EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000013541 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26886 bases
Position: chrGeneScaffold_1050:141221-168106
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000012777	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.9e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000013542	PAPOLG-201	2205	-	ENSPVAP00000012777	734 (aa)	-	UPI00018B2D38

Gene Model

Click here to download ENSPVAG00000013541's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPVAG00000013541's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	73	72.626	ENSPVAG00000013925	PAPOLA	72	72.626

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	82.098	ENSAPOG00000004798	papolg	86	82.098	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	94.803	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	88	94.803	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	81	82.162	ENSACIG00000010546	papolg	87	82.162	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.917	ENSAOCG00000010254	papolg	79	81.917	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	82.098	ENSAPEG00000006944	papolg	79	82.098	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	82.342	ENSATEG00000009007	papolg	80	83.897	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	82.537	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	86	82.537	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	69	72.857	ENSACAG00000015048	-	85	72.857	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.633	ENSANAG00000024627	PAPOLG	89	94.633	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSACLG00000015592	papolg	77	81.982	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.967	ENSAMXG00000004611	papolg	87	81.967	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.149	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	89	94.149	Bos_taurus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	89	94.812	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.504	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	81	94.504	Canis_familiaris
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.681	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	90	94.434	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	89	94.326	Capra_hircus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.972	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	89	93.972	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	52	91.842	ENSCAPG00000014901	-	99	91.842	Cavia_aperea
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.262	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	89	93.262	Cavia_porcellus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	89	94.812	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	79	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	87	98.701	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.440	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	89	93.440	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.633	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	89	94.633	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	78	90.456	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	87	90.456	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	68	63.294	ENSCING00000024664	-	94	63.294	Ciona_intestinalis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	66	63.918	ENSCSAVG00000009085	-	97	63.918	Ciona_savignyi
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSCANG00000038120	PAPOLG	89	94.991	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	92.432	ENSCGRG00001014951	Papolg	89	92.432	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	92.432	ENSCGRG00000005552	-	89	92.432	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.261	ENSCSEG00000000771	papolg	91	81.261	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	79.747	ENSCVAG00000016602	papolg	89	83.034	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.216	ENSDARG00000012141	papolg	88	81.216	Danio_rerio
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.548	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	88	93.548	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	58	99.065	ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	73.913	ENSETEG00000011815	PAPOLG	88	73.913	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	63	70.649	ENSEBUG00000004020	papolg	94	70.649	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	65	55.649	ENSEBUG00000005042	-	78	57.174	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.858	ENSEASG00005002038	PAPOLG	89	94.858	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.858	ENSECAG00000009859	PAPOLG	87	94.982	Equus_caballus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	87.097	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	89	87.097	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.867	ENSELUG00000014497	papolg	79	81.867	Esox_lucius
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	89	94.326	Felis_catus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	85	74.128	ENSFALG00000011079	PAPOLG	81	74.128	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.262	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	86	93.262	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	54	79.739	ENSFHEG00000019080	papolg	74	79.739	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	82	80.501	ENSGMOG00000018772	papolg	90	80.501	Gadus_morhua
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	79.266	ENSGALG00000007853	PAPOLG	85	79.266	Gallus_gallus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.421	ENSGAFG00000003263	papolg	76	81.421	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	81.607	ENSGACG00000002718	papolg	88	81.607	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	89	94.812	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSHBUG00000004882	papolg	77	81.982	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	93.548	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	88	93.548	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.440	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	89	93.440	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.802	ENSHCOG00000006782	papolg	80	81.802	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.752	ENSIPUG00000021642	papolg	89	81.752	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.972	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	89	93.972	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	58	98.832	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	98.832	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.488	ENSKMAG00000016439	papolg	78	81.488	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.859	ENSLBEG00000023218	papolg	75	80.859	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	74.555	ENSLACG00000009543	PAPOLG	88	74.555	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.964	ENSLOCG00000016130	papolg	87	81.964	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	92.580	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.364	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	89	94.991	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	89	94.991	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	90.323	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	88	90.323	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	89	94.812	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSMAMG00000010667	papolg	87	81.982	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSMZEG00005018140	papolg	87	82.873	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	77.473	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	86	77.473	Meleagris_gallopavo
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	93.333	ENSMAUG00000009088	Papolg	88	93.333	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.440	ENSMICG00000010042	PAPOLG	89	93.918	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	93.190	ENSMOCG00000006857	Papolg	88	93.190	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.081	ENSMMOG00000008020	papolg	88	81.081	Mola_mola
