EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000010056 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRP54
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 54
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17002 bases
Position: chrGeneScaffold_614:49409-66410
Accession: 11301
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000009480	SRP54	PF00448.22	9.5e-47	1	1
ENSPVAP00000009480	SRP54_N	PF02881.19	7.8e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000010056	SRP54-201	1155	-	ENSPVAP00000009480	385 (aa)	-	UPI00018B19AB

Gene Model

Click here to download ENSPVAG00000010056's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPVAG00000010056's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSG00000100883	SRP54	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSAPOG00000011314	srp54	63	97.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSAMEG00000015544	SRP54	63	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSACIG00000022831	srp54	69	97.872	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSAOCG00000019401	srp54	63	97.872	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSAPEG00000001977	srp54	63	97.872	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSATEG00000013877	srp54	63	97.872	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSAPLG00000010125	SRP54	63	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSACAG00000002103	-	63	100.000	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	54	82.212	ENSACAG00000001124	-	61	82.212	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	58	99.552	ENSACAG00000010631	-	52	99.552	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSANAG00000022133	SRP54	87	91.304	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSACLG00000015866	srp54	63	97.872	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSAMXG00000032669	SRP54	63	96.809	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSBTAG00000019085	SRP54	63	100.000	Bos_taurus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	76.682	WBGene00009012	F21D5.7	64	76.682	Caenorhabditis_elegans
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCJAG00000006581	SRP54	87	91.304	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCAFG00000013331	SRP54	63	100.000	Canis_familiaris
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCAFG00020023427	SRP54	63	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCHIG00000026345	SRP54	63	100.000	Capra_hircus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	89.362	ENSTSYG00000035333	-	60	89.362	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSTSYG00000002680	-	63	100.000	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000010056	SRP54	75	100.000	ENSCAPG00000008780	SRP54	67	100.000	Cavia_aperea
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCPOG00000003691	SRP54	63	100.000	Cavia_porcellus
ENSPVAG00000010056	SRP54	66	100.000	ENSCCAG00000024179	SRP54	58	100.000	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCATG00000034083	SRP54	87	91.304	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCLAG00000015076	SRP54	63	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCSAG00000015575	SRP54	63	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000010056	SRP54	72	100.000	ENSCHOG00000008986	SRP54	57	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCPBG00000026195	SRP54	63	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	84.753	ENSCING00000007380	-	63	84.753	Ciona_intestinalis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCANG00000028532	SRP54	87	91.304	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCGRG00001009525	-	63	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSCGRG00000009453	-	73	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSCSEG00000012392	srp54	63	97.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSCVAG00000010395	srp54	63	97.872	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSDARG00000098367	srp54	63	96.809	Danio_rerio
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSDNOG00000032525	SRP54	63	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000010056	SRP54	72	98.837	ENSDORG00000005159	-	64	98.837	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000010056	SRP54	79	81.132	FBgn0010747	Srp54k	62	80.631	Drosophila_melanogaster
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	99.103	ENSETEG00000016307	-	63	99.103	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000010056	SRP54	58	60.360	ENSETEG00000012102	-	57	60.360	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	91.480	ENSEBUG00000009437	-	63	91.480	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSEASG00005002057	SRP54	63	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSECAG00000018042	SRP54	63	100.000	Equus_caballus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	76.682	ENSEEUG00000001511	SRP54	63	76.682	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSELUG00000003395	srp54	63	96.809	Esox_lucius
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSFCAG00000032033	SRP54	63	100.000	Felis_catus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSFALG00000005995	SRP54	63	100.000	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSFDAG00000016767	SRP54	64	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSFHEG00000004263	srp54	68	96.809	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000010056	SRP54	76	95.588	ENSGMOG00000011391	srp54	61	95.588	Gadus_morhua
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSGALG00000023135	SRP54	63	100.000	Gallus_gallus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSGAFG00000011586	srp54	63	97.872	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSGACG00000004181	srp54	74	96.809	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSGAGG00000014766	SRP54	63	100.000	Gopherus_agassizii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSGGOG00000002926	SRP54	87	91.304	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSHBUG00000005678	srp54	63	97.872	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSHGLG00000002850	SRP54	63	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSHGLG00100005263	SRP54	63	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	70.526	ENSHGLG00100007281	-	61	70.526	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	94.681	ENSHCOG00000021127	srp54	63	94.681	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.413	ENSIPUG00000001420	srp54	63	96.413	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSSTOG00000016023	SRP54	63	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSJJAG00000013417	-	61	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	65	88.889	ENSJJAG00000016404	-	64	88.889	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSKMAG00000007707	srp54	63	96.809	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSLBEG00000018690	srp54	63	97.872	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSLBEG00000021122	srp54	63	97.872	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	98.936	ENSLACG00000017890	SRP54	63	98.936	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSLOCG00000009440	srp54	63	97.872	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSLAFG00000012007	SRP54	63	100.000	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMFAG00000044371	SRP54	87	91.304	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMMUG00000015073	FAM177A1	87	91.304	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMNEG00000006947	SRP54	87	91.304	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMLEG00000042251	SRP54	87	91.304	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSMAMG00000004803	srp54	63	97.872	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSMZEG00005027528	srp54	63	97.872	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMGAG00000012481	SRP54	63	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMAUG00000014447	-	63	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMICG00000010270	SRP54	63	100.000	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000010056	SRP54	66	100.000	ENSMOCG00000000948	-	58	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSMMOG00000020303	srp54	69	97.872	Mola_mola
