EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000002535 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29462 bases
Position: chrGeneScaffold_4013:253894-283355
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000002399	CRM1_C	PF08767.11	2.6e-127	1	1
ENSPVAP00000002399	Xpo1	PF08389.12	1e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000002536	XPO1-201	3198	-	ENSPVAP00000002399	1065 (aa)	-	UPI00018B3864

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSG00000082898	XPO1	100	87.582	Homo_sapiens
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.247	ENSAPOG00000004984	-	96	89.278	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	88.787	ENSAPOG00000002354	xpo1a	93	88.787	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.340	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	88.340	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	95.309	ENSACIG00000010818	-	93	95.309	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	91.304	ENSACIG00000010259	xpo1a	93	91.304	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.513	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	81.513	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.247	ENSAOCG00000010121	-	93	94.670	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000002535	XPO1	91	85.464	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	85.464	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.247	ENSAPEG00000007038	-	92	94.670	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.247	ENSATEG00000008816	-	96	89.278	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.232	ENSATEG00000020750	xpo1a	94	91.304	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.329	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	88.329	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.142	ENSACAG00000002501	XPO1	100	88.142	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSANAG00000020802	XPO1	100	87.582	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	91.648	ENSACLG00000015669	xpo1a	93	91.648	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.061	ENSACLG00000015192	-	96	89.175	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	93.127	ENSAMXG00000003069	xpo1a	92	93.127	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.808	ENSAMXG00000012704	xpo1b	92	96.037	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	88.609	Bos_taurus
ENSPVAG00000002535	XPO1	81	52.709	WBGene00002078	xpo-1	91	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	87.582	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	88.609	Canis_familiaris
ENSPVAG00000002535	XPO1	91	92.577	ENSCAFG00020026910	XPO1	97	92.577	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	88.609	Capra_hircus
ENSPVAG00000002535	XPO1	93	98.741	ENSTSYG00000004330	XPO1	93	98.741	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000002535	XPO1	53	93.617	ENSCAPG00000006454	-	100	93.617	Cavia_aperea
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.115	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	87.115	Cavia_porcellus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	68.553	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	68.738	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.754	ENSCATG00000032674	XPO1	93	97.483	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.329	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	88.329	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	87.582	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	97.414	ENSCHOG00000012088	XPO1	82	97.414	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.235	ENSCPBG00000026239	XPO1	97	92.268	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	71.788	ENSCING00000024562	-	100	71.788	Ciona_intestinalis
ENSPVAG00000002535	XPO1	99	71.121	ENSCSAVG00000005965	-	99	71.121	Ciona_savignyi
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	83.380	ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.809	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.488	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	87.488	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.488	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	87.488	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	94.508	ENSCSEG00000001693	XPO1	93	94.508	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.154	ENSCVAG00000016788	-	100	85.154	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	80.859	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	80.859	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	82.726	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	82.726	Danio_rerio
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	86.088	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	86.088	Danio_rerio
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.515	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	88.515	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000002535	XPO1	91	83.802	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	83.802	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000002535	XPO1	99	62.418	FBgn0020497	emb	99	62.418	Drosophila_melanogaster
ENSPVAG00000002535	XPO1	88	97.971	ENSETEG00000018045	XPO1	88	97.971	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000002535	XPO1	72	87.371	ENSEBUG00000012580	-	100	87.371	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSEASG00005007223	XPO1	100	88.609	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000002535	XPO1	95	98.179	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.179	Equus_caballus
ENSPVAG00000002535	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	91.886	ENSELUG00000014306	-	92	91.886	Esox_lucius
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	94.050	ENSELUG00000012707	xpo1a	93	94.050	Esox_lucius
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	88.609	Felis_catus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.049	ENSFALG00000010989	XPO1	100	88.049	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000002535	XPO1	93	98.284	ENSFDAG00000014716	XPO1	94	98.284	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.139	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	81.139	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	90.476	ENSGMOG00000019063	-	100	90.476	Gadus_morhua
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	82.446	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	82.446	Gadus_morhua
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.329	ENSGALG00000029476	XPO1	100	88.329	Gallus_gallus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	91.304	ENSGAFG00000004408	xpo1a	93	91.304	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000002535	XPO1	91	89.175	ENSGAFG00000003355	-	98	89.175	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.061	ENSGACG00000002743	-	100	85.061	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.046	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	81.046	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.142	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	88.142	Gopherus_agassizii
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	87.582	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.699	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	81.699	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.154	ENSHBUG00000020037	-	96	89.278	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.235	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	88.235	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.235	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	88.235	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	94.050	ENSHCOG00000006949	XPO1	93	94.050	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	83.754	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	83.754	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.714	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	85.714	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.422	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	88.422	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.329	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	88.329	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.046	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	81.046	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000002535	XPO1	93	94.966	ENSKMAG00000016218	-	93	94.966	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	90.774	ENSLBEG00000002104	xpo1a	95	90.774	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000002535	XPO1	93	95.309	ENSLBEG00000005740	-	94	95.309	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	66.667	ENSLACG00000018213	XPO1	100	66.667	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	86.181	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	86.181	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.329	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	88.329	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	87.582	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000002535	XPO1	93	97.436	ENSMMUG00000006941	XPO1	94	97.436	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.582	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	87.582	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.767	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	85.767	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.419	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	81.419	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.247	ENSMAMG00000010568	-	92	95.423	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.699	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	81.699	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	85.061	ENSMZEG00005018158	-	98	89.175	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000002535	XPO1	68	98.072	ENSMGAG00000001496	-	100	98.072	Meleagris_gallopavo
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.488	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	87.488	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.609	ENSMICG00000027770	XPO1	100	88.609	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000002535	XPO1	94	97.597	ENSMOCG00000012169	Xpo1	94	97.597	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	91.304	ENSMMOG00000018767	xpo1a	93	91.304	Mola_mola
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	95.080	ENSMMOG00000008001	-	93	95.080	Mola_mola
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.302	ENSMODG00000002831	XPO1	100	87.302	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000002535	XPO1	82	90.286	ENSMALG00000008617	xpo1a	93	90.286	Monopterus_albus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	84.967	ENSMALG00000007085	-	100	84.967	Monopterus_albus
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.675	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	87.675	Mus_caroli
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ENSPVAG00000002535	XPO1	100	88.422	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	88.422	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000002535	XPO1	96	84.124	ENSNBRG00000012229	-	93	95.423	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000002535	XPO1	100	81.699	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	81.699	Neolamprologus_brichardi
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