EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTIG00000021840 (Gene tree)
Gene ID: 107180179
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Panthera_tigris_altaica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 426 bases
Position: chrKE721870.1:2213471-2213896
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTIP00000026417	Ribosomal_S27e	PF01667.17	1.9e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTIT00000030980	-	138	-	ENSPTIP00000026417	45 (aa)	-	UPI0000E36D3B

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTIG00000021840	-	100	84.444	ENSPTIG00000002644	-	54	84.444
ENSPTIG00000021840	-	98	95.455	ENSPTIG00000005252	-	53	95.455
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSPTIG00000000664	-	87	100.000
ENSPTIG00000021840	-	100	88.889	ENSPTIG00000008242	-	54	88.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSG00000177954	RPS27	54	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSG00000185088	RPS27L	87	100.000	Homo_sapiens
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAPOG00000005670	-	54	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAPOG00000021935	-	54	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAMEG00000011918	RPS27	55	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSACIG00000008615	-	85	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021840	-	100	95.556	ENSACIG00000001758	rps27l	54	95.556	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021840	-	98	70.455	ENSACIG00000004508	-	51	70.455	Amphilophus_citrinellus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAOCG00000015872	-	54	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAOCG00000014172	rps27.1	54	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAPEG00000004072	-	54	100.000	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAPEG00000008974	rps27.1	54	100.000	Amphiprion_percula
ENSPTIG00000021840	-	96	72.093	ENSATEG00000005191	-	51	72.093	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSATEG00000023669	rps27.2	54	100.000	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSATEG00000009100	-	54	100.000	Anabas_testudineus
ENSPTIG00000021840	-	80	97.222	ENSAPLG00000003604	RPS27L	84	97.222	Anas_platyrhynchos
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSACAG00000011604	RPS27	55	100.000	Anolis_carolinensis
ENSPTIG00000021840	-	100	95.556	ENSANAG00000020185	-	54	95.556	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSANAG00000005652	-	55	97.778	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSANAG00000029042	-	54	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSANAG00000019250	-	54	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	95.556	ENSANAG00000018728	-	54	95.556	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	84.444	ENSANAG00000026287	-	51	84.444	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	98	95.455	ENSANAG00000009144	-	52	95.455	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSANAG00000015540	-	54	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSANAG00000031242	-	54	97.778	Aotus_nancymaae
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSACLG00000019602	rps27.2	54	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSACLG00000018208	rps27l	54	97.778	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSACLG00000009839	-	54	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAMXG00000042422	rps27l	54	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSAMXG00000001908	-	54	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSBTAG00000013866	RPS27	54	100.000	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSBTAG00000012898	RPS27L	54	100.000	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	93.333	ENSBTAG00000024125	-	54	93.333	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	89.130	ENSBTAG00000054946	-	54	89.130	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSBTAG00000054845	-	57	100.000	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSBTAG00000051063	-	54	97.778	Bos_taurus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCJAG00000009929	-	54	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCJAG00000033468	-	54	97.778	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCJAG00000039687	-	54	97.778	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	95.745	ENSCJAG00000041511	-	55	95.745	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCJAG00000047127	-	54	97.778	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCJAG00000041427	-	54	97.778	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	93.333	ENSCJAG00000039189	-	54	93.333	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCJAG00000046176	-	54	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCAFG00000012234	-	54	97.778	Canis_familiaris
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCAFG00000017386	RPS27	54	100.000	Canis_familiaris
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCAFG00000024322	-	54	100.000	Canis_familiaris
ENSPTIG00000021840	-	100	95.556	ENSCAFG00020027228	-	54	95.556	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021840	-	100	95.556	ENSCAFG00020003365	-	54	95.556	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021840	-	100	82.222	ENSCAFG00020001079	-	53	82.222	Canis_lupus_dingo
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCHIG00000010433	-	54	100.000	Capra_hircus
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ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCHIG00000005073	-	54	97.778	Capra_hircus
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCHIG00000003580	-	54	100.000	Capra_hircus
ENSPTIG00000021840	-	100	91.111	ENSCHIG00000003074	-	54	91.111	Capra_hircus
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSTSYG00000026353	-	55	97.778	Carlito_syrichta
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ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSTSYG00000000110	-	54	97.778	Carlito_syrichta
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ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCATG00000020616	-	54	97.778	Cercocebus_atys
ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCATG00000044914	-	54	100.000	Cercocebus_atys
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ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCLAG00000010811	RPS27L	54	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCSAG00000000654	-	54	97.778	Chlorocebus_sabaeus
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ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCHOG00000009566	-	54	100.000	Choloepus_hoffmanni
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ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCPBG00000024675	-	54	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTIG00000021840	-	100	97.778	ENSCSAVG00000005322	-	54	97.778	Ciona_savignyi
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ENSPTIG00000021840	-	100	100.000	ENSCANG00000008344	-	54	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTIG00000021840	-	100	93.333	ENSCANG00000027967	-	61	93.333	Colobus_angolensis_palliatus
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