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	90.714	ENSMODG00000002160	PAPOLG	87	90.714	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	81.395	ENSMALG00000007012	papolg	79	81.395	Monopterus_albus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.250	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.065	Mus_caroli
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.250	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	Mus_musculus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	92.718	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	89	92.793	Mus_pahari
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.073	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	Mus_spretus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.858	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	80	94.858	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	96.774	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	88	96.774	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.783	ENSNGAG00000001120	Papolg	89	93.783	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	72.744	ENSNBRG00000011943	papolg	85	72.744	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	58	99.533	ENSNLEG00000009507	-	99	99.533	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	60	99.275	ENSMEUG00000013605	-	64	99.275	Notamacropus_eugenii
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.085	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	89	93.085	Ochotona_princeps
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	57	95.024	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.024	Octodon_degus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	73.741	ENSONIG00000002985	papolg	90	73.741	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	90.958	ENSOANG00000012403	PAPOLG	86	90.958	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.794	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	89	93.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.091	ENSORLG00000001577	papolg	79	80.755	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.273	ENSORLG00020002482	papolg	79	80.935	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.273	ENSORLG00015008836	papolg	79	80.935	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	80.541	ENSOMEG00000001406	papolg	78	80.541	Oryzias_melastigma
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	ENSOARG00000001563	PAPOLG	80	94.326	Ovis_aries
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	89	94.991	Pan_paniscus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.504	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	89	94.504	Panthera_pardus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	89	94.326	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	89	94.991	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	90.323	ENSPANG00000014543	PAPOLG	88	90.323	Papio_anubis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	80.287	ENSPKIG00000003313	papolg	88	80.287	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	75	80.686	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	79	80.686	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	85.397	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	85	85.397	Pelodiscus_sinensis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	94.630	ENSPEMG00000008960	-	86	94.630	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	73	62.316	ENSPMAG00000002961	papolg	72	62.431	Petromyzon_marinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	67	62.372	ENSPMAG00000004864	-	96	62.372	Petromyzon_marinus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	90.957	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	88	90.957	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	ENSPFOG00000012909	papolg	86	81.718	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	ENSPLAG00000018445	papolg	78	80.680	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	ENSPMEG00000003961	papolg	78	80.680	Poecilia_mexicana
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.680	ENSPREG00000010358	papolg	77	80.680	Poecilia_reticulata
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.991	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	89	94.991	Pongo_abelii
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	78	90.776	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	78	90.776	Procavia_capensis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	82	87.805	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	86	87.805	Propithecus_coquereli
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSPNYG00000006729	papolg	89	81.982	Pundamilia_nyererei
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.685	ENSPNAG00000015521	papolg	87	81.387	Pygocentrus_nattereri
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	93.716	ENSRNOG00000006261	Papolg	88	93.716	Rattus_norvegicus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	89.247	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	88	89.247	Rhinopithecus_bieti
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.812	ENSRROG00000035954	PAPOLG	89	94.812	Rhinopithecus_roxellana
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	95.170	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	89	95.170	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	83	92.115	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	86	92.115	Sarcophilus_harrisii
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	80.037	ENSSFOG00015002383	papolg	90	79.853	Scleropages_formosus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	73.214	ENSSFOG00015011874	papolg	90	73.214	Scleropages_formosus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	83.240	ENSSMAG00000015598	papolg	80	81.655	Scophthalmus_maximus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSSDUG00000000912	papolg	87	81.982	Seriola_dumerili
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	ENSSLDG00000001217	papolg	88	77.878	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	85.401	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	85	85.401	Sphenodon_punctatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.802	ENSSPAG00000009004	papolg	86	81.802	Stegastes_partitus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.624	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	89	94.624	Sus_scrofa
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	72	75.000	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	75.000	Taeniopygia_guttata
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	81	81.013	ENSTRUG00000006410	papolg	83	81.013	Takifugu_rubripes
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	74.733	ENSTNIG00000017106	papolg	89	74.733	Tetraodon_nigroviridis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	86.918	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	89	86.918	Tupaia_belangeri
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	95.699	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	89	95.699	Tursiops_truncatus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.326	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	89	94.424	Ursus_americanus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	94.424	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	80	94.424	Ursus_maritimus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	95.699	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	89	95.699	Vicugna_pacos
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.681	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	88	94.681	Vulpes_vulpes
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.967	ENSXETG00000002208	papolg	86	81.967	Xenopus_tropicalis
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	67	83.266	ENSXCOG00000006611	papolg	73	83.266	Xiphophorus_couchianus
ENSPVAG00000013541	PAPOLG	74	80.684	ENSXMAG00000007383	papolg	94	80.684	Xiphophorus_maculatus