EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPTRG00000034409 (Gene tree)
Gene ID: 104001088
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pan_troglodytes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17257 bases
Position: chr5:61860219-61877475
Accession: 50804
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPTRP00000028885	eRF1_2	PF03464.15	3.9e-37	1	1
ENSPTRP00000088870	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-31	1	1
ENSPTRP00000028885	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-26	1	1
ENSPTRP00000088870	eRF1_1	PF03463.15	2.2e-53	1	1
ENSPTRP00000028885	eRF1_1	PF03463.15	4.3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPTRT00000031276	-	2351	XM_009449171	ENSPTRP00000028885	385 (aa)	XP_009447446	H2QQV5
ENSPTRT00000107067	-	777	-	ENSPTRP00000088870	258 (aa)	-	A0A2I3TJ15

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ptr03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.481	ENSG00000152684	PELO	100	99.481	Homo_sapiens
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000034409	PELO	93	80.913	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000034409	PELO	93	80.913	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPTRG00000034409	PELO	93	82.158	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.260	Amphiprion_ocellaris
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.260	Amphiprion_percula
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSPTRG00000034409	PELO	77	84.564	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.564	Anas_platyrhynchos
ENSPTRG00000034409	PELO	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.221	ENSANAG00000014096	PELO	100	99.221	Aotus_nancymaae
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPTRG00000034409	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	Astyanax_mexicanus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	Bos_taurus
ENSPTRG00000034409	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.481	ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.481	Callithrix_jacchus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	Canis_lupus_dingo
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	Capra_hircus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	Cavia_porcellus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.481	ENSCCAG00000035600	PELO	100	99.481	Cebus_capucinus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSCATG00000011829	PELO	100	99.740	Cercocebus_atys
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.922	ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	Chinchilla_lanigera
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	Chlorocebus_sabaeus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSPTRG00000034409	PELO	97	68.901	ENSCING00000001979	-	100	69.351	Ciona_intestinalis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	69.610	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.610	Ciona_savignyi
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSCANG00000023382	PELO	100	99.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	95.584	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.883	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.740	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.740	Cynoglossus_semilaevis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	Cyprinodon_variegatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	Danio_rerio
ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.114	ENSDNOG00000036721	PELO	100	96.114	Dasypus_novemcinctus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.662	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.662	Dipodomys_ordii
ENSPTRG00000034409	PELO	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSPTRG00000034409	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.442	Equus_asinus_asinus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	Esox_lucius
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.182	Felis_catus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	94.286	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.286	Ficedula_albicollis
ENSPTRG00000034409	PELO	94	97.934	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.535	Fukomys_damarensis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.481	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	Fundulus_heteroclitus
ENSPTRG00000034409	PELO	98	79.576	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.221	Gadus_morhua
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.519	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	Gambusia_affinis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSGGOG00000012635	PELO	100	99.740	Gorilla_gorilla
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.922	ENSHGLG00000005932	PELO	100	97.922	Heterocephalus_glaber_female
ENSPTRG00000034409	PELO	100	95.584	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.584	Heterocephalus_glaber_male
ENSPTRG00000034409	PELO	100	77.403	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.403	Hippocampus_comes
ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.481	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	Ictalurus_punctatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	94.286	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.286	Jaculus_jaculus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.779	ENSKMAG00000021305	pelo	100	80.779	Kryptolebias_marmoratus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.519	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.519	Labrus_bergylta
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSMFAG00000000651	PELO	100	99.740	Macaca_fascicularis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSMMUG00000039101	PELO	100	99.740	Macaca_mulatta
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSMNEG00000035538	PELO	100	99.740	Macaca_nemestrina
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSMLEG00000039113	PELO	100	99.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSPTRG00000034409	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.000	Maylandia_zebra
ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.883	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.883	Mesocricetus_auratus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSPTRG00000034409	PELO	100	78.961	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.961	Mola_mola
ENSPTRG00000034409	PELO	100	82.078	ENSMALG00000008194	pelo	100	82.078	Monopterus_albus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.143	Mus_caroli
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.143	Mus_musculus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.403	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.403	Mus_pahari
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.143	Mus_spretus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	95.325	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.325	Myotis_lucifugus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSNLEG00000035970	PELO	100	99.740	Nomascus_leucogenys
ENSPTRG00000034409	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSPTRG00000034409	PELO	98	97.361	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.361	Ochotona_princeps
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.143	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.143	Octodon_degus
ENSPTRG00000034409	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.558	Oryzias_melastigma
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.182	Otolemur_garnettii
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.961	Ovis_aries
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSPPAG00000038951	PELO	100	99.740	Pan_paniscus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.182	Panthera_pardus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.182	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.182	Panthera_tigris_altaica
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSPANG00000010902	PELO	100	99.740	Papio_anubis
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	ENSPKIG00000015190	pelo	100	81.818	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.351	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	Pelodiscus_sinensis
ENSPTRG00000034409	PELO	99	75.000	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.883	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	96.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.299	Poecilia_formosa
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.558	Poecilia_latipinna
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.299	Poecilia_mexicana
ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.558	Poecilia_reticulata
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.481	ENSPPYG00000015451	PELO	96	99.481	Pongo_abelii
ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSPTRG00000034409	PELO	97	81.501	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	Pygocentrus_nattereri
ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.403	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.403	Rattus_norvegicus
ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	ENSRBIG00000007299	PELO	100	99.740	Rhinopithecus_bieti
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