EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSRBIG00000042970 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Rhinopithecus_bieti
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13330 bases
Position: chrMCGX01005505.1:44087-57416
Accession: 108538432
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRBIP00000038999	SYF2	PF08231.12	2.5e-50	1	1
ENSRBIP00000038993	SYF2	PF08231.12	6.9e-50	1	1
ENSRBIP00000038995	SYF2	PF08231.12	6.9e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRBIT00000063016	SYF2-202	3011	-	ENSRBIP00000038995	242 (aa)	-	A0A2K6MT76
ENSRBIT00000063014	SYF2-201	1842	XM_017886502	ENSRBIP00000038993	242 (aa)	XP_017741991	A0A2K6MT76
ENSRBIT00000063020	SYF2-203	603	-	ENSRBIP00000038999	200 (aa)	-	A0A2K6MTA7

Gene Model

Click here to download ENSRBIG00000042970's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSRBIG00000042970's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.062	ENSG00000117614	SYF2	100	95.062	Homo_sapiens
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	81.279	ENSAPOG00000001174	syf2	99	77.966	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRBIG00000042970	SYF2	80	93.333	ENSAMEG00000010134	-	100	93.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRBIG00000042970	SYF2	98	90.041	ENSAMEG00000010115	-	99	90.041	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.539	ENSACIG00000023688	syf2	88	78.539	Amphilophus_citrinellus
ENSRBIG00000042970	SYF2	98	77.311	ENSAOCG00000022046	syf2	99	77.311	Amphiprion_ocellaris
ENSRBIG00000042970	SYF2	88	76.712	ENSAOCG00000010912	syf2	68	76.712	Amphiprion_ocellaris
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	78.390	ENSAPEG00000018858	syf2	91	78.390	Amphiprion_percula
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	80.184	ENSATEG00000007745	syf2	99	76.695	Anabas_testudineus
ENSRBIG00000042970	SYF2	82	85.427	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSRBIG00000042970	SYF2	84	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSRBIG00000042970	SYF2	79	72.327	ENSACAG00000026777	-	95	72.327	Anolis_carolinensis
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	94.650	ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.650	Aotus_nancymaae
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	ENSACLG00000019916	syf2	100	73.950	Astatotilapia_calliptera
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	80.275	ENSAMXG00000004051	syf2	92	80.275	Astyanax_mexicanus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.796	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	91.525	Bos_taurus
ENSRBIG00000042970	SYF2	86	49.524	WBGene00019402	syf-2	99	46.352	Caenorhabditis_elegans
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.062	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	95.062	Callithrix_jacchus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	80.658	ENSCAFG00000030331	-	100	80.658	Canis_familiaris
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.574	ENSCAFG00000012895	-	99	90.574	Canis_familiaris
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.574	ENSCAFG00020021091	-	99	90.574	Canis_lupus_dingo
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	83.684	ENSCAFG00020021094	-	97	83.684	Canis_lupus_dingo
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.889	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	90.795	Capra_hircus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.535	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.535	Carlito_syrichta
ENSRBIG00000042970	SYF2	81	94.949	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	94.949	Cavia_aperea
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.574	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.574	Cavia_porcellus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.062	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	95.062	Cebus_capucinus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	ENSCATG00000026917	SYF2	100	96.708	Cercocebus_atys
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	91.803	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.803	Chinchilla_lanigera
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.708	Chlorocebus_sabaeus
ENSRBIG00000042970	SYF2	71	75.723	ENSCHOG00000005273	-	96	75.723	Choloepus_hoffmanni
ENSRBIG00000042970	SYF2	92	86.607	ENSCPBG00000025073	SYF2	93	85.281	Chrysemys_picta_bellii
ENSRBIG00000042970	SYF2	87	52.113	ENSCING00000003017	-	89	52.113	Ciona_intestinalis
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	44.845	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	83.128	ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.539	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	87.654	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	87.654	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRBIG00000042970	SYF2	81	92.857	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	92.462	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	75.688	ENSCSEG00000000117	syf2	100	69.547	Cynoglossus_semilaevis
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.539	ENSCVAG00000019543	syf2	99	75.105	Cyprinodon_variegatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	76.250	ENSDARG00000004706	syf2	100	76.250	Danio_rerio
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.947	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	90.947	Dasypus_novemcinctus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	89.256	ENSDORG00000001274	Syf2	99	89.256	Dipodomys_ordii
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	53.636	FBgn0033556	CG12343	97	53.636	Drosophila_melanogaster
ENSRBIG00000042970	SYF2	94	73.799	ENSETEG00000015729	SYF2	100	74.672	Echinops_telfairi
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	52.198	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.571	ENSEASG00005004224	-	100	88.571	Equus_asinus_asinus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	78.601	ENSEASG00005004232	-	100	78.601	Equus_asinus_asinus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.980	ENSECAG00000012023	-	100	88.980	Equus_caballus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	89.669	ENSECAG00000010440	-	96	93.013	Equus_caballus
