EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSRNOG00000002818 (Gene tree)
Gene ID: 287739
Gene Symbol: Eftud2
Alias: LOC287739
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Rattus_norvegicus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 51854 bases
Position: chr10:90932075-90983928
Accession: 1560116
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSRNOP00000052049	GTP_EFTU	PF00009.27	3.3e-45	1	1
ENSRNOP00000052049	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-12	1	1
ENSRNOP00000052049	EFG_IV	PF03764.18	2.4e-23	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSRNOT00000093334	-	562	-	-	- (aa)	-	-
ENSRNOT00000093605	-	712	-	-	- (aa)	-	-
ENSRNOT00000093592	-	724	-	-	- (aa)	-	-
ENSRNOT00000093182	-	1120	-	-	- (aa)	-	-
ENSRNOT00000093143	-	473	-	ENSRNOP00000076344	61 (aa)	-	A0A1W2Q6N7
ENSRNOT00000055176	-	3267	XM_001081526	ENSRNOP00000052049	971 (aa)	XP_001081526	F1LM66
ENSRNOT00000093424	-	660	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSRNOG00000002818's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
rno03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSRNOG00000002818's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSRNOG00000002818	Eftud2	87	39.175	ENSRNOG00000020266	Eef2	99	39.175
ENSRNOG00000002818	Eftud2	73	33.803	ENSRNOG00000032723	Efl1	69	33.803

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.383	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.070	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.070	Acanthochromis_polyacanthus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.280	Ailuropoda_melanoleuca
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	88.671	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.671	Amphilophus_citrinellus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	88	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.173	Amphiprion_percula
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.688	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.688	Anabas_testudineus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	99	93.615	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.924	Anas_platyrhynchos
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.222	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	Anolis_carolinensis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	Aotus_nancymaae
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.276	Astatotilapia_calliptera
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.914	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.914	Astyanax_mexicanus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	99	70.134	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	Callithrix_jacchus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.280	Canis_familiaris
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	Canis_lupus_dingo
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.074	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	Carlito_syrichta
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.280	Cebus_capucinus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	Cercocebus_atys
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	Chlorocebus_sabaeus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.045	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.045	Chrysemys_picta_bellii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	77.949	ENSCING00000009372	-	100	77.949	Ciona_intestinalis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	99	78.447	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.588	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.588	Cricetulus_griseus_crigri
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.864	Cynoglossus_semilaevis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.864	Cyprinodon_variegatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.264	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.349	Danio_rerio
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.663	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.663	Dasypus_novemcinctus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	Dipodomys_ordii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	75.179	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSRNOG00000002818	Eftud2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSRNOG00000002818	Eftud2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.280	Equus_asinus_asinus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.177	Equus_caballus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.937	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.246	Esox_lucius
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	Felis_catus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.634	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.634	Ficedula_albicollis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	Fukomys_damarensis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.967	Fundulus_heteroclitus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.349	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.349	Gadus_morhua
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.531	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	Gallus_gallus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.967	Gambusia_affinis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.761	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.761	Gasterosteus_aculeatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.280	Gorilla_gorilla
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	92.173	Haplochromis_burtoni
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.177	Heterocephalus_glaber_female
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.177	Heterocephalus_glaber_male
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.947	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	Hippocampus_comes
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.761	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.761	Ictalurus_punctatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.512	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.512	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	96	99.679	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	Jaculus_jaculus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.555	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.555	Kryptolebias_marmoratus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	95	91.361	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.130	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.130	Latimeria_chalumnae
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.482	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.379	Lepisosteus_oculatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	Loxodonta_africana
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.280	Macaca_fascicularis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.280	Macaca_nemestrina
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.280	Mandrillus_leucophaeus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.482	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.482	Mastacembelus_armatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.276	Maylandia_zebra
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.536	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.536	Meleagris_gallopavo
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.588	Mesocricetus_auratus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.280	Microcebus_murinus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.691	ENSMOCG00000009039	-	100	99.691	Microtus_ochrogaster
