EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTRG00000000352 (Gene tree)
Gene ID: 456634
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pan_troglodytes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10765 bases
Position: chr1:24432283-24443047
Accession: 8512
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTRP00000085666	SYF2	PF08231.12	2.5e-54	1	1
ENSPTRP00000000615	SYF2	PF08231.12	6.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTRT00000106945	-	2107	XM_016950617	ENSPTRP00000085666	201 (aa)	XP_016806106	A0A2I3T8U7
ENSPTRT00000000696	-	1325	-	ENSPTRP00000000615	243 (aa)	-	G2HJ79

Gene Model

Click here to download ENSPTRG00000000352's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptr03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTRG00000000352's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	100.000	ENSG00000117614	SYF2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	84.475	ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	93.361	ENSAMEG00000010115	-	99	92.946	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTRG00000000352	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	74.699	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.326	Amphilophus_citrinellus
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	80.252	ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	Amphiprion_ocellaris
ENSPTRG00000000352	SYF2	88	79.452	ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	Amphiprion_ocellaris
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	80.932	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	Amphiprion_percula
ENSPTRG00000000352	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	Anabas_testudineus
ENSPTRG00000000352	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSPTRG00000000352	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSPTRG00000000352	SYF2	79	75.472	ENSACAG00000026777	-	95	75.472	Anolis_carolinensis
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	Aotus_nancymaae
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.407	Astatotilapia_calliptera
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	ENSAMXG00000004051	syf2	91	83.333	Astyanax_mexicanus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	92.245	Bos_taurus
ENSPTRG00000000352	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	98.354	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	Callithrix_jacchus
ENSPTRG00000000352	SYF2	92	88.839	ENSCAFG00000030331	-	100	82.716	Canis_familiaris
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00000012895	-	99	94.262	Canis_familiaris
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00020021091	-	99	94.262	Canis_lupus_dingo
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	87.895	ENSCAFG00020021094	-	100	83.824	Canis_lupus_dingo
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.181	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	Capra_hircus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	94.239	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	Carlito_syrichta
ENSPTRG00000000352	SYF2	81	98.990	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	Cavia_aperea
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.215	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	94.215	Cavia_porcellus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	98.354	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	98.354	Cebus_capucinus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.531	ENSCATG00000026917	SYF2	100	97.531	Cercocebus_atys
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	97.425	ENSCLAG00000008474	SYF2	95	97.425	Chinchilla_lanigera
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.531	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.531	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTRG00000000352	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPTRG00000000352	SYF2	92	88.839	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	86.695	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTRG00000000352	SYF2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	46.392	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	84.362	ENSCANG00000037322	SYF2	100	84.362	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTRG00000000352	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.735	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	Cyprinodon_variegatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	77.917	ENSDARG00000004706	syf2	99	78.243	Danio_rerio
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	93.827	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.827	Dasypus_novemcinctus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	92.149	ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.149	Dipodomys_ordii
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	92	58.454	Drosophila_melanogaster
ENSPTRG00000000352	SYF2	94	77.293	ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	Echinops_telfairi
ENSPTRG00000000352	SYF2	89	55.495	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.245	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	82.305	ENSEASG00005004232	-	100	82.305	Equus_asinus_asinus
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.142	ENSECAG00000010440	-	99	93.277	Equus_caballus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.653	ENSECAG00000012023	-	100	92.653	Equus_caballus
ENSPTRG00000000352	SYF2	75	81.421	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	Erinaceus_europaeus
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	80.252	ENSELUG00000003465	syf2	100	80.252	Esox_lucius
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.672	ENSFCAG00000043095	-	99	94.262	Felis_catus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	94.694	ENSFCAG00000010324	-	85	94.286	Felis_catus
ENSPTRG00000000352	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	Ficedula_albicollis
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.827	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	Fukomys_damarensis
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	67.273	ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	Fundulus_heteroclitus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSPTRG00000000352	SYF2	92	87.946	ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	Gallus_gallus
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	75.424	ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	Gambusia_affinis
ENSPTRG00000000352	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	92	89.286	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	Gopherus_agassizii
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	100.000	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.407	Haplochromis_burtoni
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	83.700	ENSHGLG00000004304	-	99	79.583	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	78.008	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.178	Hippocampus_comes
ENSPTRG00000000352	SYF2	91	83.258	ENSIPUG00000019859	syf2	91	84.722	Ictalurus_punctatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	60	97.945	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	76.987	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	Labrus_bergylta
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	80.000	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSPTRG00000000352	SYF2	97	80.851	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	Lepisosteus_oculatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.653	ENSLAFG00000023150	-	100	92.653	Loxodonta_africana
ENSPTRG00000000352	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	97.942	Macaca_fascicularis
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.942	Macaca_mulatta