ENSRBIG00000042970	SYF2	75	77.049	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	77.311	ENSELUG00000003465	syf2	100	77.311	Esox_lucius
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.574	ENSFCAG00000043095	-	99	90.574	Felis_catus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	91.020	ENSFCAG00000010324	-	85	91.020	Felis_catus
ENSRBIG00000042970	SYF2	84	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	93	78.879	Ficedula_albicollis
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.535	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	90.535	Fukomys_damarensis
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	64.091	ENSFHEG00000007238	syf2	97	64.091	Fundulus_heteroclitus
ENSRBIG00000042970	SYF2	88	81.395	ENSGMOG00000019138	syf2	96	81.395	Gadus_morhua
ENSRBIG00000042970	SYF2	92	84.375	ENSGALG00000013639	SYF2	99	78.800	Gallus_gallus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	72.614	ENSGAFG00000019435	syf2	99	71.369	Gambusia_affinis
ENSRBIG00000042970	SYF2	88	80.465	ENSGACG00000007305	syf2	90	80.465	Gasterosteus_aculeatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	92	86.161	ENSGAGG00000010670	SYF2	93	84.848	Gopherus_agassizii
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.473	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	95.473	Gorilla_gorilla
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	ENSHBUG00000020477	syf2	100	73.950	Haplochromis_burtoni
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.984	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_female
ENSRBIG00000042970	SYF2	93	80.617	ENSHGLG00000004304	-	99	77.083	Heterocephalus_glaber_female
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.984	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	90.984	Heterocephalus_glaber_male
ENSRBIG00000042970	SYF2	98	75.104	ENSHCOG00000012904	syf2	79	75.104	Hippocampus_comes
ENSRBIG00000042970	SYF2	91	80.090	ENSIPUG00000019859	syf2	93	80.090	Ictalurus_punctatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	60	92.466	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	92.466	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	82	93.970	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	93.970	Jaculus_jaculus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	74.167	ENSKMAG00000013856	syf2	99	74.167	Kryptolebias_marmoratus
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.909	ENSLBEG00000014425	syf2	99	76.695	Labrus_bergylta
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	77.500	ENSLACG00000012064	SYF2	99	77.917	Latimeria_chalumnae
ENSRBIG00000042970	SYF2	97	77.872	ENSLOCG00000002728	syf2	92	77.872	Lepisosteus_oculatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	75	61.957	ENSLAFG00000030814	-	100	61.957	Loxodonta_africana
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.796	ENSLAFG00000023150	-	100	89.796	Loxodonta_africana
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	97.119	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	97.119	Macaca_fascicularis
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	96.708	Macaca_mulatta
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	97.119	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	97.119	Macaca_nemestrina
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	96.708	Mandrillus_leucophaeus
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	78.341	ENSMAMG00000010403	syf2	100	71.721	Mastacembelus_armatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.000	ENSMZEG00005006429	syf2	99	75.000	Maylandia_zebra
ENSRBIG00000042970	SYF2	82	85.427	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	Meleagris_gallopavo
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.066	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	88.066	Mesocricetus_auratus
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	93.258	ENSMICG00000016191	SYF2	100	94.472	Microcebus_murinus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.889	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	88.889	Microtus_ochrogaster
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	76.712	ENSMMOG00000002396	syf2	92	76.712	Mola_mola
ENSRBIG00000042970	SYF2	93	85.463	ENSMODG00000013951	-	99	85.463	Monodelphis_domestica
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.949	ENSMALG00000010706	syf2	98	75.949	Monopterus_albus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.300	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	89.300	Mus_caroli
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.300	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	89.300	Mus_musculus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.300	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	89.300	Mus_pahari
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.300	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	89.300	Mus_spretus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.984	ENSMPUG00000015802	-	99	90.984	Mustela_putorius_furo
ENSRBIG00000042970	SYF2	98	91.250	ENSMPUG00000015801	-	98	91.250	Mustela_putorius_furo
ENSRBIG00000042970	SYF2	98	90.336	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	90.336	Myotis_lucifugus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.837	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	89.837	Nannospalax_galili
ENSRBIG00000042970	SYF2	97	68.750	ENSNBRG00000010720	syf2	100	68.750	Neolamprologus_brichardi
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.885	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	95.885	Nomascus_leucogenys
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.477	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	88.477	Ochotona_princeps
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	92.275	ENSODEG00000017664	-	98	92.275	Octodon_degus
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	82.403	ENSODEG00000014338	-	98	82.403	Octodon_degus
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	ENSONIG00000008213	syf2	100	73.950	Oreochromis_niloticus
ENSRBIG00000042970	SYF2	83	86.634	ENSOANG00000009552	SYF2	100	86.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	92.213	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	92.213	Oryctolagus_cuniculus
