EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPTRG00000009287 (Gene tree)
Gene ID: 454738
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pan_troglodytes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 48845 bases
Position: chr17:12641482-12690326
Accession: 9432
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTRP00000015790	GTP_EFTU	PF00009.27	5.3e-45	1	1
ENSPTRP00000061181	GTP_EFTU	PF00009.27	1.4e-44	1	1
ENSPTRP00000089463	GTP_EFTU	PF00009.27	3.9e-33	1	1
ENSPTRP00000089463	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.9e-12	1	1
ENSPTRP00000061181	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.9e-12	1	1
ENSPTRP00000015790	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2e-12	1	1
ENSPTRP00000089463	EFG_IV	PF03764.18	3.9e-23	1	1
ENSPTRP00000061181	EFG_IV	PF03764.18	3.9e-23	1	1
ENSPTRP00000015790	EFG_IV	PF03764.18	4.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTRT00000017060	-	3641	XM_001145980	ENSPTRP00000015790	972 (aa)	XP_001145980	H2QD78
ENSPTRT00000073022	-	2844	-	ENSPTRP00000061181	947 (aa)	-	H2RI24
ENSPTRT00000095151	-	2805	-	ENSPTRP00000089463	934 (aa)	-	A0A2I3TKM6

Gene Model

Click here to download ENSPTRG00000009287's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptr03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPTRG00000009287's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	87	39.061	ENSPTRG00000010288	EEF2	99	46.061
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	54	30.986	ENSPTRG00000015570	GFM1	61	30.986
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	79	32.024	ENSPTRG00000007374	EFL1	83	32.024

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	100.000	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	Aotus_nancymaae
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.812	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.588	Bos_taurus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	Callithrix_jacchus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.897	Canis_familiaris
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.897	Canis_lupus_dingo
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	Capra_hircus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.486	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	Carlito_syrichta
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.897	Cebus_capucinus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	Cercocebus_atys
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.971	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	Chinchilla_lanigera
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.560	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.897	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.588	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.280	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.280	Dasypus_novemcinctus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.486	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.486	Dipodomys_ordii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	75.179	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.897	Equus_asinus_asinus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.794	Equus_caballus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.794	Felis_catus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.280	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.280	Fukomys_damarensis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.897	Gorilla_gorilla
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.461	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	96	99.573	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	Jaculus_jaculus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.177	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	Loxodonta_africana
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.897	Macaca_fascicularis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.897	Macaca_nemestrina
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.897	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.588	Mesocricetus_auratus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.897	Microcebus_murinus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	Microtus_ochrogaster
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.691	ENSMOCG00000009039	-	100	99.691	Microtus_ochrogaster
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.383	Mus_caroli
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.383	Mus_musculus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.383	Mus_pahari
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.383	Mus_spretus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	99.682	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.682	Mustela_putorius_furo
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.897	Myotis_lucifugus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	Nannospalax_galili
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	98.087	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	Nomascus_leucogenys
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	95.885	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	Notamacropus_eugenii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.897	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.634	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.634	Otolemur_garnettii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.588	Ovis_aries
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	100.000	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.897	Panthera_pardus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.897	Panthera_tigris_altaica
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.897	Papio_anubis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	93	97.244	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.244	Pelodiscus_sinensis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.588	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.588	Phascolarctos_cinereus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.457	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	Pongo_abelii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	95.576	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	Procavia_capensis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	Propithecus_coquereli
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.959	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	Pteropus_vampyrus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.383	Rattus_norvegicus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.794	Rhinopithecus_bieti
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	Rhinopithecus_roxellana
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	99.574	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	Sarcophilus_harrisii
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	94	99.217	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.255	Sorex_araneus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.691	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.691	Sus_scrofa
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.239	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	Tupaia_belangeri
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.768	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.768	Ursus_americanus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.897	Ursus_maritimus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.897	Vulpes_vulpes
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus