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Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000013051 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 79578 bases
Position: chrscaffold_3165:58509-138086
Accession: 105300493
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000012309	IBN_N	PF03810.19	4.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000013051	TNPO1-201	2697	-	ENSPVAP00000012309	898 (aa)	XP_011371028	UPI00018B26A8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	81.354	ENSPVAG00000013411	TNPO2	99	81.354

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.666	Homo_sapiens
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.708	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	98.670	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.670	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.765	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.765	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.820	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.820	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.596	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.596	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	98	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	96.742	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	88.196	ENSANAG00000025351	-	100	88.196	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	64.309	ENSANAG00000027118	-	99	64.199	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.220	ENSANAG00000022453	-	100	99.220	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	91.461	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.461	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.489	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.443	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.443	Bos_taurus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	Capra_hircus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.220	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.220	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.555	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.555	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	94	87.013	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	75.533	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.332	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	99.298	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.298	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.360	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.258	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.817	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.304	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.304	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	92	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.449	Drosophila_melanogaster
ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000013051	TNPO1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	86.601	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.948	Esox_lucius
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.603	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	89.967	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.967	Gadus_morhua
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	96.102	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	Gallus_gallus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.953	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.034	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.034	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	98.998	ENSHGLG00000000970	-	100	98.998	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	98.832	ENSHGLG00100017090	-	99	98.832	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	75.390	ENSHGLG00100000963	-	100	74.833	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	99.329	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.329	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.708	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.708	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	90	90.259	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.259	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	95.190	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.596	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.596	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.809	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	99.219	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	98.885	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.885	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.655	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	Mola_mola
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.247	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.109	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	99.438	Mus_caroli
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	99.438	Mus_musculus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.220	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.438	Mus_pahari
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.109	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	99.438	Mus_spretus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	99.185	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.332	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.636	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.636	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000013051	TNPO1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	98.998	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	Octodon_degus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.111	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.111	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	91	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	92.991	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.991	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.607	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.555	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.555	Otolemur_garnettii
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.443	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	Ovis_aries
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000013051	TNPO1	93	86.740	ENSPTRG00000047731	-	100	86.740	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	90.449	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	90.348	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	99.298	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.978	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.169	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.169	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.169	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.371	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	Poecilia_mexicana
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