EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000005841 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5139 bases
Position: chrGeneScaffold_2445:656098-661236
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000005525	SYF2	PF08231.12	6.4e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000005841	SYF2-201	738	-	ENSPVAP00000005525	245 (aa)	-	UPI00018B4B46

Gene Model

Click here to download ENSPVAG00000005841's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPVAG00000005841's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	ENSG00000117614	SYF2	99	81.893	Homo_sapiens
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	73.874	ENSAPOG00000001174	syf2	93	73.874	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000005841	SYF2	98	80.833	ENSAMEG00000010115	-	99	80.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000005841	SYF2	80	83.077	ENSAMEG00000010134	-	100	83.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	66.667	ENSACIG00000023688	syf2	99	66.667	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000005841	SYF2	98	69.388	ENSAOCG00000022046	syf2	94	74.324	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	67.257	ENSAOCG00000010912	syf2	69	67.257	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000005841	SYF2	98	69.388	ENSAPEG00000018858	syf2	95	69.388	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.733	ENSATEG00000007745	syf2	99	70.339	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000005841	SYF2	82	77.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	77.500	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000005841	SYF2	83	74.510	ENSACAG00000013653	-	100	74.510	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000005841	SYF2	68	62.874	ENSACAG00000026777	-	94	62.420	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.481	ENSANAG00000032473	SYF2	99	81.481	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	ENSACLG00000019916	syf2	98	71.245	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	ENSAMXG00000004051	syf2	93	72.523	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.857	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	83.051	Bos_taurus
ENSPVAG00000005841	SYF2	85	45.238	WBGene00019402	syf-2	99	42.060	Caenorhabditis_elegans
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	81.893	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	75.893	ENSCAFG00000030331	-	96	75.893	Canis_familiaris
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.301	ENSCAFG00000012895	-	100	81.301	Canis_familiaris
ENSPVAG00000005841	SYF2	74	73.077	ENSCAFG00020021094	-	83	78.846	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.301	ENSCAFG00020021091	-	100	81.301	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	82.041	Capra_hircus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	81.224	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.838	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	Cavia_aperea
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	81.224	Cavia_porcellus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	81.893	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSCATG00000026917	SYF2	99	81.070	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	81.224	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.658	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	80.658	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000005841	SYF2	62	72.368	ENSCHOG00000005273	-	82	72.368	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	79.018	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	77.155	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000005841	SYF2	86	47.418	ENSCING00000003017	-	89	47.418	Ciona_intestinalis
ENSPVAG00000005841	SYF2	86	46.009	ENSCSAVG00000006627	-	97	46.009	Ciona_savignyi
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.424	ENSCANG00000037322	SYF2	99	79.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.592	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000005841	SYF2	80	82.653	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.412	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	68.664	ENSCSEG00000000117	syf2	100	64.082	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000005841	SYF2	90	71.946	ENSCVAG00000019543	syf2	99	69.198	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	98	69.456	ENSDARG00000004706	syf2	99	69.456	Danio_rerio
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.449	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	82.449	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.408	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	51.304	FBgn0033556	CG12343	99	51.304	Drosophila_melanogaster
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	87.963	ENSETEG00000015729	SYF2	100	85.281	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000005841	SYF2	80	50.251	ENSEBUG00000015402	syf2	95	50.251	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	ENSEASG00005004232	-	100	80.408	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.449	ENSEASG00005004224	-	100	82.449	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.992	ENSECAG00000010440	-	98	83.333	Equus_caballus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.449	ENSECAG00000012023	-	100	82.449	Equus_caballus
ENSPVAG00000005841	SYF2	66	79.503	ENSEEUG00000015084	SYF2	87	79.503	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000005841	SYF2	90	74.661	ENSELUG00000003465	syf2	93	74.661	Esox_lucius
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.488	ENSFCAG00000010324	-	85	80.488	Felis_catus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	ENSFCAG00000043095	-	100	82.114	Felis_catus
ENSPVAG00000005841	SYF2	83	75.000	ENSFALG00000000460	SYF2	92	73.043	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	79.592	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	57.589	ENSFHEG00000007238	syf2	99	57.589	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	73.953	ENSGMOG00000019138	syf2	96	73.953	Gadus_morhua
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	77.679	ENSGALG00000013639	SYF2	92	75.862	Gallus_gallus
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	68.831	ENSGAFG00000019435	syf2	97	68.831	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	72.477	ENSGACG00000007305	syf2	91	72.477	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	79.464	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	77.586	Gopherus_agassizii
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	82.305	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000005841	SYF2	95	71.121	ENSHBUG00000020477	syf2	98	71.121	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.408	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	70.796	ENSHGLG00000004304	-	96	68.696	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.408	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.408	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	67.339	ENSHCOG00000012904	syf2	81	67.339	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	69.959	ENSIPUG00000019859	syf2	100	69.959	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	71.304	ENSKMAG00000013856	syf2	97	71.304	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.516	ENSLBEG00000014425	syf2	94	72.646	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	76.389	ENSLACG00000012064	SYF2	91	76.389	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	70.763	ENSLOCG00000002728	syf2	92	70.763	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	ENSLAFG00000023150	-	100	81.224	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000005841	SYF2	75	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	81.070	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.579	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	81.070	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	81.070	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	81.070	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.272	ENSMAMG00000010403	syf2	92	72.072	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	71.245	ENSMZEG00005006429	syf2	98	71.245	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000005841	SYF2	81	77.889	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	77.889	Meleagris_gallopavo
