EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRBIG00000029189 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_bieti
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 56490 bases
Position: chrMCGX01011083.1:249382-305871
Accession: 108513332
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRBIP00000010737	CRM1_C	PF08767.11	6.9e-92	1	2
ENSRBIP00000010737	CRM1_C	PF08767.11	6.9e-92	2	2
ENSRBIP00000010737	Xpo1	PF08389.12	1.4e-40	1	1
ENSRBIP00000010737	IBN_N	PF03810.19	3.6e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRBIT00000034371	XPO1-201	3093	XM_017849062	ENSRBIP00000010737	1030 (aa)	XP_017704551	A0A2K6KHI6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.616	ENSAPOG00000004984	-	100	87.616	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	80.806	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	80.806	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.419	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	90.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.245	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	83.245	Amphilophus_citrinellus
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	86.744	ENSACIG00000010818	-	100	86.744	Amphilophus_citrinellus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.613	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	83.613	Amphiprion_ocellaris
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.616	ENSAOCG00000010121	-	100	87.616	Amphiprion_ocellaris
ENSRBIG00000029189	XPO1	90	83.265	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	83.265	Amphiprion_percula
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.616	ENSAPEG00000007038	-	100	87.616	Amphiprion_percula
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.240	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	83.240	Anabas_testudineus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.616	ENSATEG00000008816	-	100	87.616	Anabas_testudineus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.317	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	90.317	Anas_platyrhynchos
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.130	ENSACAG00000002501	XPO1	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.963	ENSANAG00000020802	XPO1	100	91.963	Aotus_nancymaae
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.351	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	83.351	Astatotilapia_calliptera
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.430	ENSACLG00000015192	-	100	87.430	Astatotilapia_calliptera
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.896	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	87.896	Astyanax_mexicanus
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	84.477	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	84.477	Astyanax_mexicanus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	90.503	Bos_taurus
ENSRBIG00000029189	XPO1	99	46.409	WBGene00002078	xpo-1	99	46.409	Caenorhabditis_elegans
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	91.620	Callithrix_jacchus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	90.503	Canis_familiaris
ENSRBIG00000029189	XPO1	93	89.690	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	89.690	Canis_lupus_dingo
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	90.503	Capra_hircus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	90.503	Carlito_syrichta
ENSRBIG00000029189	XPO1	51	81.915	ENSCAPG00000006454	-	100	81.915	Cavia_aperea
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	89.013	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	89.013	Cavia_porcellus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	75.139	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	75.325	Cebus_capucinus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	93.364	ENSCATG00000032674	XPO1	100	93.364	Cercocebus_atys
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.223	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	90.223	Chinchilla_lanigera
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.620	Chlorocebus_sabaeus
ENSRBIG00000029189	XPO1	85	95.090	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	95.090	Choloepus_hoffmanni
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.223	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	90.223	Chrysemys_picta_bellii
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	73.538	ENSCING00000024562	-	100	73.538	Ciona_intestinalis
ENSRBIG00000029189	XPO1	99	72.507	ENSCSAVG00000005965	-	99	72.507	Ciona_savignyi
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.337	ENSCANG00000028883	XPO1	100	87.589	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	89.581	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	89.581	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	89.581	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	89.581	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	86.262	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	86.262	Cynoglossus_semilaevis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.523	ENSCVAG00000016788	-	100	87.523	Cyprinodon_variegatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	82.868	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	82.868	Cyprinodon_variegatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	88.268	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	88.268	Danio_rerio
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	85.102	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	89.831	Danio_rerio
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	90.503	Dasypus_novemcinctus
ENSRBIG00000029189	XPO1	91	87.100	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	87.100	Dipodomys_ordii
ENSRBIG00000029189	XPO1	99	63.907	FBgn0020497	emb	99	63.907	Drosophila_melanogaster
ENSRBIG00000029189	XPO1	95	94.312	ENSETEG00000018045	XPO1	94	94.312	Echinops_telfairi
ENSRBIG00000029189	XPO1	90	70.734	ENSEBUG00000012580	-	100	77.150	Eptatretus_burgeri
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSEASG00005007223	XPO1	100	90.503	Equus_asinus_asinus
ENSRBIG00000029189	XPO1	95	96.429	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	Equus_caballus
ENSRBIG00000029189	XPO1	85	97.059	ENSEEUG00000009479	XPO1	83	97.059	Erinaceus_europaeus
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	85.472	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	85.472	Esox_lucius
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.031	ENSELUG00000014306	-	99	83.031	Esox_lucius