ENSRNOG00000002818	Eftud2	92	80.674	ENSMOCG00000017653	-	90	81.124	Microtus_ochrogaster
ENSRNOG00000002818	Eftud2	88	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.971	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	Monodelphis_domestica
ENSRNOG00000002818	Eftud2	88	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.794	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.794	Mus_caroli
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.897	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.897	Mus_musculus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.794	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.794	Mus_pahari
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.794	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.794	Mus_spretus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	97	99.258	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.258	Mustela_putorius_furo
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.280	Myotis_lucifugus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	Nannospalax_galili
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	92.173	Neolamprologus_brichardi
ENSRNOG00000002818	Eftud2	97	97.450	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	Nomascus_leucogenys
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.856	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.062	Notamacropus_eugenii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.432	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.638	Ochotona_princeps
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	93	79.598	ENSODEG00000003385	-	100	79.598	Octodon_degus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.276	Oreochromis_niloticus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	Oryctolagus_cuniculus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.967	Oryzias_latipes
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.864	Oryzias_latipes_hni
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.682	Oryzias_latipes_hsok
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.016	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.016	Otolemur_garnettii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.383	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.383	Pan_paniscus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.280	Panthera_pardus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.280	Panthera_tigris_altaica
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.383	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.383	Pan_troglodytes
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.280	Papio_anubis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	93	96.692	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	Pelodiscus_sinensis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	84.346	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.346	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.794	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.794	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.971	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.971	Phascolarctos_cinereus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.967	Poecilia_formosa
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.967	Poecilia_latipinna
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.967	Poecilia_mexicana
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.840	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	Pongo_abelii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.959	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	Procavia_capensis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	Propithecus_coquereli
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.827	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.033	Pteropus_vampyrus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	92.173	Pundamilia_nyererei
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.070	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.070	Pygocentrus_nattereri
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.177	Rhinopithecus_bieti
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	Rhinopithecus_roxellana
ENSRNOG00000002818	Eftud2	97	33.797	YKL173W	SNU114	91	34.538	Saccharomyces_cerevisiae
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	96	99.145	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	99.145	Sarcophilus_harrisii
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.864	Scleropages_formosus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.658	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.658	Scophthalmus_maximus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.173	Seriola_dumerili
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.276	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	90.844	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	Sorex_araneus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.119	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.119	Sphenodon_punctatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.276	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.276	Stegastes_partitus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.074	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	Sus_scrofa
ENSRNOG00000002818	Eftud2	84	97.195	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.195	Taeniopygia_guttata
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.246	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.246	Takifugu_rubripes
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	86.769	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.769	Tetraodon_nigroviridis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.621	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	Tupaia_belangeri
ENSRNOG00000002818	Eftud2	94	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.254	Tursiops_truncatus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.152	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.152	Ursus_americanus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.280	Ursus_maritimus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.280	Vulpes_vulpes
ENSRNOG00000002818	Eftud2	96	94.984	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.756	Xenopus_tropicalis
ENSRNOG00000002818	Eftud2	81	93.367	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	Xiphophorus_couchianus
ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.967	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000398	mRNA splicing, via spliceosome	21873635.	IBA	Process
GO:0003674	molecular_function	-	ND	Function
GO:0003924	GTPase activity	21873635.	IBA	Function
GO:0005525	GTP binding	-	IEA	Function
GO:0005575	cellular_component	-	ND	Component
GO:0005634	nucleus	-	ISO	Component
GO:0005654	nucleoplasm	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	21873635.	IBA	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0015030	Cajal body	-	IEA	Component
GO:0015030	Cajal body	-	ISO	Component
GO:0016607	nuclear speck	-	IEA	Component
GO:0016607	nuclear speck	-	ISO	Component
GO:0030623	U5 snRNA binding	21873635.	IBA	Function
GO:0035690	cellular response to drug	24793618.	IEP	Process
GO:0042220	response to cocaine	20187946.	IEP	Process
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex	21873635.	IBA	Component
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex	-	ISO	Component
GO:0071007	U2-type catalytic step 2 spliceosome	21873635.	IBA	Component
GO:0071007	U2-type catalytic step 2 spliceosome	-	ISO	Component
GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome	-	ISO	Component
GO:1990904	ribonucleoprotein complex	21873635.	IBA	Component