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	97.942	Macaca_nemestrina
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.531	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.531	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTRG00000000352	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	90	81.944	Mastacembelus_armatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	78.390	ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	Maylandia_zebra
ENSPTRG00000000352	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	90.535	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.535	Mesocricetus_auratus
ENSPTRG00000000352	SYF2	89	97.753	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.770	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	Microtus_ochrogaster
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	79.909	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.093	Mola_mola
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	88.546	ENSMODG00000013951	-	95	89.450	Monodelphis_domestica
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	76.349	ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	Monopterus_albus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.947	Mus_caroli
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.947	Mus_musculus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.947	Mus_pahari
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.947	Mus_spretus
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.583	ENSMPUG00000015801	-	98	94.167	Mustela_putorius_furo
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.672	ENSMPUG00000015802	-	99	94.672	Mustela_putorius_furo
ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.118	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	Myotis_lucifugus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSPTRG00000000352	SYF2	97	72.083	ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	Neolamprologus_brichardi
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	99.588	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	99.588	Nomascus_leucogenys
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	84.979	ENSODEG00000014338	-	98	84.979	Octodon_degus
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	95.279	ENSODEG00000017664	-	98	95.279	Octodon_degus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	ENSONIG00000008213	syf2	91	81.944	Oreochromis_niloticus
ENSPTRG00000000352	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	95.082	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.082	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	82.648	ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	Oryzias_latipes
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	78.481	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.562	ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	Oryzias_melastigma
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.215	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	Otolemur_garnettii
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.308	Ovis_aries
ENSPTRG00000000352	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	100.000	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	94.715	ENSPPRG00000001638	-	100	94.309	Panthera_pardus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.672	ENSPPRG00000001651	-	99	94.262	Panthera_pardus
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	96.903	ENSPTIG00000005711	-	82	96.903	Panthera_tigris_altaica
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.262	ENSPTIG00000007036	-	99	93.852	Panthera_tigris_altaica
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSPANG00000008139	SYF2	100	97.942	Papio_anubis
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	80.687	ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	85.837	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	85.837	Pelodiscus_sinensis
ENSPTRG00000000352	SYF2	97	77.966	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.407	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	93.778	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	95.370	Phascolarctos_cinereus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	Poecilia_formosa
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	ENSPLAG00000006691	syf2	92	80.930	Poecilia_latipinna
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	73.504	ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.077	Poecilia_mexicana
ENSPTRG00000000352	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	91	81.019	Poecilia_reticulata
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	99.177	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	99.177	Pongo_abelii
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	77.114	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	Propithecus_coquereli
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	82.305	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	Pteropus_vampyrus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.279	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.407	Pundamilia_nyererei
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	79.424	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.012	Pygocentrus_nattereri
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.947	Rattus_norvegicus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	95.473	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.473	Rhinopithecus_bieti
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.942	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.119	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	97.119	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	92.000	ENSSHAG00000015630	-	87	93.056	Sarcophilus_harrisii
ENSPTRG00000000352	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSPTRG00000000352	SYF2	93	82.222	ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.722	Scleropages_formosus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.651	ENSSMAG00000009867	syf2	91	81.944	Scophthalmus_maximus
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.333	Seriola_dumerili
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	74.590	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	Sorex_araneus
ENSPTRG00000000352	SYF2	95	86.147	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	Sphenodon_punctatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	78.151	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	Stegastes_partitus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	91.770	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	Sus_scrofa
ENSPTRG00000000352	SYF2	58	73.504	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	Taeniopygia_guttata
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	74.486	ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	Takifugu_rubripes
ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	71.193	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	Tupaia_belangeri
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	Tursiops_truncatus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	93.443	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	93.033	Ursus_americanus
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	93.852	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.443	Ursus_maritimus
ENSPTRG00000000352	SYF2	100	93.033	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	Vicugna_pacos
ENSPTRG00000000352	SYF2	84	97.073	ENSVVUG00000027181	-	100	90.323	Vulpes_vulpes
ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.262	ENSVVUG00000027175	-	99	94.262	Vulpes_vulpes
ENSPTRG00000000352	SYF2	96	82.833	ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	Xenopus_tropicalis
ENSPTRG00000000352	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	Xiphophorus_maculatus