebra
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	99.679	ENSMAUG00000003862	Msi2	94	99.679	Mesocricetus_auratus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSMICG00000013598	-	96	100.000	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	75.000	ENSMICG00000032913	-	93	73.397	Microcebus_murinus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSMOCG00000005820	Msi2	94	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSPTIG00000021678	MSI2	87	89.545	ENSMMOG00000008348	msi2a	91	82.428	Mola_mola
ENSPTIG00000021678	MSI2	81	98.551	ENSMODG00000014790	MSI2	100	98.551	Monodelphis_domestica
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	88.141	ENSMALG00000000071	msi2a	93	94.915	Monopterus_albus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016948	Msi2	100	100.000	Mus_caroli
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSMUSG00000069769	Msi2	100	100.000	Mus_musculus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	Mus_pahari
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0017795	Msi2	100	100.000	Mus_spretus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSMPUG00000015377	MSI2	97	94.212	Mustela_putorius_furo
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	94.212	ENSMLUG00000007865	MSI2	97	94.212	Myotis_lucifugus
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSNGAG00000017807	Msi2	94	100.000	Nannospalax_galili
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	87.419	ENSNBRG00000014596	msi2a	93	87.419	Neolamprologus_brichardi
ENSPTIG00000021678	MSI2	96	100.000	ENSNLEG00000008059	MSI2	100	100.000	Nomascus_leucogenys
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