EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTRG00000000527 (Gene tree)
Gene ID: 469278
Gene Symbol: AGO4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Pan_troglodytes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49783 bases
Position: chr1:35125061-35174843
Accession: 38
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTRP00000093302	PAZ	PF02170.22	1.2e-27	1	1
ENSPTRP00000087507	PAZ	PF02170.22	1.2e-27	1	1
ENSPTRP00000088212	PAZ	PF02170.22	1.2e-27	1	1
ENSPTRP00000044180	PAZ	PF02170.22	1.2e-27	1	1
ENSPTRP00000087507	Piwi	PF02171.17	5.8e-108	1	1
ENSPTRP00000093302	Piwi	PF02171.17	5.8e-108	1	1
ENSPTRP00000044180	Piwi	PF02171.17	5.6e-105	1	1
ENSPTRP00000088212	Piwi	PF02171.17	6.8e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTRT00000100672	-	2544	-	ENSPTRP00000093302	847 (aa)	-	A0A2I3TWD6
ENSPTRT00000078422	-	2544	-	ENSPTRP00000087507	847 (aa)	-	A0A2I3TF67
ENSPTRT00000001032	-	7147	XM_016959062	ENSPTRP00000044180	861 (aa)	XP_016814551	K7CEM5
ENSPTRT00000088698	-	2583	-	ENSPTRP00000088212	860 (aa)	-	A0A2I3TG31

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	79.715	ENSPTRG00000020622	AGO2	98	79.715
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	83.393	ENSPTRG00000000529	AGO3	100	86.804
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	84.542	ENSPTRG00000000528	AGO1	98	84.542

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSG00000134698	AGO4	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTRG00000000527	AGO4	96	96.301	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.301	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.942	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	96.855	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	92.201	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.410	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.643	ENSACAG00000017275	AGO4	99	99.054	Anolis_carolinensis
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSANAG00000031428	AGO4	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.224	Astatotilapia_calliptera
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.453	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	98.834	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.834	Bos_taurus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPTRG00000000527	AGO4	92	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	99.884	Capra_hircus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.883	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSPTRG00000000527	AGO4	94	96.197	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	96.197	Cavia_aperea
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	97.895	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.895	Cavia_porcellus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.649	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.649	Chinchilla_lanigera
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTRG00000000527	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.953	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	98.953	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	ENSCANG00000016914	AGO4	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	90.841	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	97.683	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.683	Danio_rerio
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.768	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	99.768	Dasypus_novemcinctus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.884	Dipodomys_ordii
ENSPTRG00000000527	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSEASG00005012079	AGO4	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSECAG00000024686	AGO4	100	100.000	Equus_caballus
ENSPTRG00000000527	AGO4	79	97.173	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	97.173	Erinaceus_europaeus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	95.786	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.786	Esox_lucius
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	99.884	Felis_catus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.883	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSPTRG00000000527	AGO4	98	89.722	ENSFHEG00000019658	ago4	100	89.722	Fundulus_heteroclitus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	97.206	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.206	Gadus_morhua
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.535	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.535	Gallus_gallus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	Gambusia_affinis
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	97.558	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	92	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	96.592	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.224	Haplochromis_burtoni
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	99.884	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.110	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.110	Hippocampus_comes
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.339	Ictalurus_punctatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.884	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.339	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	95.682	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.682	Labrus_bergylta
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.490	ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	Latimeria_chalumnae
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.334	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.334	Lepisosteus_oculatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.224	Mastacembelus_armatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.224	Maylandia_zebra
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.181	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.181	Meleagris_gallopavo
ENSPTRG00000000527	AGO4	89	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.883	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.883	Microcebus_murinus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.535	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.535	Microtus_ochrogaster
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	97.834	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.834	Mola_mola
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.652	ENSMODG00000017888	AGO4	100	99.652	Monodelphis_domestica
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	96.671	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.878	Monopterus_albus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.071	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	Mus_caroli
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.839	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	Mus_musculus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.490	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	Mus_pahari
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.606	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.606	Mus_spretus
ENSPTRG00000000527	AGO4	92	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.525	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	99.525	Myotis_lucifugus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.883	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.883	Nannospalax_galili
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.224	Neolamprologus_brichardi
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	100.000	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSPTRG00000000527	AGO4	90	98.462	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.462	Notamacropus_eugenii
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	92.389	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.389	Ochotona_princeps
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	97.515	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.224	Oreochromis_niloticus
ENSPTRG00000000527	AGO4	92	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.768	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	99.768	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hni
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.339	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.339	Oryzias_melastigma
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	90.825	ENSOGAG00000027107	-	100	90.825	Otolemur_garnettii
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	99.620	ENSOGAG00000004233	-	100	99.620	Otolemur_garnettii
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.299	ENSOARG00000019568	AGO4	98	99.299	Ovis_aries
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	100.000	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.884	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	99.884	Panthera_pardus
ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.883	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.883	Panthera_tigris_altaica
ENSPTRG00000000527	AGO4	92	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.224	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.953	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.532	Pelodiscus_sinensis
ENSPTRG00000000527	AGO4	93	96.855	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	88.760	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.652	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	Phascolarctos_cinereus
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.339	ENSPFOG00000001935	ago4	100	96.339	Poecilia_formosa
ENSPTRG00000000527	AGO4	100	97.567	ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.567	Poecilia_latipinna
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