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	90.503	Felis_catus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.037	ENSFALG00000010989	XPO1	100	90.037	Ficedula_albicollis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	88.641	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	88.641	Fukomys_damarensis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.147	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	83.147	Fundulus_heteroclitus
ENSRBIG00000029189	XPO1	51	66.355	ENSFHEG00000018974	-	100	66.355	Fundulus_heteroclitus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	81.657	ENSGMOG00000019063	-	100	81.657	Gadus_morhua
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	84.637	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	84.637	Gadus_morhua
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.317	ENSGALG00000029476	XPO1	100	90.317	Gallus_gallus
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.139	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	83.139	Gambusia_affinis
ENSRBIG00000029189	XPO1	90	86.756	ENSGAFG00000003355	-	98	86.756	Gambusia_affinis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.430	ENSGACG00000002743	-	100	87.430	Gasterosteus_aculeatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.147	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	83.147	Gasterosteus_aculeatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.130	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	90.130	Gopherus_agassizii
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	93.271	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	93.271	Gorilla_gorilla
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.706	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	83.706	Haplochromis_burtoni
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.523	ENSHBUG00000020037	-	100	87.523	Haplochromis_burtoni
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.130	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	90.130	Heterocephalus_glaber_female
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.130	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	90.130	Heterocephalus_glaber_male
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	85.684	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	85.684	Hippocampus_comes
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.896	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	87.896	Ictalurus_punctatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	85.661	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	85.661	Ictalurus_punctatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	90.503	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.223	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	90.223	Jaculus_jaculus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.054	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	83.054	Kryptolebias_marmoratus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.151	ENSKMAG00000016218	-	100	87.151	Kryptolebias_marmoratus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.616	ENSLBEG00000005740	-	100	87.616	Labrus_bergylta
ENSRBIG00000029189	XPO1	87	80.570	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	80.570	Labrus_bergylta
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	71.389	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.389	Latimeria_chalumnae
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	88.268	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	88.268	Lepisosteus_oculatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.130	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	90.130	Loxodonta_africana
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	91.620	Macaca_fascicularis
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	91.620	Macaca_mulatta
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	91.620	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	91.620	Macaca_nemestrina
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	93.271	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	93.271	Mandrillus_leucophaeus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.520	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	83.520	Mastacembelus_armatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.430	ENSMAMG00000010568	-	100	87.430	Mastacembelus_armatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.706	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	83.706	Maylandia_zebra
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.430	ENSMZEG00005018158	-	98	86.756	Maylandia_zebra
ENSRBIG00000029189	XPO1	67	85.871	ENSMGAG00000001496	-	100	85.871	Meleagris_gallopavo
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	89.581	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	89.581	Mesocricetus_auratus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSMICG00000027770	XPO1	100	90.503	Microcebus_murinus
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ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.245	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	83.245	Mola_mola
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	89.385	ENSMODG00000002831	XPO1	100	89.385	Monodelphis_domestica
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ENSRBIG00000029189	XPO1	87	82.309	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	82.309	Monopterus_albus
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ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.410	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	90.410	Nannospalax_galili
ENSRBIG00000029189	XPO1	96	86.776	ENSNBRG00000012229	-	100	86.850	Neolamprologus_brichardi
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ENSRBIG00000029189	XPO1	59	100.000	ENSMEUG00000013277	-	57	100.000	Notamacropus_eugenii
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ENSRBIG00000029189	XPO1	100	88.920	ENSODEG00000012632	XPO1	100	88.920	Octodon_degus
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ENSRBIG00000029189	XPO1	100	90.503	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	90.503	Vulpes_vulpes
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	88.920	ENSXETG00000002224	xpo1	100	88.920	Xenopus_tropicalis
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ENSRBIG00000029189	XPO1	87	83.139	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	83.139	Xiphophorus_couchianus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	87.337	ENSXMAG00000007353	-	100	87.337	Xiphophorus_maculatus
ENSRBIG00000029189	XPO1	100	83.426	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	83.426	Xiphophorus_maculatus