EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRBIG00000021642 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_bieti
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 103417 bases
Position: chrMCGX01007012.1:3035968-3139384
Accession: 108541159
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRBIP00000005098	IBN_N	PF03810.19	8.4e-16	1	1
ENSRBIP00000005059	IBN_N	PF03810.19	8.9e-16	1	1
ENSRBIP00000005013	IBN_N	PF03810.19	9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRBIT00000025162	TNPO1-202	2547	-	ENSRBIP00000005045	848 (aa)	-	A0A2K6K197
ENSRBIT00000025221	TNPO1-203	3162	XM_017890594	ENSRBIP00000005059	890 (aa)	XP_017746083	A0A2K6K1D5
ENSRBIT00000025044	TNPO1-201	9052	XM_017890593	ENSRBIP00000005013	898 (aa)	XP_017746082	A0A2K6K162
ENSRBIT00000025357	TNPO1-204	2628	-	ENSRBIP00000005098	875 (aa)	-	A0A2K6K1D6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	85.344	ENSRBIG00000036652	TNPO2	99	85.344

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.109	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	99.109	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRBIG00000021642	TNPO1	87	92.894	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	Amphilophus_citrinellus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.483	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	92.672	ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	Anas_platyrhynchos
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	96.742	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	Anolis_carolinensis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	88.652	ENSANAG00000025351	-	100	88.419	Aotus_nancymaae
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	64.302	ENSANAG00000027118	-	99	64.199	Aotus_nancymaae
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.555	ENSANAG00000022453	-	100	99.555	Aotus_nancymaae
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	91.573	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	Astatotilapia_calliptera
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.777	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.777	Bos_taurus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.666	Callithrix_jacchus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	99.767	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.767	Canis_familiaris
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	97.948	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	97.948	Canis_lupus_dingo
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.666	Capra_hircus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	95.706	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	Carlito_syrichta
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.555	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.555	Cebus_capucinus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.555	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	Chinchilla_lanigera
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.889	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.889	Chlorocebus_sabaeus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	94	87.131	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.131	Choloepus_hoffmanni
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	97.753	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	Chrysemys_picta_bellii
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.666	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	99.649	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.649	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.258	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	Cyprinodon_variegatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.593	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.617	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.638	Dasypus_novemcinctus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	93	99.759	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.759	Dipodomys_ordii
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSRBIG00000021642	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSRBIG00000021642	TNPO1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.777	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.777	Equus_caballus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	86.601	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	Esox_lucius
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	100.000	Felis_catus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	97.416	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	Ficedula_albicollis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.666	Fukomys_damarensis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.603	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	Fundulus_heteroclitus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	90.034	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	Gadus_morhua
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	96.742	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	Gallus_gallus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.146	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	Gasterosteus_aculeatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	97.528	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	Gopherus_agassizii
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	83.184	ENSGGOG00000022535	-	99	83.240	Gorilla_gorilla
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.146	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	Haplochromis_burtoni
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.332	ENSHGLG00000000970	-	100	99.332	Heterocephalus_glaber_female
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	99.182	ENSHGLG00100017090	-	99	99.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	75.501	ENSHGLG00100000963	-	99	77.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.775	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.775	Jaculus_jaculus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.596	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	91	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	89.186	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	Latimeria_chalumnae
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	95.393	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.302	Lepisosteus_oculatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	97	99.192	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	Loxodonta_africana
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.889	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.889	Macaca_mulatta
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.483	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.921	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	Maylandia_zebra
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.663	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	95.843	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.857	Microcebus_murinus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.663	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	Microtus_ochrogaster
ENSRBIG00000021642	TNPO1	87	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.360	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.443	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.555	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.443	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.889	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.889	Mustela_putorius_furo
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	99.302	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.302	Myotis_lucifugus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.666	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	Nannospalax_galili
ENSRBIG00000021642	TNPO1	87	92.765	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	Neolamprologus_brichardi
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSRBIG00000021642	TNPO1	91	93.272	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	Ochotona_princeps
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.332	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.332	Octodon_degus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	92.411	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	Oreochromis_niloticus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	92	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	93.224	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	Oryctolagus_cuniculus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	87	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hni
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.889	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.889	Otolemur_garnettii
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	99.777	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.777	Ovis_aries
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSRBIG00000021642	TNPO1	94	87.017	ENSPTRG00000047731	-	100	87.017	Pan_troglodytes
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	100.000	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	100.000	Papio_anubis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	97.416	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	Pelodiscus_sinensis
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	99.649	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	98.315	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	Phascolarctos_cinereus
ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.169	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.169	Poecilia_formosa
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ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.042	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	Xiphophorus_maculatus