EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000010281 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14647 bases
Position: chrscaffold_4845:39435-54081
Accession: 5276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000009695	RRM_1	PF00076.22	8.6e-17	1	2
ENSPVAP00000009695	RRM_1	PF00076.22	8.6e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000010282	HTATSF1-201	2082	-	ENSPVAP00000009695	693 (aa)	-	UPI00018B209D

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.899	ENSG00000102241	HTATSF1	98	90.000	Homo_sapiens
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	59	60.613	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	60.613	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.151	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	72.063	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	59.905	ENSACIG00000020459	htatsf1	95	58.352	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.183	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	59.028	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.183	ENSAPEG00000016432	htatsf1	89	60.337	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	60.769	ENSATEG00000008903	htatsf1	86	61.125	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	95	62.343	ENSANAG00000027986	-	96	62.693	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	93	72.767	ENSANAG00000025458	-	99	72.029	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.441	ENSACLG00000008096	htatsf1	95	58.447	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.563	ENSAMXG00000008387	htatsf1	83	63.683	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.541	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	74.541	Bos_taurus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.541	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	74.541	Bos_taurus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	70.027	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	98	70.436	Bos_taurus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.628	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	73.486	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.733	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	74.599	Canis_familiaris
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.664	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	71.278	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	75.798	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	98	75.766	Capra_hircus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	75.099	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	98	75.236	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.733	ENSCCAG00000022701	-	99	73.861	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	71.218	ENSCCAG00000025329	-	99	70.875	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	75.236	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	75.436	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	65.662	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	70.173	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	75.236	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	75.436	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	69.737	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	86	70.112	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	74.832	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	75.436	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	87	69.391	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	67.484	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	78	62.057	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	61.399	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.564	ENSCVAG00000014070	htatsf1	90	60.386	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	59.069	ENSDARG00000056649	htatsf1	96	55.333	Danio_rerio
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	73.003	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	72.583	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	70	51.020	ENSETEG00000006377	-	66	50.408	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	49.061	ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.531	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	78.025	ENSEASG00005003440	HTATSF1	98	69.777	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	77.866	ENSECAG00000009156	HTATSF1	98	69.645	Equus_caballus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	86	66.343	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	61.711	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	59	56.322	ENSELUG00000005486	htatsf1	85	58.391	Esox_lucius
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.482	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	73.092	Felis_catus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	89	68.631	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	67.733	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	52	64.230	ENSFHEG00000020286	htatsf1	85	64.230	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	51	61.370	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	61.370	Gadus_morhua
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	67.895	ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.619	Gallus_gallus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.916	ENSGAFG00000003041	htatsf1	85	62.660	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.059	ENSGACG00000020459	htatsf1	94	59.059	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.899	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	75.034	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.207	ENSHBUG00000004392	htatsf1	95	58.219	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	68.267	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	98	67.557	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	53	61.780	ENSHCOG00000009056	htatsf1	88	61.399	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.757	ENSIPUG00000017828	htatsf1	80	64.908	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	72.951	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	74.827	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.427	ENSKMAG00000007622	htatsf1	85	63.427	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	55	62.183	ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	60.784	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	64.380	ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	64.042	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	59	42.417	ENSLOCG00000015118	htatsf1	89	42.043	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	71.449	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.666	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	75.101	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	75.302	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	75.101	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	75.302	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	79.107	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	79.167	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	75.101	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	75.302	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.245	ENSMAMG00000021225	htatsf1	87	62.595	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.441	ENSMZEG00005000485	htatsf1	95	58.447	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	66.402	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	66.799	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.733	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	73.762	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	63.171	ENSMOCG00000023007	-	99	63.399	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	65.437	ENSMOCG00000022370	-	94	65.276	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.038	ENSMMOG00000011013	htatsf1	86	63.038	Mola_mola
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	55	71.018	ENSMODG00000014087	-	84	71.018	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	60	56.979	ENSMALG00000019977	htatsf1	96	56.979	Monopterus_albus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	61.942	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	98	68.725	Mus_caroli
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	69.712	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	68.667	Mus_musculus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	61.579	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	68.533	Mus_spretus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	72.704	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	71.149	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.148	ENSMLUG00000028418	-	99	74.000	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.997	ENSMLUG00000009234	-	98	72.162	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	68.999	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	68.114	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.441	ENSNBRG00000003818	htatsf1	95	58.770	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.731	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	98	74.731	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	57	68.608	ENSMEUG00000004133	-	94	68.608	Notamacropus_eugenii
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	58.974	ENSONIG00000008638	htatsf1	95	58.314	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	50	73.639	ENSOANG00000011674	-	85	73.639	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	75	81.574	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	69.565	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.916	ENSORLG00000002356	htatsf1	84	62.564	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.171	ENSORLG00020017818	htatsf1	81	62.821	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	63.077	ENSORLG00015002268	htatsf1	85	63.077	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	59	59.070	ENSOMEG00000007564	htatsf1	93	59.070	Oryzias_melastigma
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	71.237	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	72.377	Otolemur_garnettii
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	70.235	ENSOARG00000000481	-	98	70.751	Ovis_aries
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	74.705	ENSOARG00000011215	-	98	74.672	Ovis_aries
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	75.034	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	75.168	Pan_paniscus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	73.541	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	73.226	Panthera_pardus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	92	73.023	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.518	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	75.034	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	75.168	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	62.784	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	63.017	Papio_anubis
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	68.000	ENSPKIG00000024852	htatsf1	83	68.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.060	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	62.060	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	69.826	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	69.920	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	61	62.884	ENSPCIG00000018896	-	95	62.884	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	53	69.786	ENSPCIG00000030173	-	91	67.172	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.595	ENSPFOG00000007871	htatsf1	84	62.755	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	56	60.988	ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	61.139	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.595	ENSPMEG00000000352	htatsf1	89	61.235	Poecilia_mexicana
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	62.595	ENSPREG00000007811	htatsf1	87	62.595	Poecilia_reticulata
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	74.920	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	76	78.157	Pongo_abelii
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	97	64.366	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	98	63.158	Procavia_capensis
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	76.267	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	76.273	Propithecus_coquereli
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	58	59.674	ENSPNYG00000016693	htatsf1	95	58.676	Pundamilia_nyererei
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	65.508	ENSPNAG00000006166	htatsf1	93	59.574	Pygocentrus_nattereri
ENSPVAG00000010281	HTATSF1	88	71.474	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	98	68.229	Rattus_norvegicus
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