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.452	ENSORLG00000028820	syf2	94	79.452	Oryzias_latipes
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.452	ENSORLG00020018333	syf2	92	79.452	Oryzias_latipes_hni
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	74.167	ENSORLG00015014665	syf2	100	74.167	Oryzias_latipes_hsok
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	76.050	ENSOMEG00000013911	syf2	100	76.050	Oryzias_melastigma
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	91.322	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	91.322	Otolemur_garnettii
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.879	ENSOARG00000006348	-	100	89.879	Ovis_aries
ENSRBIG00000042970	SYF2	80	64.948	ENSOARG00000006269	-	100	64.948	Ovis_aries
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.473	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	95.473	Pan_paniscus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.574	ENSPPRG00000001651	-	99	90.574	Panthera_pardus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.650	ENSPPRG00000001638	-	100	90.650	Panthera_pardus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.164	ENSPTIG00000007036	-	99	90.164	Panthera_tigris_altaica
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	95.370	ENSPTIG00000005711	-	82	93.363	Panthera_tigris_altaica
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.473	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	95.473	Pan_troglodytes
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	97.119	ENSPANG00000008139	SYF2	100	97.119	Papio_anubis
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	77.682	ENSPKIG00000008130	syf2	99	77.682	Paramormyrops_kingsleyae
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	82.833	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	82.833	Pelodiscus_sinensis
ENSRBIG00000042970	SYF2	97	75.000	ENSPMGG00000008755	syf2	92	75.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.066	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	88.889	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRBIG00000042970	SYF2	93	90.667	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	89.956	Phascolarctos_cinereus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	73.333	ENSPFOG00000004116	syf2	95	73.333	Poecilia_formosa
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	73.333	ENSPLAG00000006691	syf2	99	73.333	Poecilia_latipinna
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	70.833	ENSPMEG00000011684	syf2	100	69.547	Poecilia_mexicana
ENSRBIG00000042970	SYF2	89	77.778	ENSPREG00000003009	syf2	100	72.016	Poecilia_reticulata
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.885	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	95.885	Pongo_abelii
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	73.632	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	73.632	Propithecus_coquereli
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	78.601	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	78.601	Pteropus_vampyrus
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.082	ENSPNYG00000004979	syf2	100	73.950	Pundamilia_nyererei
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	76.955	ENSPNAG00000015570	syf2	100	76.955	Pygocentrus_nattereri
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.300	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	89.300	Rattus_norvegicus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	97.119	ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.119	Rhinopithecus_roxellana
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	93.827	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.827	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRBIG00000042970	SYF2	93	88.889	ENSSHAG00000015630	-	92	88.596	Sarcophilus_harrisii
ENSRBIG00000042970	SYF2	82	91.457	ENSSHAG00000007152	-	97	91.457	Sarcophilus_harrisii
ENSRBIG00000042970	SYF2	93	78.414	ENSSFOG00015023647	syf2	96	78.414	Scleropages_formosus
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.424	ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.424	Scophthalmus_maximus
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	80.275	ENSSDUG00000013072	syf2	98	75.949	Seriola_dumerili
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	80.275	ENSSLDG00000012677	syf2	98	75.949	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	71.311	ENSSARG00000012889	SYF2	100	71.311	Sorex_araneus
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	83.550	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	83.550	Sphenodon_punctatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	95	77.119	ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.119	Stegastes_partitus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	88.889	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	88.889	Sus_scrofa
ENSRBIG00000042970	SYF2	64	62.879	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	56.571	Taeniopygia_guttata
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	77.982	ENSTRUG00000001499	syf2	88	77.982	Takifugu_rubripes
ENSRBIG00000042970	SYF2	90	77.064	ENSTNIG00000016912	syf2	98	77.064	Tetraodon_nigroviridis
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	69.835	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.421	Tupaia_belangeri
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.754	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	90.574	Tursiops_truncatus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	89.754	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	89.754	Ursus_americanus
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.164	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	90.164	Ursus_maritimus
ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.164	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	Vicugna_pacos
ENSRBIG00000042970	SYF2	99	90.574	ENSVVUG00000027175	-	99	90.574	Vulpes_vulpes
ENSRBIG00000042970	SYF2	84	93.659	ENSVVUG00000027181	-	100	87.097	Vulpes_vulpes
ENSRBIG00000042970	SYF2	96	78.970	ENSXETG00000022797	syf2	94	78.970	Xenopus_tropicalis
ENSRBIG00000042970	SYF2	88	78.140	ENSXMAG00000022698	syf2	100	72.016	Xiphophorus_maculatus