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	77.778	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	77.778	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000005841	SYF2	81	83.920	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.000	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.000	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	70.270	ENSMMOG00000002396	syf2	93	70.270	Mola_mola
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	76.419	ENSMODG00000013951	-	100	76.419	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.646	ENSMALG00000010706	syf2	93	72.646	Monopterus_albus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.012	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	79.012	Mus_caroli
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.012	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	79.012	Mus_musculus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.012	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	79.012	Mus_pahari
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.012	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	79.012	Mus_spretus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.520	ENSMPUG00000015802	-	100	82.520	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.081	ENSMPUG00000015801	-	100	80.081	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000005841	SYF2	97	82.700	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	82.700	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.567	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	80.567	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	62.140	ENSNBRG00000010720	syf2	100	62.140	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	82.305	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	78.776	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	78.776	Ochotona_princeps
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	82.533	ENSODEG00000017664	-	96	82.533	Octodon_degus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	73.061	ENSODEG00000014338	-	100	73.061	Octodon_degus
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	71.622	ENSONIG00000008213	syf2	98	70.386	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000005841	SYF2	82	78.713	ENSOANG00000009552	SYF2	100	78.713	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.816	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	82.041	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	ENSORLG00000028820	syf2	95	72.523	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.748	ENSORLG00020018333	syf2	99	70.339	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.748	ENSORLG00015014665	syf2	99	70.339	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.973	ENSOMEG00000013911	syf2	93	72.973	Oryzias_melastigma
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	82.041	Otolemur_garnettii
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.377	ENSOARG00000006348	-	100	81.377	Ovis_aries
ENSPVAG00000005841	SYF2	80	56.410	ENSOARG00000006269	-	100	56.410	Ovis_aries
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	82.305	Pan_paniscus
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	83.122	ENSPPRG00000001638	-	96	83.122	Panthera_pardus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	ENSPPRG00000001651	-	100	82.114	Panthera_pardus
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	86.111	ENSPTIG00000005711	-	82	83.628	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	ENSPTIG00000007036	-	100	82.114	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	82.305	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	82.305	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSPANG00000008139	SYF2	99	81.070	Papio_anubis
ENSPVAG00000005841	SYF2	95	71.674	ENSPKIG00000008130	syf2	99	71.674	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000005841	SYF2	95	76.293	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	76.293	Pelodiscus_sinensis
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	68.220	ENSPMGG00000008755	syf2	92	68.220	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.592	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	80.889	ENSPCIG00000014235	SYF2	93	80.258	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	66.939	ENSPFOG00000004116	syf2	99	66.939	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000005841	SYF2	96	69.231	ENSPLAG00000006691	syf2	99	69.231	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	65.714	ENSPMEG00000011684	syf2	99	68.534	Poecilia_mexicana
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	72.222	ENSPREG00000003009	syf2	94	71.300	Poecilia_reticulata
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	81.893	Pongo_abelii
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	62.857	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.449	Propithecus_coquereli
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.523	ENSPNYG00000004979	syf2	98	71.245	Pundamilia_nyererei
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	74.775	ENSPNAG00000015570	syf2	93	74.775	Pygocentrus_nattereri
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	79.012	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	79.012	Rattus_norvegicus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	78.601	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	78.601	Rhinopithecus_bieti
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.070	ENSRROG00000001347	SYF2	99	81.070	Rhinopithecus_roxellana
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.658	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	80.658	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPVAG00000005841	SYF2	84	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	79.736	ENSSHAG00000015630	-	97	77.178	Sarcophilus_harrisii
ENSPVAG00000005841	SYF2	92	73.333	ENSSFOG00015023647	syf2	95	73.333	Scleropages_formosus
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	71.171	ENSSMAG00000009867	syf2	93	71.171	Scophthalmus_maximus
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.272	ENSSDUG00000013072	syf2	99	67.901	Seriola_dumerili
ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.272	ENSSLDG00000012677	syf2	91	73.272	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	63.265	ENSSARG00000012889	SYF2	100	63.265	Sorex_araneus
ENSPVAG00000005841	SYF2	95	75.107	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	75.107	Sphenodon_punctatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	99	67.901	ENSSPAG00000009626	syf2	100	67.901	Stegastes_partitus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	81.224	Sus_scrofa
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	70.721	ENSTRUG00000001499	syf2	89	70.721	Takifugu_rubripes
ENSPVAG00000005841	SYF2	91	69.507	ENSTNIG00000016912	syf2	100	69.507	Tetraodon_nigroviridis
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	66.122	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	65.714	Tupaia_belangeri
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	82.041	Tursiops_truncatus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.114	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	82.114	Ursus_americanus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.707	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	81.707	Ursus_maritimus
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.816	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	80.816	Vicugna_pacos
ENSPVAG00000005841	SYF2	84	83.415	ENSVVUG00000027181	-	96	79.498	Vulpes_vulpes
ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.301	ENSVVUG00000027175	-	100	81.301	Vulpes_vulpes
ENSPVAG00000005841	SYF2	93	74.123	ENSXETG00000022797	syf2	92	74.123	Xenopus_tropicalis
ENSPVAG00000005841	SYF2	88	72.093	ENSXMAG00000022698	syf2	93	71.171	Xiphophorus_maculatus