EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPVAG00000016155 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Pteropus_vampyrus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30893 bases
Position: chrGeneScaffold_336:66429-97321
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPVAP00000015246	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-28	1	1
ENSPVAP00000015246	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.9e-13	1	1
ENSPVAP00000015246	EFG_IV	PF03764.18	4.5e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPVAT00000016155	EFTUD2-201	2916	-	ENSPVAP00000015246	971 (aa)	-	UPI00018B3411

Gene Model

Click here to download ENSPVAG00000016155's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPVAG00000016155's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	67	40.686	ENSPVAG00000017495	EEF2	76	40.686

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	87.757	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	95.062	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	84.465	ENSACIG00000009096	eftud2	100	84.259	Amphilophus_citrinellus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	87	85.059	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	85.059	Amphiprion_ocellaris
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.066	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	87.860	Amphiprion_percula
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.374	ENSATEG00000000457	eftud2	100	88.169	Anabas_testudineus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	99	89.907	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	89.907	Anas_platyrhynchos
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.004	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	93.004	Anolis_carolinensis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.856	Aotus_nancymaae
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSACLG00000001296	eftud2	100	87.757	Astatotilapia_calliptera
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.308	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	87.206	Astyanax_mexicanus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	94.959	Bos_taurus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	99	66.839	WBGene00001166	eftu-2	99	66.736	Caenorhabditis_elegans
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.856	Callithrix_jacchus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	95.062	Canis_familiaris
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.062	Canis_lupus_dingo
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	94.959	Capra_hircus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	94.444	Carlito_syrichta
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	94.444	Cavia_aperea
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	94.444	Cavia_porcellus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	94.856	Cebus_capucinus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.856	Cercocebus_atys
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.342	Chinchilla_lanigera
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.856	Chlorocebus_sabaeus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	91	81.644	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.644	Choloepus_hoffmanni
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.033	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.033	Chrysemys_picta_bellii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	74.256	ENSCING00000009372	-	100	74.256	Ciona_intestinalis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	99	74.440	ENSCSAVG00000004985	-	99	76.769	Ciona_savignyi
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	94.856	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	94.547	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	94.547	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.140	Cynoglossus_semilaevis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	87.860	Cyprinodon_variegatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.742	ENSDARG00000012261	eftud2	100	86.742	Danio_rerio
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	94.444	Dasypus_novemcinctus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.650	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	94.650	Dipodomys_ordii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	71.795	FBgn0039566	CG4849	100	71.795	Drosophila_melanogaster
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	74	92.537	ENSEBUG00000004047	-	96	86.787	Eptatretus_burgeri
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	95.062	Equus_asinus_asinus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	94.959	Equus_caballus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.728	ENSELUG00000017169	eftud2	100	86.626	Esox_lucius
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.959	Felis_catus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.519	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	93.519	Ficedula_albicollis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.650	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.650	Fukomys_damarensis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.272	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	87.963	Fundulus_heteroclitus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.728	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	87.140	Gadus_morhua
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.621	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	93.621	Gallus_gallus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	87.757	Gambusia_affinis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.654	ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	94.856	Gorilla_gorilla
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	87.654	Haplochromis_burtoni
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	94.342	Heterocephalus_glaber_female
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.342	Heterocephalus_glaber_male
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.831	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	86.831	Hippocampus_comes
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.934	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	87.860	Ictalurus_punctatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.432	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	90.432	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	94.897	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.897	Jaculus_jaculus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.654	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	87.243	Kryptolebias_marmoratus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	87.271	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.176	Labrus_bergylta
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	89.918	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	90.442	Latimeria_chalumnae
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	87.757	Lepisosteus_oculatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	94.342	Loxodonta_africana
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	94.856	Macaca_fascicularis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	94.856	Macaca_nemestrina
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	94.856	Mandrillus_leucophaeus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.374	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	88.169	Mastacembelus_armatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	87.757	Maylandia_zebra
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.634	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	93.634	Meleagris_gallopavo
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	94.547	Mesocricetus_auratus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	94.856	Microcebus_murinus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	92	79.663	ENSMOCG00000017653	-	90	79.663	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.650	ENSMOCG00000009039	-	100	94.650	Microtus_ochrogaster
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	87	90.353	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	90.353	Mola_mola
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	94.547	Monodelphis_domestica
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	87	88.588	ENSMALG00000014501	eftud2	100	88.588	Monopterus_albus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	94.547	Mus_caroli
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	94.547	Mus_musculus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	94.547	Mus_pahari
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	94.547	Mus_spretus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	97	94.703	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	94.703	Mustela_putorius_furo
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	95.062	Myotis_lucifugus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	94.753	Nannospalax_galili
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	87.654	Neolamprologus_brichardi
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	97	93.092	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	93.092	Nomascus_leucogenys
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.844	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.844	Notamacropus_eugenii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.523	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	86.523	Ochotona_princeps
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.136	ENSODEG00000018041	-	100	94.136	Octodon_degus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	89	79.454	ENSODEG00000003385	-	97	79.454	Octodon_degus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSONIG00000000912	eftud2	100	87.757	Oreochromis_niloticus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.856	Oryctolagus_cuniculus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	ENSORLG00000003109	eftud2	100	87.346	Oryzias_latipes
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.449	ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.449	Oryzias_latipes_hni
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.449	ENSORLG00015002611	eftud2	100	88.998	Oryzias_latipes_hsok
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	92.695	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	92.695	Otolemur_garnettii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	94.959	Ovis_aries
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	94.959	Pan_paniscus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	95.062	Panthera_pardus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	95.062	Panthera_tigris_altaica
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.959	Pan_troglodytes
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	94.856	Papio_anubis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	93	92.393	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	92.393	Pelodiscus_sinensis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	80.761	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	80.556	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	94.753	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	94.547	Phascolarctos_cinereus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	87.757	Poecilia_formosa
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	87.757	Poecilia_latipinna
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	87.757	Poecilia_mexicana
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.416	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	93.416	Pongo_abelii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.535	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.535	Procavia_capensis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.959	Propithecus_coquereli
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	87.654	Pundamilia_nyererei
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.449	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.066	Pygocentrus_nattereri
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.033	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.827	Rattus_norvegicus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	94.753	Rhinopithecus_bieti
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.753	Rhinopithecus_roxellana
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	97	32.344	YKL173W	SNU114	97	31.949	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.856	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	94.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.680	Sarcophilus_harrisii
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	87.243	Scleropages_formosus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.551	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	87.346	Scophthalmus_maximus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	87.963	Seriola_dumerili
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	87.963	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.214	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	86.214	Sorex_araneus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.004	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	93.004	Sphenodon_punctatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	87.963	Stegastes_partitus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	94.856	Sus_scrofa
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	83	92.795	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.795	Taeniopygia_guttata
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.243	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.037	Takifugu_rubripes
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	82.667	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	82.462	Tetraodon_nigroviridis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	89.300	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	89.300	Tupaia_belangeri
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.580	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	88.580	Tursiops_truncatus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.943	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	95	99.477	Ursus_americanus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	95.062	Ursus_maritimus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	95.062	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	95.062	Vulpes_vulpes
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	96	90.192	ENSXETG00000003394	eftud2	98	91.295	Xenopus_tropicalis
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	81	89.668	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	89.668	Xiphophorus_couchianus
ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	87.757	Xiphophorus_maculatus