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMODG00000023150	-	63	100.000	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMODG00000012925	-	63	100.000	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSMALG00000009163	srp54	70	96.809	Monopterus_albus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0017754	-	63	100.000	Mus_caroli
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMUSG00000112449	Srp54b	92	95.238	Mus_musculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMUSG00000079108	Srp54c	63	100.000	Mus_musculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMUSG00000073079	Srp54a	92	95.238	Mus_musculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	MGP_PahariEiJ_G0029510	-	63	100.000	Mus_pahari
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMPUG00000016302	SRP54	63	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSMLUG00000008958	SRP54	63	100.000	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000010056	SRP54	69	100.000	ENSNGAG00000019806	-	59	100.000	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000010056	SRP54	66	96.667	ENSNBRG00000006000	srp54	58	96.667	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSNLEG00000003496	SRP54	87	91.304	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000010056	SRP54	72	100.000	ENSMEUG00000000138	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSODEG00000004865	SRP54	63	100.000	Octodon_degus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSONIG00000011768	srp54	63	97.872	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSOANG00000014051	SRP54	63	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSOCUG00000007838	SRP54	63	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSORLG00000010027	srp54	63	96.809	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSORLG00020001878	srp54	63	96.809	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSORLG00015021866	srp54	63	96.809	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSOMEG00000020952	srp54	63	96.809	Oryzias_melastigma
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSOGAG00000012188	SRP54	63	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSOARG00000007160	SRP54	63	100.000	Ovis_aries
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPPAG00000017434	SRP54	87	91.304	Pan_paniscus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPPRG00000014047	SRP54	77	100.000	Panthera_pardus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPTIG00000000744	SRP54	60	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPTRG00000006259	FAM177A1	87	91.304	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPANG00000023853	SRP54	87	91.304	Papio_anubis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.413	ENSPKIG00000001953	srp54	63	96.413	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPSIG00000006476	SRP54	63	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPMGG00000004127	srp54	69	97.872	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	76	100.000	ENSPEMG00000019634	-	62	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	92.825	ENSPMAG00000006078	-	63	92.825	Petromyzon_marinus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPCIG00000016175	SRP54	63	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPFOG00000008870	srp54	63	97.872	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPLAG00000009889	srp54	63	97.872	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPMEG00000008601	srp54	63	97.872	Poecilia_mexicana
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPREG00000004505	srp54	63	97.872	Poecilia_reticulata
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPPYG00000005739	SRP54	63	100.000	Pongo_abelii
ENSPVAG00000010056	SRP54	77	100.000	ENSPCAG00000006268	SRP54	59	100.000	Procavia_capensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSPCOG00000022473	SRP54	64	100.000	Propithecus_coquereli
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSPNYG00000009717	srp54	63	97.872	Pundamilia_nyererei
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSPNAG00000008544	srp54	63	96.809	Pygocentrus_nattereri
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSRNOG00000032776	Srp54a	63	100.000	Rattus_norvegicus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSRROG00000041292	SRP54	87	91.304	Rhinopithecus_roxellana
ENSPVAG00000010056	SRP54	81	53.571	YPR088C	SRP54	58	53.571	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPVAG00000010056	SRP54	77	100.000	ENSSBOG00000035145	SRP54	61	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPVAG00000010056	SRP54	58	100.000	ENSSHAG00000000671	SRP54	65	100.000	Sarcophilus_harrisii
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.413	ENSSFOG00015013920	srp54	63	96.413	Scleropages_formosus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	95.745	ENSSMAG00000002441	srp54	59	95.745	Scophthalmus_maximus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSSDUG00000018586	srp54	63	97.872	Seriola_dumerili
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSSLDG00000010476	srp54	63	97.872	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSSARG00000002744	SRP54	63	100.000	Sorex_araneus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSSPUG00000013101	SRP54	63	100.000	Sphenodon_punctatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSSPAG00000002354	srp54	63	97.872	Stegastes_partitus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSSSCG00000001955	SRP54	63	100.000	Sus_scrofa
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSTGUG00000011945	-	63	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSTRUG00000007057	srp54	63	96.809	Takifugu_rubripes
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	96.809	ENSTNIG00000002589	srp54	63	96.809	Tetraodon_nigroviridis
ENSPVAG00000010056	SRP54	59	98.942	ENSTBEG00000011409	SRP54	51	98.942	Tupaia_belangeri
ENSPVAG00000010056	SRP54	69	100.000	ENSTTRG00000000928	SRP54	53	100.000	Tursiops_truncatus
ENSPVAG00000010056	SRP54	50	100.000	ENSUAMG00000012385	SRP54	74	100.000	Ursus_americanus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSUMAG00000011234	SRP54	63	100.000	Ursus_maritimus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSVPAG00000005668	SRP54	67	100.000	Vicugna_pacos
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	100.000	ENSVVUG00000019962	SRP54	63	100.000	Vulpes_vulpes
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	98.936	ENSXETG00000012290	srp54	63	98.936	Xenopus_tropicalis
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSXCOG00000004658	srp54	69	97.872	Xiphophorus_couchianus
ENSPVAG00000010056	SRP54	82	97.872	ENSXMAG00000018315	srp54	63	97.872	Xiphophorus_maculatus